jueves, 22 de noviembre de 2018

Materia fecal en los ríos significa brotes de diarrea

En estos momentos hay una alerta por E. coli 0157 en los EEUU en la variedad romana de lechugas ¿El problema? que se riegan con aguas contaminadas de heces de ganado y claro, como la lechuga no se cocina cuando tomamos estas ensaladas nos provocan una diarrea de las fuertes.
Brote de E. coli 0157 en los EEUU ha obligado a retirar la lechuga variedad romana de los supermercados ¿Cuál ha sido el problema? al regar la lechuga con agua contaminada de heces de vacas ahora esta hortaliza nos puede causar diarreas con hemorragia
Estos brotes crean alarma y generan pérdidas porque obligan a retirar toooda la lechuga de los supermercados de un país. En el diario El País, escriben el típico artículo que no te informa de nada.

Un virus convirtió a la inocente E. coli en un patógeno que causa diarrea hemorrágica

La bacteria E. coli es una bacteria que normalmente vive sin causar problemas en los intestinos de mamíferos de sangre caliente. Algunas de estas bacterias, como la variedad 0157.H7, han sido colonizadas por virus que les confieren la capacidad de provocar fuertes diarreas ¿Por qué? porque eso aumenta la transmisión de E. coli entre personas. 
 
Los genes del virus, en el diagrama representados por flechas, se insertan en el cromosoma de E. coli. A partir de ese momento E. coli y el virus son una sola entidad genética. E. coli ya no volverá a ser la inocente bacteria comensal que conocemos para convertirse en un patógeno que causa diarreas hemorrágicas

E. coli, cuando no está colonizada por el virus, es una bacteria que vive comensal en los humanos, vacas. Aunque la eliminamos con las heces como es de rápido crecimiento siempre habrá E. coli vivendo en nuestros intestinos. Estas E. coli portadoras de virus en su interior, como la 0157, tienen un comportamiento más vírico que bacteriano. Lo que necesita el virus es transmitirse, transmitirse y transmitirse entre hospedadores. Por ese motivo, entre los genes del virus están aquellos que hacen que los intestinos empiecen a secretar agua y nos obligue a estar defecando todo el rato. El virus de E. coli consigue que nos convirtamos en un aspersor, o en un espray de bacterias. Cagamos constantemente, nos manchamos e infectamos todo lo que está a nuestro alrededor. Si infectamos a otras personas o a otros animales el virus habrá triunfado.


El agua contaminada matará cada vez a más gente pobre

Esta lógica vírica funciona porque existe superpoblación de humanos y vacas. Si la E. coli 0157 no tuviese fácil su transmisión esta bacteria cada vez sería menos frecuente. El problema es que, viviendo en los márgenes de los cursos de agua, cada vez hay más humanos y más ganadería. A medida que cada vez hay más humanos y los cursos de agua son más escasos este problema será cada vez más frecuente. 
El río Yamuma en Delhi, India, contiene un 100% de materia fecal. Fuente
Cuando la industria detecte esta bacteria en sus productos estará tentada de derivar estos productos a países en donde no existan controles y pueda ser vendida sin que se les eche a ellos la culpa de estar propagando un brote de E. coli 0157. Quizás se pueda tratar en el futuro con fagos anti-E. coli 0157 para así prevenir la dispersión de estas bacterias patógenas, pero claro, este tipo de tratamientos sólo estarán disponibles en países ricos y para establecimientos caros como, por ejemplo, la cadena de productos orgánicos Whole Foods de los Estados Unidos.
Las Escherichia coli patógenas causan mucha alarma en los países ricos acostumbrados a no tener problemas con las bacterias. Por ese motivo, deberían llamarse Histeria coli

miércoles, 21 de noviembre de 2018

Cómo la secuenciación masiva ha cambiado a la ciencia

Mi amiga Nuria Rodríguez ha grabado a científicos de Centro de Biología Molecular de Madrid sus opiniones sobre cómo la secuenciación masiva de ADN ha cambiado la ciencia

lunes, 19 de noviembre de 2018

Micropía

¿Se puede crear un relato museístico sobre las bacterias? en el Zoológico Artis de Amsterdam lo han hecho. Entre sus instalaciones se encuentra Micropía: una exhibición de microbios
En Holanda se sienten orgullosos de Leuwenhoek, la primera persona en descubrir para la humanidad el mundo de lo micro.

miércoles, 14 de noviembre de 2018

No aceptamos pacientes que no vacunen a sus hijos


“Nuestra clínica ya no atenderá a pacientes que no vacunen a sus hijos. Vacunaremos a aquellos que quieran comenzar el proceso, pero si se niegan a seguir con nuestra política, serán dados de alta a partir del 1 de Enero de 2019. Podemos proporcionar un volante de autorización cuando encuentren un nuevo médico. Debido a la abrumadora y meticulosa investigación científica y los descubrimientos basados en ella, hay una gran cantidad de pruebas que apoyan el impacto positivo de las vacunas en los niños. El consejo profesional del doctor Azmeh, junto con la CDC y la OMS, es desanimar a cualquier padre que no quiera vacunar a sus hijos, algo que sin duda les ayudará. Si tienen alguna duda o pregunta sobre esta política, por favor pregunten a nuestros empleados.”

lunes, 5 de noviembre de 2018

Los científicos son raros, y muchas veces, malas personas

He trabajado de y con científicos desde hace más de 20 años. Por eso, desde mi experiencia, puedo decir que no he conocido a uno que estuviera bien de la cabeza. He conocido muuucha gente ruín y mezquina. Personas que viven en un universo paralelo. Los laboratorios son lugares cerrados donde conviven egos estratosféricos con pocas habilidades sociales. Actualmente evito, en la medida de lo posible, relacionarme con científicos porque siempre me han dejado mal sabor de boca.
La ciencia se realiza en laboratorios en donde la explotación y los comportamientos ruines son la norma. Ya hablamos en este blog del desengaño de la ciencia. Una actividad que muchas veces raya las prácticas sectarias.

Las instituciones educativas no deben permitir (y en las españolas lo permiten) malas prácticas

En la universidad española o en el CSIC, Centro Superior de Investigaciones Científicas, se han dado casos de investigadores hallados culpables de fraude que mantienen su plaza de fucionarios.
González, tras ser despedida del CNIC, mantiene una plaza fija como investigadora de la agencia estatal CSIC. Fuente
El afamado López Otín  ha sido encontrado culpable de fraude científico. Su problema usar una y otra vez el mismo resultado en distintos trabajos científicos. Por ese motivo, le han retirado 8 publicaciones científicas. En algunos medios se ha atrevido a hacer afirmaciones lamarkistas, algo impropio de su trayectoria científica. Os voy a contar una anécdota que le ocurrió a un amigo mío. Mi amigo era un científico junior. Tuvo una muy buena idea. Se la planteó a López Otín y este se interesó y le pidió a mi amigo que le mandase el proyecto y que fuese a dar una charla a su laboratorio. En principio para contratarlo o para hacer una colaboración juntos. Al poco tiempo le dice que no está interesado, que no le ve futuro al proyecto. Cual es la sorpresa su sorpresa cuando unos meses después lee que López Otín ha pedido, y se lo han dado, un proyecto  igual que el que había redactado él. Ahora está saliendo en los medios cual rockstar a partir de este proyecto

A pesar de que le hayan retirado 8 artículos por fraude no va a perder su plaza en la universidad. También es grave que 50 de los mejores científicos españoles le hayan apoyado públicamente. Estos 50 científicos son los que siempre salen en prensa pidiendo más fondos públicos pero nunca, nunca he visto que pidan más derechos sociales para las personas que trabajan en ciencia. No les preocupan los becarios en precario, les preocupa no tener fondos para poder competir.
Vigor capilar y honestidad académica no van de la mano en el caso de este "afamado" investigador. Fuente
 You are not the first victim of this guy

Esto otro me ha ocurrido a mi. Cuando acabé mi tesis doctoral en el año 2000 me fui a la Universidad de Míchigan invitado por Vojo Deretic a dar una charla a su laboratorio. Me contrató y empecé a trabajar con el, unos meses antes de la lectura de tesis. Al poco tiempo de empezar a trabajar en Míchigan con él,  me dicen que el laboratorio entero se muda a Nuevo Méjico. Me pregunté porqué no me habían dicho esto antes, pues me hubiese esperado unos meses para acabar leer la tesis y ya empezar en el laboratorio en su nuevo emplazamiento. Me hicieron firmar una carta en apoyo a Vojo Deretic. Eso me pareció raro. En un principio, este investigador me había prometido una línea de investigación propia. Es lo que ocurre cuando empiezas una estancia postdoctoral. De repente, decide que no, que no voy a tener una investigación propia y como se clonar genes pues me pone a clonar genes para las demás lineas del laboratorio. "Es mi prerrogativa como jefe" me dice a modo de explicación. Me fui a hablar con el Director del Departamento de Patogénesis Microbiana de la Escuela de Medicina, que en aquel entonces era Michael Imperiale. Cuando le conté mi caso me dijo: "You are not the first victim of this guy". Entonces me contó la verdadera historia de porqué se iba Vojo de Míchigan: lo echaban por haber amenazado de palizas e incluso de muerte a cuatro postdocs que habían estado en su laboratorio antes de mi. La Universidad de Míchigan es una institución educativa y no puede permitir este tipo de prácticas.

Para saber más:

Disparates en los exámenes

Entiendes lo que es la labor docente cuando un alumno de 2º semestre contesta esto en un examen:

PREGUNTA: ¿Qué diferencias existen entre el ADN y el ARN en cuestión de bases nitrogenadas y azúcares? ¿Explican estas diferencias la estabilidad del ADN como molécula soporte de la herencia en la mayor parte de los seres vivos?

Respuesta que no dice nada: En este contexto las diferencias de bases y azúcares no son suficientes para explicar la estabilidad del ADN en la herencia pero si se sabe que esta lleva una base fundamental de todo ser.

PREGUNTA: Pedro Leiva notó mejoría de sus fiebres tercianas (malaria) cuando se bañó en un riachuelo de Malacatos (Loja) ¿Cómo aplicó el método científico para lograr su descubrimiento de la quina?

Respuestas:
 Otras más (aquí se ha logrado un record: seis verbos en una frase)

PREGUNTA: ¿Qué fue antes el huevo o la gallina?
Respuesta: Primero fue el huevo; porque la gallina tuvo un ancestro que fue quien puso el huevo. Este huevo.

PREGUNTA: ¿Qué podríamos hacer si la concentración de la proteína problema que queremos cuantificar es más concentrada que las concentraciones que hemos utilizado de BSA para realizar la curva de calibrado?

La respuesta correcta sería: diluír la muestra

Respuesta "Cantinflas molecular": Se hace una recombinación que establece la diferencia de las características de la solución