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lunes, 11 de julio de 2011

Notación del genoma de la E. coli de los pepinos

Hoy he leído esta noticia en Público. El título es: La ciencia 2.0 mató a la bacteria 'E.Coli'
Leo la noticia y resulta que el título no se ajusta a la información. Lo único relevante del artículo es que los investigadores chinos que secuenciaron el genoma lo pusieron a disposición de la comunidad de investigadores. Lo que hicieron los investigadores españoles fue hacer la notación del genoma publicado. ¿Cómo se hace esto?. Bien, resulta que hay varios genomas ya publicados de E. coli y otras bacterias afines. Lo único que tienes que hacer es comparar las secuencias del genoma recien publicado con otros que llevan ya tiempo publicados y los genes que se encuentran en ellos se encuentran identificados. Si por ejemplo, una de tus secuencias es un 95% similar a una que ya está publicada y esa secuencia corresponde a un gen conocido, por ejemplo toxina Shiga, entonces lo que haces es decir, que la secuencia X de tu nuevo genoma corresponde con el gen toxina shiga. De ahí a decir que la ciencia 2.0 mató hay un gran trecho. Lo novedoso y noticiable es la rapidez con la que se ha hecho la notación, gracias al 2.0, eso si.

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