Vamos a trabajar con un gen bacteriano. El gen que codifica para la subunidad GyrA de la proteína gyrasa de Streptococcus pneumoniae.
La secuenciación de este gen se publicó en el siguiente artículo, del que soy coautor. Para acceder a la secuencia de este gen podemos estar en la base de datos Genbank y se accede con este identificador: AF053121.
Aquí podemos ver la secuencia de aminoácidos que codifica este gen:
MQDKNLVNVNLTKEMKASFIDYAMSVIVARALPDVRDGLKPVHRRILYGMNELGVTPDKP
HKKSARITGDVMGKYHPHGDSSIYEAMVRMAQWWSYRYMLVDGHGNFGSMDGDSAAAQRY
TEARMSKIALEMLRDINKNTVDFVDNYDANEREPLVLPARFPNLLVNGATGIAVGMATNI
PPHNLGETIDAVKLVMDNPEVTTKDLMEVLPGPDFPTGALVMGKSGIHKAYETGKGSIVL
RSRTEIETTKTGRERIVVTEFPYMVNKTKVHEHIVRLVQEKRIEGITAVRDESNREGVRF
VIEVKRDASANVILNNLFKMTQMQTNFGFNMLAIQNGIPKILSLRQILDAYIEHQKEVVV
RRTRFDKEKAEARAHILEGLLIALDHIDEVIRIIRASETDAEAQAELMSKFKLSERQSQA
ILDMRLRRLTGLERDKIQSEYDDLLALIADLADILAKPERVSQIIKDELDEVKRKFSDKR
RTELMVGQVLSLEDEDLIEESDVLITLSNRGYIKRLDQDEFTAQKRGGRGVQGTGVEDDD
FVRELVSTSTHDHLLFFTNKGRVYRLKGYEIPEYGRTAKGLPVVNLLKLDEDESIQTVIN
VESDRSDDAYLFFTTRHVLLKRTSVKEFANIRQNGLKALNLKDEDELINVLLAEGDMDII
IGTKFGYAVRFNQSAVRGMSRIATGVKGVNLREGDTVVGASLITDQDEVLIITEKGYGKR
TVATEYPTKGRGGKGMQTAKITEKNGLLAGLMTVQGDEDLMIITDTGVMIRTNLANISQT
GRATMGVKVMRLDQDAQIVTFTTVAVAEKEEVGTENETEGEA
y también la secuencia nucleotídica:
1 ttttaaaaaa ctttgtcacg aatatgcctt atagttctcg atgtaaacgt tttagtggtt 61 tagaggctga aatagacggg aatttatggt ataatgttgt tacttactaa ttgtgaaatg 121 aggcatttat taatgcagga taaaaattta gtgaatgtca atctgacaaa ggagatgaag 181 gcaagtttta tcgactacgc catgagtgtt atcgtagcgc gagctcttcc tgatgttcga 241 gatggcttaa aacctgttca ccgtcgcatt ctctacggaa tgaatgaatt gggtgtgacc 301 ccagacaaac cccataaaaa atctgctcgt attacagggg atgtcatggg taaataccac 361 ccacacgggg attcctctat ttatgaagcc atggtccgta tggctcaatg gtggagctac 421 cgttacatgc ttgtagatgg tcatgggaat tttggttcca tggatggaga tagtgctgcc 481 gctcaacgtt ataccgaggc acgtatgagc aagattgctc tggaaatgct tcgtgatatc 541 aacaaaaata cagttgattt cgttgataac tatgatgcca atgaacggga acccttggtc 601 ttgccagcgc gttttccaaa ccttttggtt aatggagcaa ctggtatcgc ggttgggatg 661 gcaaccaata ttccacctca taatctgggt gaaaccattg atgcagtgaa gttggtcatg 721 gataatcctg aagtgactac caaggacttg atggaagtct tgcctggacc agattttcca 781 actggtgctc ttgtcatggg gaaatcaggt atccataagg cttatgaaac aggtaaaggt 841 tcgattgtcc tacgttctcg tacagagatt gaaacgacta agactggtcg tgagcgtatc 901 gttgtaacag aatttcctta catggtcaat aaaaccaagg tgcatgagca tattgttcgc 961 ttggttcagg aaaaacgcat tgagggtatc acagcagtac gtgatgagtc aaaccgtgaa 1021 ggtgttcgat ttgttattga agtcaagcgc gacgcctcag ccaatgttat tctcaataac 1081 ctcttcaaaa tgacccaaat gcaaaccaat tttggtttca atatgctcgc tatccaaaat 1141 ggtataccga aaattttgtc tcttcgtcag attttggatg cttatattga gcaccaaaaa 1201 gaagtggttg ttcgtcgtac acgttttgat aaggaaaaag cggaagcgcg cgctcatatc 1261 ttagaaggtc tcttgattgc gctagaccat atcgacgaag tgattcgtat catccgtgct 1321 agtgaaacgg atgcggaagc tcaagctgag ttgatgagca agtttaagct ttctgaacgt 1381 caaagtcaag ctatccttga tatgcgtctt cgccgtttga caggtttgga acgcgataag 1441 attcaatctg agtatgatga cctcttggct ctgattgcgg atttagcaga tattcttgct 1501 aagcctgaac gtgtttctca aattatcaaa gacgaattgg atgaagttaa acgtaaattt 1561 tctgataaac gccgtacaga gttgatggtt ggacaggtct tgagtctcga ggatgaggac 1621 ttgattgaag aatcggatgt cttgattacc ctttctaaca gaggctacat taagcgtttg 1681 gatcaggacg agttcactgc tcaaaaacgt gggggtcgtg gtgtccaagg aacgggagta 1741 gaagatgatg actttgttcg tgagttagtg tcaactagta cccatgatca tctgctcttc 1801 ttcacaaaca agggacgtgt ctatcgtctt aaaggttatg aaattcctga gtatggtcgg 1861 actgccaaag ggctaccagt agtcaatctc ttgaaattgg atgaagacga aagtattcag 1921 acggttatca atgttgagtc tgatcgcagt gatgatgctt atctcttctt tacaacccgt 1981 cacgtattgt tgaagagaac cagtgttaag gagtttgcca atattcgtca aaatggtctc 2041 aaagcgctga atttaaagga tgaagatgag ttaatcaatg tcttgttggc agaaggagat 2101 atggatatta tcattggtac caagtttggt tatgcagttc gctttaatca atcagccgtt 2161 cgtggtatga gccgtatcgc cactggtgtg aaaggtgtta accttcgtga aggagacaca 2221 gttgttggtg ccagcttgat tactgatcaa gatgaggttc ttattatcac agaaaaagga 2281 tatggtaagc gtacagtcgc tactgaatac ccaacaaaag gtcgtggtgg taagggaatg 2341 cagacagcta aaattaccga aaaaaatggc ttgctggccg gtcttatgac tgttcaaggg 2401 gatgaggatt tgatgattat cactgataca ggtgtcatga ttcgaaccaa tcttgccaat 2461 atttcacaaa caggacgtgc aactatggga gttaaagtaa tgcgcctgga tcaagatgct 2521 cagatagtga ctttcacaac ggttgcggtg gcagaaaaag aagaagttgg gacagaaaac 2581 gaaacagaag gtgaagcata atgtctcaaa aaaataataa aaagaaaaac aagcgaaaaa 2641 atctgctgac aaatatccta gcaggatttc tgatattact gtcac
La proteína que codifica este gen es la GyrA, una subunidad de la enzima gyrasa. Esta enzima lo que hace es enrrollar el ADN cuando este está relajado.
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