miércoles, 20 de octubre de 2021

Gran orgía antivacuna

Con respecto a las vacunas, personalmente, creo que deberían de ser obligatorias. Lo mismo que nadie discute que el cinturón de seguridad en el carro es obligatorio y que si no lo llevas te multan, con las vacunas lo mismo.

Mientras no sean obligatorias seguiremos disfrutando de ver como la selección natural hace de las suyas


domingo, 17 de octubre de 2021

Cleptoplastia: cuando robar cloroplastos aumenta tu fitness reproductiva

Las babosas marinas o nudibranquios pueden robar cloroplastos a las algas para incorporarlos a su cuerpo. Fuente

Las babosas marinas que roban la maquinaria de fotosíntesis de las algas que comen la usan para impulsar sus propios esfuerzos de reproducción, es decir, las babosas retienen los cloroplastos para aumentar su eficiencia reproductiva. Los cloroplastos producen ácidos grasos poliinsaturados, es decir, sustancias que mejoran la capacidad para producir más huevos lo que aumenta la fitness reproductiva de las babosas que portan cloroplastos

El proceso de incorporar los cloroplastos a sus cuerpos solo lo logran extrayendo los plastos de las algas, es decir, las babosas tienen que "robarlos" porque no son capaces de lograr que puedan reproducirse dentro de la propia babosa. Roban cloroplastos a las algas, pero no consiguen que en su interior esos cloroplastos funcionen como replicones extracromosómicos

Referencia: Proceedings of the Royal Society B: Photosynthesis from stolen chloroplasts can support sea slug reproductive fitness

jueves, 14 de octubre de 2021

Replicones extracromosómicos

Se denomina replicón a cada unidad de replicación del ADN o ARN que contiene todos los elementos requeridos para regular este su replicación, es decir, partiendo de una molécula progenitora obtener dos moléculas hijas, ambas con el 50% del genoma del progenitor

Las bacterias pueden contener elementos extracromosómicos, como los plásmidos y bacteriófagos, siendo éstos independientes del cromosoma bacteriano y tienen la capacidad de transmitirse de una célula a otra

Replicación del plásmido del mecanismo del círculo rodante

Este sistema de replicación le permite al plásmido transmitirse de una bacteria a otra mediante la conjugación bacteriana

Los bacteriófagos son también elementos que se replican al margen del genoma de la bacteria. La transducción es un proceso mediante el cual el ADN es transferido desde una bacteria a otra mediante la acción de un virus. 

Ilustración del ciclo lítico y ciclo lisogénico. Fuente

¿Es el ADN de las mitocondrias un replicón extracromosómico?

Por supuesto. Las mitocondrias poseen su propio ADN extracromosómico, lo mismo que los cloroplastos de las plantas. Usualmente, hay muchas copias de ADN en una sola mitocondria o cloroplasto.

Crédito de la imagen: "ADN mitocondrial frente a ADN nuclear", del Museo de Paleontología de la Universidad de California (CC BY-SA 3.0).

En el diagrama anterior, el ADN nuclear de una persona es una "mezcla" de segmentos heredados de muchos ancestros diferentes, mientras que el ADN mitocondrial de una persona es heredado a través de una sola línea ininterrumpida antepasados femeninos

Referencia: 

Plasmid replication initiator RepB forms an hexamer reminiscent of ring helicases and has mobile nuclease domains. D Roeland Boer, Jose A Ruíz-Masó, José R López-Blanco, Alexander G Blanco, Mireia Vives-Llàcer, Pablo Chacón, Isabel Usón, F Xavier Gomis-Rüth, Manuel Espinosa, Oscar Llorca, Gloria del Solar and Miquel Coll. The EMBO Journal advance online publication, 14 May 2009; doi:10.1038/emboj.2009.125

martes, 28 de septiembre de 2021

Porphyromonas gingivalis, el Alzheimer y las gingipainas

El patógeno intracelular Porphyromonas gingivalis y la enfermedad de Alzheimer están relacionados. El grupo de Jan Potempa de la Universidad Kentucky en Louiville han detectado enzimas tóxicas llamadas gingipainas en el cerebro de pacientes con Alzheimer. Además, también encontraron esas gingipainas en cerebros de personas fallecidas que no fueron diagnosticadas con Alzheimer. Este punto es importantes por que el patógeno Porphyromonas gingivalis y el Alzheimer se habían relacionado, si, pero no se sabía si la enfermedad de las encías provoca Alzheimer o si es la demencia la que conduce a un cuidado bucal deficiente. Ahora, el hecho de encontrar gingipainas en personas que nunca fueron diagnosticadas de Alzheimer nos indica que esto es previo a la enfermedad, que se podría haber desarrollado si hubiesen vivido más tiempo.

Que tengas P gingivalis en la boca está asociada con el Alzheimer. (Foto: Wikimedia)

El Alzheimer no está relacionado con el virus del herpes

El grupo de Zhandong Liu del Baylor College Medicine publicaron en la revista Neuron, analizaron secuencias del virus a gran escala y el resultado es que no existe vínculo entre la abundancia de ADN o ARN viral del herpes y la probabilidad de padecer la enfermedad de Alzheimer en la cohorte de los tejidos cerebrales post-morten con Alzheimer que fue analizado en 2018. En este estudio se observó que los niveles del herpesvirus humano 6A (HHV-6A) y del herpesvirus humano 7 (HHV-7) en los tejidos cerebrales 'postmortem' de más de 1.000 pacientes con enfermedad de Alzheimer, comparados con los de cerebros de personas que no habían desarrollado la infermedad. Al reanalizar los datos vieron que no hay vínculo entre la abundancia de ADN o ARN viral del herpes y la probabilidad de padecer alzhéimer

lunes, 27 de septiembre de 2021

Reactor para formar biofilms desarrollado por el CDC

Desde la época de Koch, se ha investigado a las bacterias y microorganismos principalmente en su forma planctónica, es decir, en medio líquido. Sin embargo,  aunque se ha postulado que el 99% de las bacterias en un ecosistema existen como biopelículas, la investigación de microorganismos formadores de biopelículas puede considerarse un área nueva debido a la complejidad de estas muestras.

Un biofilm, o también llamado biopelícula, se define como un mosaico tridimensional en el que los microorganismos coexisten, se acumulan y se organizan en medio de una matriz de exopolisacáridos. Estas formaciones bacterianas son las principales causas de morbilidad y mortalidad en los pacientes, alcanzando aproximadamente el 5% al ​​15%. Es importante señalar que las infecciones bacterianas han sido el foco de atención de diferentes terapias; de hecho, el uso de antibióticos de manera racional y adecuada puede contribuir a la reducción de la morbilidad y mortalidad en los pacientes.

Por ese motivo, debemos de estudiar cómo afectan los antimicrobianos no solo en bacterias planctónicas, sino también en estas estructuras sésiles tridimensionales. Para ello, el reactor de cultivo continuo que se utiliza para estudiar biofilms es el que ha sido desarrollado por el CDC. Este reactor se ha convertido en el estandar para trabajar con biofilms en los laboratorios. 

Cada reactor tiene 8 racks y cada uno de ellos tiene espacio para tres fichas. Los biofilms crecerán, si  es que lo hacen, sobre esas fichas. El volumen del medio de cultivo líquido que cubre las fichas es de 350 mL. 

Se puede comprar en FisherSci por 1201.90$ producidos por  Biosurface Technologies Corp, que tienen su sede en Bozeman, Montana, EEUU. Esta empresa tiene fichas ("coupons" en inglés) de distintos materiales: teflón a 8$, polietilino 8$, polipropileno 8$, acero inoxidable 7.2$, hidroxiapatito 12$...)

Estas fichas se introducen en un vaso de un litro y se cubren con 350 mL de medio de cultivo continuo. La velocidad a la que este medio se introduce y elimina del vaso está regulada por una bomba peristáltica.


En la Universidad Estatal de Montana tienen un Centro de Engeniería de Biofilms, y tienen una serie de videos sobre como se comporta esta tecnología:
Single Tube Method Video. Fuente Biofilm First

Se necesita además:

Estufa de 37ºC
Una bomba peristáltica
Juego de tubos para la bomba peristáltica
Un baño de sonicación
 
Soporte universal con abrazadera

Tubos Falcon 50 ml


viernes, 24 de septiembre de 2021

El Experimento evolutivo más largo del Mundo

El experimento de Richard Linski creciendo Escherichia coli día tras día ha sido un importante escuela para los microbiólogos interesados en evolución. Ahora el canal Veritasium nos lo presenta como documental en castellano: 

El Experimento evolutivo más largo del Mundo. Fuente: Veritasium en español

miércoles, 22 de septiembre de 2021

Lazareto de Guayaquil

 Una amiga el otro día, hablando sobre las cárceles del Ecuador dijo que lo mejor que se podría hacer con ellas era bombardearlas. El fin de semana después estuve en un cumpleaños en Quito y pregunté ¿Qué se podría hacer con las cárceles en Ecuador? y menos un profesor de derecho de la Universidad San Francisco y su pareja, el resto opinaban lo mismo que mi amiga. 

En ecuador en 1834,  el temor frente a la lepra sumado a la ausencia de conocimientos para enfrentarla hizo que unos ciudadanos solicitasen al presidente Vicente Rocafuerte que aquellos que padecían de lepra fueran inmolados para evitar el contagio. El presidente Rocafuerte rechazó evidentemente una medida tan inhumana y ordenó la construcción, en los terrenos donde funcionaba la Facultad de Medicina en la ciudad de Guayaquil, de un lazareto. Los contagiados de lepra en todo el mundo estuvieron bajo la advocación de San Lázaro y de la orden religiosa de igual nombre. Este lazareto, construido en madera fue quemado en 1945 en medio de gran expectación popular que disfrutó viendo como salían murciélagos y ratas de aquel edificio. 

El Lazareto de Boyacá se fundó en 1872 y se refundó en 1890 como ‘Alejo Lascano’. Guayaquil, 1900-1910.

En la decisión del presidente Rocafuerte influyeron decisivamente las opiniones de Abel Brandín, el cual abogaba por que quienes padecían lepra recibiesen un tratamiento “decente y humanitario”. 

Los lazaretos normalmente se diseñaban en islas cercanas a los puertos. Eran instalaciones en las que internaban a marineros y pasajeros, o animales que presentaban síntomas de enfermedades infecciosas.  La primera cuarentena fue practicada en el puerto de Marsella en 1383. 

Bandera amarilla, señal náutica que se usaba para señalar que se lleva enfermos infecciosos. Hoy en día indica lo contrario: un barco que se declara libre de enfermedad de cuarentena, y solicita el abordaje e inspección por parte de las autoridades portuarias. Fuente


lunes, 13 de septiembre de 2021

¿Qué podría hacer Guayaquil para combatir la sindemia del Sars-CoV-2?

 Covid-19 en Guayaquil: ¿Nos encontramos frente a una sindemia?


Covid 19 no es una pandemia

Muy interesante el concepto de sindemia. Abordar el COVID-19 significa abordar la hipertensión, la obesidad, la diabetes, las enfermedades cardiovasculares y respiratorias crónicas y el cáncer. Prestar mayor atención a las ENT no es una agenda solo para las naciones más ricas. Las ENT también son una causa desatendida de mala salud en los países más pobres. La consecuencia más importante de ver a COVID-19 como una sindemia es subrayar sus orígenes sociales. La vulnerabilidad de los ciudadanos mayores; Comunidades étnicas negras, asiáticas y minoritarias; y los trabajadores clave a quienes comúnmente se les paga mal y con menos protecciones sociales apuntan a una verdad hasta ahora apenas reconocida, a saber, que no importa cuán efectivo sea un tratamiento o una vacuna protectora, la búsqueda de una solución puramente biomédica para COVID-19 fracasará. A menos que los gobiernos diseñen políticas y programas para revertir las profundas disparidades, nuestras sociedades nunca estarán verdaderamente seguras contra el COVID-19. Como escribieron Singer y sus colegas en 2017, "Un enfoque sindemico proporciona una orientación muy diferente a la medicina clínica y la salud pública al mostrar cómo un enfoque integrado para comprender y tratar enfermedades puede ser mucho más exitoso que simplemente controlar la enfermedad epidémica o tratar a pacientes individuales".

¿Pueden las supermanzanas proteger al guasmo de una pandemia?

La pandemia afectó de manera distinta a Guayaquil que a Quito ¿Sería posible que cambiando el urbanismo cambiásemos los efectos del Covid-19 en la población?

¿Pueden las supermanzanas ser una solución para el sur de Guayaquil?

https://theconversation.com/el-caso-de-barcelona-demuestra-que-la-conquista-del-urbanismo-verde-no-es-facil-pero-sera-inevitable-166439

https://theconversation.com/la-historia-de-la-humanidad-es-una-sucesion-de-pandemias-pero-no-aprendemos-138172

Voces contrarias a las supermanzanas

¿Puede el concepto de ciudad de los 15 min ayudar al Guasmo?

https://theconversation.com/la-ciudad-de-los-15-minutos-el-comercio-de-barrio-y-la-libertad-de-los-consumidores-150224

Barrios frente a ciudadelas ¿Cuál es el mejor desarrollo?

Jane Jacobs defiende en su libro "Muerte y vida de las grandes ciudades" la abolición de los reglamentos de ordenación territorial y el restablecimiento de mercados libres de tierra, lo que daría como resultado barrios densos y de uso mixto 

https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S014067361730003X

https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(20)32000-6/fulltext

https://www.bbc.com/mundo/noticias-54543375

¿Cambiar la dieta puede ayudarnos en esta pandemia?

Comprar en la veci ¿Es más efectivo frente al Covid-19 que comprar en grandes superficies?

https://www.avocesdecarabanchel.es/carabanchel/campana-compra-seguro-compra-tu-barrio-llega-pequeno-comercio

Terraceo y parras, una solución para comer en la calle

https://www.redaccionmedica.com/secciones/sanidad-hoy/covid-contagio-mascarilla-bar-restaurante-cerrado--5180

Alimentos, el riesgo oculto frente a la Covid-19

Mejorar el aire para luchar contra la pandemia

Referencia a Leonardo da Vinci https://www.bbc.com/mundo/noticias-48050229

Calidad de aire y coronavirus

https://theconversation.com/lo-que-sabemos-y-lo-que-no-sobre-la-relacion-entre-la-calidad-del-aire-y-el-coronavirus-138629

La bicicleta en tiempos del Covid-19

¿Qué es el R0 y como viajar en bici es mejor que en autobús urbano?

https://www.paho.org/es/noticias/18-5-2020-tiempos-covid-19-uso-bicicleta-es-imperativo-para-mantenernos-sanos-saludables

https://blogs.worldbank.org/es/voces/el-coronavirus-puede-dar-paso-a-ciudades-orientadas-a-peatones-y-ciclistas