miércoles, 21 de junio de 2017

NO a los jabones antibacterianos


Traducción: Una gotita de moco de estornudo puede contener  200.000.000 de gérmenes. El jabón antibacteriano, con triclosán, mata el 99.99% de los gérmenes. El personaje calcula el 0.01% de 200 millones y son 2 millones de bacterias. Bacterias que ya presentan cierta resistencia al jabón antimicrobiano, por cierto.

Hasta Microsiervos, un blog dedicado a la tecnología, se hace eco de este problema. Sobre 200 científicos han firmado un manifiesto pidiendo que se eliminen los jabones antibacterianos. ¿Qué se recomienda? agua y jabón de toda la vida.

domingo, 18 de junio de 2017

Innovar asegura la demanda

"Es preciso innovar y renovarse, porque el mecanismo del mercado se basa en la obsolescencia programada indispensable para asegurar esa repetición que asegure la demanda" Gustavo Dessal

Este concepto ya lo había intuido el Príncipe de Lampedusa, autor de El Gatopardo: "Si queremos que todo quede como está es preciso que cambie todo"
 La innovación es puro gatopardismo.

Gilles Deleuze y Guattari en su libro Mil mesetas tienen un capítulo dedicado a la repetición llamado "Il ritornello". Ambos filósofos analizan un experimento proveniente del campo de la ecología. Los pájaros respetan el territorio asociado a un canto complejo. Lo que hicieron los investigadores fue grabar el canto de un macho de determinado pájaro y en el laboratorio hicieron que su trino fuese musicalmente más complejo. Cuando dejaron un altavoz en el bosque con ese canto pudieron observar que ningún macho se atrevía a penetrar en el espacio que ese canto delimitaba. Las conclusiones son dos: que hay que repetir constantemente el canto para defender el territorio, cosa que las multinacionales saben muy bien al dedicar parte de sus beneficios a reproducir su marca y su logo en todas partes y la segunda conclusión: que un canto complejo desanimaba a potenciales competidores y los impulsaba a hacer su canto también más complejo.

Esa complejidad que desanima y que obliga a superarla está inscrita también en el concepto "innovación". Si yo innovo soy mejor que tu. Si esta técnica o esta tecnología es más innovadora significa que tu te has convertido en obsoleto.

La innovación, con su capacidad para asegurar la obsolescencia y por ende la renovación que garantiza que el mercado se mantenga, se ha convertido en un valor en si misma. Hace unos días salía la noticia que Tesla, la fábrica de coches eléctricos, superaba en valor a BMW. Lo curioso es que Tesla tiene pérdidas y problemas de producción, pero eso da igual, en bolsa ha superado a BMW.

Lo que Tesla vende es futuro, los coches eléctricos son futuro y los otros no. Vende crecimiento, no beneficios. Vende el que ha hecho que marcas de lujo consolidadas tengan que invertir en innovación si quieren estar en la pelea. Que una computadora o un teléfono móvil a los tres años esté obsoleto se ha convertido en la garantía de estabilidad "Si queremos que todo quede como está es preciso que cambie todo". Por ese motivo las bolsas y el capital especulativo bendicen todo lo que sea innovación.

Por todo esto, en las convocatorias de fondos de investigación la palabra clave no es conocimiento es INNOVACIÓN. 

NUESTRA BOCA, ALOJAMIENTO DE NUEVOS HUÉSPEDES


Entrada realizada por Vanessa Bastidas, Valeria Carrera y Alejandra Marchán, estudiantes de Medicina de la UDLA, Quito.


LOS AZÚCARES DAÑAN NUESTROS DIENTES

Los dulces son una tentación a la que muy pocos se resisten. Su variedad de colores y formas atraen tanto a niños como adultos, pero ¿conocemos el daño que estos pueden ocasionar a nuestra boca? La industria alimenticia se ha encargado de hipnotizarnos al momento de comprar azúcares, muchas empresas nos distraen con una buena publicidad y nos olvidamos que tras consumirlos podemos llegar a desarrollar muchas enfermedades. El consumo de azúcares en la actualidad es común, se los consigue en cualquier lugar y a un precio relativamente cómodo. El exceso de azúcares es muy perjudicial para nuestros dientes, provocan daños terribles desde dolor hasta la pérdida de estos. Muchos hemos notado que en generaciones anteriores como la de nuestros abuelos se usaban pocas medidas para reparar los dientes y esto se comprueba por el uso de dentaduras postizas. En la actualidad con las investigaciones y nueva tecnología se ha logrado conservar y reparar los dientes pero es importante conocer qué medidas se deben usar para conservarlos de mejor manera.
¡Un autobús hecho de caramelos! el final del viaje son las caries
PEQUEÑOS HOYUELOS EN NUESTROS DIENTES, HOGAR DE BACTERIAS

Todas las personas sin importar la edad no nos damos cuenta de los daños que dentro de nuestra boca pueden estar ocurriendo. Solo nos fijamos en tener una linda sonrisa para mostrar con nuestros dientes anteriores pero no sabemos qué pasa con los demás.

Sabían por qué llegan a formarse esos hoyuelos negros en nuestros dientes? Quizá pienses me comí algo que estuvo entintado, pues no es así; es porque una famosa bacteria está empezando a hacer su hogar en tus dientes.

CONOCIENDO A LA BACTERIA QUE CAUSA MIS CARIES

Sabían que nosotros somos los culpables de que las bacterias crezcan en nuestra boca? Pues sí, así es, sencillamente por dos características principales, por ser golosos y sucios es decir al no tener una buena higiene bucal y al consumir alimentos azucarados propiciamos a la formación de un ambiente adecuado donde se producirá placas dañinas y sarro que son una especie de pasta amarillenta que recubre nuestros dientes que lo dañan y que le encanta a la bacteria.

Este nuevo huésped famoso es nada más y nada menos que la bacteria Streptococcus mutans. Este visitante pertenece a un familia de bacterias llamadas cocos gram positivos debido a que tienen una forma circular y de apariencia similar a las cuentas de un collar. Se caracterizan por ser anaerobios es decir viven sin necesidad de aire, de esta manera es muy fácil que puedan desarrollarse en cualquier lugar.
Fotografía de microscopía electrónica de barrido de Streptococcus mutans
Una vez que la bacteria se instala en el diente, buscará alimentarse para obtener energía y esto lo va a realizar mediante la utilización de los azúcares que consumimos, ésta golosa bacteria consume de manera incompleta los azúcares, los mismos que los va digerir dentro de ella mediante unas sustancias y los convierte en ácidos que serán eliminados después y causarán el debilitamientos del recubrimientos de los dientes. Entra azúcar y sale ácido.


Mencionaba que estas bacterias consumen azúcares de manera incompleta debido a que consumen una parte de los azúcares y el resto los dejan que se vayan acumulando y de a poco adentrando en los dientes. Nuestros dientes tienen una forma agrietada es ahí justamente donde se van a depositar los restos, los también van a causar daño a nuestras muelitas.

LAS CARIES DESTRUYEN IRREVERSIBLEMENTE TUS DIENTES Y TU ECONOMÍA 

Las caries puede definirse como la destrucción irreversible de la estructura dental. Comienza atacando la superficie de las piezas dentales (esmalte) y se propaga hasta alcanzar la pulpa. Puede no haber síntomas, pero si se presentan, pueden abarcar: Dolor de muela o sensación dolorosa en los dientes, sobre todo después de consumir bebidas o alimentos dulces, fríos o calientes. Además de causar múltiples molestias las caries también atacan a tu bolsillo si bien hoy en día el costo de un empaste no va más allá de los $25, se debe tener en cuenta, que los empastes pueden desgastarse y necesitar reemplazos, es así que varios estudios demuestran que mantener un solo empaste en un diente a lo largo de toda la vida del paciente cuesta alrededor de $1000. Es así que si una caries puede resultar costosa, dos o más caries pueden incrementar los gastos muy por encima del costo de vida de los cuidados preventivos.

EL DENTISTA NO ES CARO, EL DESCUIDO SÍ


Las visitas regulares al dentista son de mucha ayuda para cuidar nuestros dientes. El dentista revisará nuestra manera de cuidarlos y en casos extremos realizará ciertos procedimientos para mantener nuestros dientes sanos. El ir a controles cada 6 meses al dentista no es caro, pero si dejamos de acudir constantemente no nos podrá guiar en un cuidado oportuno, y el descuido no saldrá conveniente. Durante la visita el dentista podrá retirar profesionalmente la placa bacteriana de tus dientes e identificar las áreas donde requerimos poner atención en la limpieza. En el caso de que ya se tenga caries avanzada el dentista hará una colocación de sellantes que cubrirán grietas ocasionadas por la bacteria formando así una capa protectora para el diente, casi como cuando nos empastan una pared en nuestra casa que ha sido invadida por la humedad. Las medidas de prevención van desde el control de la ingesta de azúcares , una buena limpieza con ayuda de geles, pastas, y una buena técnica de cepillado dental. Esta se debe realizar de forma vertical desde la encía desde abajo y hacia afuera tanto en la parte externa como interna y las muelas deben ser en forma de remolino para que las fibras del cepillo penetren y quitar posibles restos de comida.

LAS CARIES AFECTAN A 8 DE CADA 10 PERSONAS EN EL MUNDO

La mejor medicina es la prevención y la información para evitar caries. Todos los días se forma sobre los dientes la placa bacteriana, las bacterias procesan los restos de alimento formando un ácido que causa la desmineralización del diente iniciando el proceso de caries.
La desmineralización ocasiona manchas blancas y sin brillo en el diente. En esta etapa las caries aún pueden ser revertidas a través del correcto cepillado con pasta dental con Floúr, cepillarse bien los dientes después de cada comida, al menos dos minutos cada vez, uso de hilo dental es un complemento perfecto al cepillado dental para eliminar los restos alimenticios que quedan entre los dientes, beber agua frecuentemente ya que así limpiamos los dientes. Cuando las personas dicen que “comer a diario una manzana ayuda a la gente a estar sana” es porque morder una verdura o manzana crujiente estimula a tu boca a producir más saliva, la cual restaura el equilibrio de pH en tu boca, evitándose así la placa.
La progresión va a generar un agujero en el diente. Si la caries sólo afecta al esmalte y la dentina, el dentista retirará el tejido dañado y rellenará el hueco con una obturación dental (conocido comúnmente como “empaste”).
El objetivo del tratamiento será detener el avance de la caries y sellar bien la zona para evitar que la enfermedad reaparezca.
¿QUÉ OCURRE SI NO TRATO MIS CARIES A TIEMPO?

Ahora con las nueva información que sabemos, podemos entender de mejor manera que las caries es una problema muy común de que ocurra en nuestra boca, pero aun así habrá personas que digan : No me interesa escuchar ese tema, total si las tengo que me puede pasar?

Cuidado!. Las consecuencias pueden ser feas, todo empezará con un dolor en el mejor de los casos, que cada vez será más intenso, pero la consecuencia final que no será de nuestro agrado porque llegaremos a perder nuestra pieza dental y creo a nadie le gustaría ir por la vida sin dientes o mejor dicho que nos llamen chimuelos.


COMO QUIERO TENER MIS DIENTES EN EL FUTURO

Hemos vistos a nuestros abuelos como ya no tienen sus dientes y que ahora para que puedan comer, hablar o sonreír de mejor manera usan prótesis dentales en lugar de sus dientes reales que con el tiempo fueron desapareciendo. Pero qué feos son esos dientes, aunque parezcan reales, imaginemos tener que usar algo postizo en nosotros todo el tiempo, bueno puedes acostumbrarte pero nada reemplazará lo auténtico, natural y real. Deberíamos cambiar este final. YO quisiera que cuando llegue a ser viejito pueda aun sonreír con mis propios dientes, por eso ahora es tiempo de prevenir cualquier problema que pueda aparecer en nuestra boca y sonreirle al mundo con dientes verdaderos no postizos.

viernes, 9 de junio de 2017

El antibiótico 25000 veces más potente

Leer la noticia aquí.

¿Sayonara baby? Si en 50 ciclos aumenta la resistencia 4 veces que pasará si aumentamos los ciclos de replicación? y si hay eventos de transmisión horizontal de otros genes?...  ¿Cómo puede decir el periodista que las bacterias "aprendieron"? Las bacterias no aprenden, nosotros seleccionamos bacterias resistentes a los antibióticos matando a las bacterias sensibles...

El problema del periodismo científico es que, con excepciones, lo llevan periodistas sin formación en los campos respectivos.

viernes, 2 de junio de 2017

Las vacunas, la mejor herramienta de la medicina

A mis alumnos le explico que las vacunas es una de las mejores herramientas que tiene la medicina. La población de Quito se vacunó masivamente solo 5 años después de la publicación del artículo en el que Edward Jenner explica el procedimiento para lograr protección frente a la viruela. Es curioso el dato pues muchos países, incluida España, hicieron sus planes de vacunación masiva un siglo después. Un gran honor para la ciudad de Eugenio Espejo, el médico quiteño que publicó en 1785 que el origen de las enfermedades infecciosas se debe a causas biológicas.
Quito se vacunó en 1805 gracias a la Expedición Balmís.
Publico este cómic creado por Maki Naro y traducido al español por Pantomaka. Se puede acceder a la versión original en inglés aquí.


Si hacéis click en la imagen se hará más grande y más fácil de leer

Nuevos paisajes nuevas bacterias

Han aparecido dos noticias este mes sobre dos nuevos ambientes, el mar de plástico en el océano y la Estación Espacial Internacional, en los que se han encontrado bacterias que sólo se pueden encontrar allí.


lunes, 29 de mayo de 2017

La selección natural... sus cosas

Muere un niño al que le trataron la otitis con homeopatía y no con antibióticos

Afortunadamente ya en algunos países la legislación está tomando medidas contra este tipo de padres ignorantes. 

 

miércoles, 17 de mayo de 2017

Bacterias que huelen las minas antipersona

THINKING PENNIES WILL GET YOU PENNIES... START THINKING DOLLARS

Este título está sacado de la película "Ray", una biografía del músico Ray Charles. Durante un dialogo un productor le dice: "If you think pennies, Mr. Charles, you get pennies, but if you think dollars, Mr. Charles, you get dollars".  La frase me encantó en su momento, sabía que en algún momento me sería útil. 

La mayoría de la divulgación científica, incluida la mayoría de la que yo hago, es divulgación de poca calidad, divulgación de centavitos, de peniques. Por ejemplo, aparece una noticia en Nature Biotechnology: bacterias que sirven para localizar minas antipersona. La universidad en donde se genera el trabajo escribe una nota de prensa que filtra a los medios de comunicación. Los periodistas encargados de la sección de ciencias, una sección relativamente nueva pero que cada vez es más popular en todos los periódicos y revistas, reproducen más o menos con las mismas palabras la noticia. Lo curioso es que no se molestan en leer el artículo original y aparte de reproducir la nota de prensa poco aportan a la noticia en cuestión. Auténticos loros. Pero, como la mayoría de esos medios son gratuitos y la mayoría de los que cubren esas noticias son becarios que cobran poco o nada... ¿Qué calidad esperamos?

Ahí van algunos enlaces: El Mundo, Quo, RTVE, El Comercio de Perú, Noticias de la ciencia, Europapress, Innovaticias, ScienceMag, The Economist, The Guardian ... si os habéis tomado la molestia de echarles un ojo os daréis cuenta de que es la misma noticia, la misma redacción contada una y otra vez.

PR WARS (GUERRA DE RELACIONES PÚBLICAS) 

Empiezo a leer la noticia de un grupo de investigación de la Hebrew University que ha desarrollado unas bacterias que detectan un compuesto derivado del TNT, el explosivo que se usa mayoritariamente en las minas antipersonas. El grupo del Dr Shimshom Belkin ha publicado su descubrimiento en Nature Biotechnology. Una de las revistas más top de la biotecnología. Leyendo un poquito sobre el tema descubro que en 2009 un grupo de la Universidad de Edinburgo, en Escocia, ya había desarrollado unas bacterias parecidas. Sigo leyendo y descubro que en España, el grupo de Victor de Lorenzo también había desarrollado bacterias semejantes. Lucas Sánchez, bloguero e investigador en el grupo de Victor de Lorenzo, explica magistralmente este tipo de tecnología en una charla de 9 minutos en Naukas.

En el CSIC (Centro Superior de Investigaciones Científicas, el grupo de Victor de Lorenzo también trabaja en esta tecnología. Para explicarlo ha hecho esta animación.

En Colombia, estudiantes de la Universidad Nacional de Colombia también trabajan con este tipo de bacterias, en un proyecto llamado Landminator. Ahora surge la pregunta ¿Por qué un trabajo de 2017, cuando ya hay trabajos previos, tiene tanta repercusión? La respuesta son las PR wars, las guerras de relaciones públicas. El estado israelí con su política de "apartheid" de los palestinos se ha ganado una mala reputación a nivel mundial. Glosar las glorias de la ciencia israelí, que es excelente, es una manera de lavar la imagen pública que se pierde con la política de ocupación de territorios palestinos. Los gabinetes de comunicación de sus universidades cuelan las noticias en los grandes medios de comunicación y las secciones de ciencia, llevadas por becarios mal pagados y con pocas ganas de trabajar se dedican, como loros, a repetir esa noticia.


PRIMERO FABRICAMOS LAS MINAS Y LUEGO OFRECEMOS CÓMO LOCALIZARLAS

Colocar una mina puede costar 1,8 euros pero desactivarla puede llegar a mucho más: hasta 718 euros. Frecuentemente son las mismas empresas productoras de minas las que proporcionan servicios de desminado. Creo un problema y luego ofrezco resolver el problema: la cuadratura del círculo del beneficio empresarial. Desde 1975, UNICEF calcula que más de un millón de personas han sufrido amputaciones o la muerte debido a las minas. En total cerca de 800 personas mueren debido a estos explosivos cada mes. Se estima que en 64 países hay más de 100 millones de minas que aún no han explotado. Al lado del Ecuador, en Colombia, las minas que han dejado el conflicto con la guerrilla es un drama nacional.

BACTERIAS QUE AL OLER EXPLOSIVO SE VUELVEN FLUORESCENTES

He descubierto que hay un montón de tecnología para desactivar minas: excavadoras preparadas para resistir explosiones, perros, ratas etc. 

Perros y ratas se utilizan por su olfato. Los perros se domesticaron a partir del lobo en el neolítico. Cuando los cazadores mataban a los lobos adultos algunas mujeres amamantaban a los cachorros. Dar de mamar a un animal hacía que las probabilidades de quedarse de nuevo embarazadas disminuyesen. Esa técnica todavía la utilizan algunas mujeres de tribus del Amazonas. Los lobitos amamantados de esa manera se acostumbraban a vivir con sus nuevas familias. Esos fueron los primeros pasos de la domesticación. Utilizamos perros y ratas domesticadas para utilizar su olfato. Ahora, que en el S XXI estamos domesticando a las bacterias y también las utilizamos por su capacidad para "oler" el explosivo cuando se está deteriorando.
Por medio de la biología de sistemas podemos hacer maravillas. Por ejemplo. Todos los seres vivos compartimos el mismo lenguaje genético. Un gen de mosca se puede meter dentro de una bacteria y la bacteria puede leer esa información. Los seres vivos no somos como los ordenadores que tienen sistemas operativos distintos: Apple, Windows, Ubuntu, Android. El sistema genético es universal y por ese motivo podemos pasar genes de una especie a otra. 

Los científicos han unido un gen que detecta un producto de descomposición del TNT a un gen de la luciérnaga. Cuando el producto de descomposición le llega a la bacteria la bacteria comienza a producir la proteína de la luciérnaga. Si nosotros iluminamos a esas bacterias por ejemplo con una luz fuerte, un láser por ejemplo, al apagar el laser esas bacterias se iluminarán como esa pintura fluorescente que se usa para las pegatinas o para los relojes de manecillas.

Lo que hicieron estos investigadores fue meter a las bacterias dentro de unas bolitas de gel, para que no pasasen ni hambre ni sed, y soltaron esas bolitas en un campo lleno de minas
Burbujas del biosensor esparcidas por el área de estudio. NATURE BIOTECHNOLOGY
Por la noche un todoterreno equipado con un láser iluminó el campo de minas con las bacterias. Aquellas bacterias que estaban encima de una mina pudieron "oler" el compuesto en descomposición del TNT y produjeron la proteína de la luciérnaga y al ser iluminadas con el laser, cuando el laser se apagó emitieron luz señalando exactamente dónde estaban las minas
Gracias a unas bacterias modificadas es posible detectar de forma remota la presencia de explosivos. Crédito imagen: Hebrew University
Las fotos que aparecen el en Nature Biotechnology son bastante impresionantes
Lo que hicieron los investigadores ya había sido básicamente publicado en 1998: unir un promotor inducible DNT/TNT unido a una proteína fluorescente verde. Lo que aporta este artículo es que escanearon un área llena de minas con un láser desde 20 metros a una velocidad de 18 cm/sec, es decir un total de 15 min de tiempo total de escaner.
Ahora como todas las tecnologías habrá que ir mejorando. Posiblemente el láser se pueda incorporar a un dron, las bacterias hacerlas más resistentes a la deshidratación. Se ha visto que algunas bacterias en contacto con algunas plantas pueden volverse fluorescentes, aunque no haya minas debajo... pero como todas las tecnologías tenemos que pasar de los coches de manivela a los Ferraris, pero todo es cuestión de tiempo

INCONVENIENTES DE UTILIZAR BACTERIAS CHIVATAS

Desafortunadamente, no hay ninguna cepa de bacteria capaz de detectar RDX, otro explosivo común, y las bacterias pueden no ser visibles en condiciones desérticas. Además, las municiones bien construidas que no hayan tenido tiempo para corroerse pueden ser indetectables utilizando este método.

martes, 2 de mayo de 2017

Reproducción parasexual

El mundo de los hongos me interesa cada vez más (lo siento bacterias), por eso hoy he estado leyendo sobre los tres ciclos de reproducción de Aspergillus.
El ciclo sexual y el asexual ya lo conocía. Me sorprendió el ciclo parasexual. Reproduzco de esta excelente página de la Universidad de Almería

La reproducción asexual, a causa de su economía y rapidez, es sumamente práctica para la veloz dispersión de una especie en ambientes estables. Sin embargo, el sexo resulta ventajoso en ambientes cambiantes, ya que proporciona variabilidad genética por medio de la recombinación. Como ya se dijo, los hongos suelen aprovechar lo mejor de ambas estrategias: multiplicación vegetativa en época de vacas gordas, y sexo cuando las cosas se ponen feas. Sin embargo, muchos hongos imperfectos que aparentemente no se propagan sexualmente sobreviven de un año para otro. Es más, son muy variables (como el agricultor ha comprobado para su desgracia, es fácil la aparición de cepas resistentes a fungicidas, o que ataquen a variedades de plantas supuestamente inatacables). ¿Cómo lo hacen? Una posibilidad es la del ciclo parasexual, que no requiere meiosis ni la formación de gametangios especializados. Dicho ciclo fue propuesto en 1952 por Pontecorvo y Roper para Aspergillus nidulans.
Veamos un breve resumen del ciclo parasexual:
  • Para que haya parasexualidad se requiere primero la existencia de un heterocarionte, es decir, un hongo con núcleos de distinto tipo en el mismo micelio. Esto se puede lograr bien por mutación o, más frecuentemente, porque dos micelios diferentes se anastomosan y uno le pasa sus núcleos al otro. Debe quedar claro que cuando hablamos de núcleos "distintos" nos referimos a que poseen alelos distintos para el mismo gen. Y no olvidemos que se trata de nucleos haploides, con un único juego de cromosomas.
  • Dentro de las células del heterocarionte, por azar (o sea, sin que el hongo se tome la molestia de fabricar estructuras especiales para ello) puede darse la cariogamia (fusión) entre núcleos distintos. Obtendríamos así algunos núcleos diploides, es decir, con dos juegos de cromosomas.
  • Los núcleos diploides resultantes se dividen por mitosis, pero en ese proceso pueden ocurrir entrecruzamientos mitóticos entre cromosomas homólogos (y, por tanto, recombinación genética).
  • Estos núcleos diploides pueden sufrir mitosis aberrantes. Así, a partir de un núcleo con 2n cromosomas pueden obtenerse núcleos aneuploides, con 2n+1 y 2n-1 cromosomas. Pero estos aneuploides son inestables...
  • Poco a poco, a partir de los aneuploides pueden volver a formarse núcleos haploides por pérdida de cromosomas. Estos nuevos núcleos haploides tendrán una mezcla de caracteres respecto de los núcleos originales. Si van a parar a un conidio, el individuo resultante tras la germinación tendrá una dotación genética distinta a la parental. En suma, ha habido recombinación, pero sin meiosis, sexo ni nada que se le parezca.
El proceso es 500 veces menos efectivo que el sexo, pero si se tiene en cuenta que un individuo puede producir millones de conidios, resulta que funciona muy bien. Se desconoce el papel real de la parasexualidad en la naturaleza; hay autores que opinan que no es significativa, ya que estos hongos suelen presentar mecanismos de incompatibilidad vegetativa que evitan la heterocariosis.


jueves, 6 de abril de 2017

Tecnología neolítica disminuye tres logaritmos de virus

Los filtros de barro fueron desarrollados por el científico guatemalteco Fernando Mazariegos en los años ochenta del SXX. 
Hoy en día existen 47 fábricas repartidas por todo el mundo
Según la ONG "Potters for peace" en el mundo existen 47 fábricas de filtros de barro. Fuente
Los filtros actuales (de color marrón barro) son eficaces eliminando bacterias y protozoos. Sin embargo, los virus son 1000 veces más pequeños en volumen comparados con las bacterias. Los filtros de barro actuales no son capaces de eliminar virus. Por ese motivo vamos a fabricar por primera vez a nivel mundial unos filtros de barro negros que son capaces de eliminar 1000 veces virus del agua. 
La investigadora Laura Guerrero demostró en laboratorio que los filtros de cerámica negra eliminan hasta 1000 veces los virus del agua. Fuente
¿Cómo visualizamos una reducción de 1000 veces?

Fácil, metemos en un bote 500 gramos de quinua. Consideramos que esa podría ser la concentración de virus en un agua muy contaminada con virus. Si reducimos esa cantidad 1000 veces tendremos 0.5 gramos, medio gramo. 
El barro es de las tecnologías más antiguas, sin embargo, sigue siendo útil en el siglo XXI. Todos podemos cocer barro, vasijas, incluso aprovechando un hormiguero de la selva como hace el man del video de abajo

lunes, 3 de abril de 2017

Patrones de color alucinantes

El biólogo sintético Tal Danino manipula microorganismos en su laboratorio para crear patrones de color alucinantes. Pinchad el enlace aquí.
Microuniverse , Eyebeam exhibit, New York City

domingo, 26 de marzo de 2017

Estructuras ocultas en el ADN bacteriano

Reproducido de biotech-spain.com
El ADN contiene las instrucciones de la vida , que están codificadas en los genes. Dentro de todas las células, el ADN se organiza en unas estructuras conocidas como cromosomas. En las células animales y vegetales las terminaciones de los cromosomas se desdoblan, como las hebras de una cuerda o del cordón de un zapato , pero en las bacterias los cromo so mas son circulares. Tanto si son como hebras o circulares, estos largos cromosomas deben organizarse y empaquetarse dentro de la célula, de manera que los genes puedan activarse o desactivarse cuando sea necesario.
En un trabajo conjunto con científicos en España, Japón y Australia, investigadores liderados por Luis Serrano, profesor de investigación ICREA y jefe del grupo de investigación Diseño de Sistemas Biológicos en el Centro de Regulación Genómica, centraron su atención en la organización del ADN en un organismo con un genoma extremadamente reducido: el patógeno de la neumonía, Mycoplasma pneumoniae. Su cromosoma circular es cinco veces más pequeño que el de bacterias más grandes, como por ejemplo el de la Escherichiacoli .
Mediante una técnica denominada Hi -­ C*, que muestra las interacciones entre diferentes partes de l ADN, los investigadores crearon un ‘mapa’ tridimensional del cromosoma de Mycoplasma . A continuación , usaron microscopía de súper -­ resolución para demostrar que este mapa generado por ordenador coincidía con la organización real del cromosoma dentro de células bacterianas.
En particular, el equipo del CRG que contaba con la experiencia en Mycoplasma del grupo liderado por Luis Serrano y con la colaboración del también profesor de investigación ICREA Marc Marti -­ Renom en el CRG -­ CNAG, descubrieron que el cromosoma circular de Mycoplasma está organizado uniformemente de la misma forma en todas las células, con una región llamada Origen (donde comienza la copia del ADN) en uno de los extremos de la estructura y el Punto Medio del cromosoma ubicado en el extremo contrario. Esta estructura es similar a la observada en otras especies de bacterias más grandes.
Los científicos también usaron la técnica Hi -­ C para estudiar patrones más detallados de la organización dentro del genoma de Mycoplasma . En los últimos años, científicos de todo el mundo han investigado la organización de los cromosomas dentro de las células de especies que van desde grandes bacterias hasta humanos. La secuenciación de última generación ha permitido a los científicos ‘leer’ la secuencia de ADN de cualquier genoma, pero esto no muestra cómo la información genética se gestiona y organiza en el interior de una célula. Ahora existen nuevas herramientas que han permitido descubrir estructuras complejas de organización en los genomas de organismos más grandes , con algunas regiones de cromosomas agrupados para formar dominios que contienen genes que se activan y desactivan en conjunto.
Sin embargo, se creía que estos dominios no se encontrarían en Mycoplasma porque su genoma es muy pequeño y tan solo produce alrededor de 20 proteínas diferentes responsables de organizar el cromosoma, en comparación con los cientos de proteínas que producen otras especies bacterianas.
Curiosamente, el equipo del CRG desc ubrió que a pesar de que el diminuto cromosoma de Mycoplasma se organiza en diferentes dominios estructurales, cada uno contiene genes que también se activan y desactivan de manera coordinada.
Marie Trusssart, primera autora del estudio, comenta: “El estudio de una bacteria con un genoma tan reducido supuso un gran reto técnico, especialmente porque usábamos microscopía de súper -­ resolución, y nos llevó cinco años completar el proyecto. Sospechábamos que el genoma de Mycoplasma podía tener una organización general similar a otras bacterias, pero nos sorprendió muchísimo descubrir que también estaba organizado en dominios, que pueden considerarse unidades reguladoras de la organización de la cromatina , y que hubiéramos identificado una capa de la regulación génica hasta entonces desconocida ” . Y añade : “ Este estudio muestra que la organización y el control de los genes no se puede entender sólo mirando la secuencia lineal del ADN en el genoma. De hecho, para disponer de la foto completa de la regulación génica necesitamos echar un vistazo a la organización tridimensional de la cromatina, que también coordina la actividad de los genes.”
El descubrimiento sugiere que este nivel de organización y control genético es común a todos los organismos vivos, desde el más grande al más pequeño, y que se consigue con poco más de un puñado de proteínas de unión del ADN y las propiedades estructurales del propio ADN.
El equipo del CRG ha estado trabajando durante mucho tiempo para conseguir análisis cuantitativos detallados de Mycoplasma pneumoniae a todos los niveles: desde genéticos a metabólicos, incluidos los patrones de actividad génica y composición de proteínas, y más. Planean usar este descubrimiento para complementar la investigación centrada en controlar y manipular la actividad de los genes en bacterias modificadas genéticamente, lo que tiene muchas e importantes aplicaciones médicas e industriales.




domingo, 19 de marzo de 2017

Relaciones de parentesco: Virus, bacterias y células eucariotas

¿Qué fue antes el huevo o la gallina? ¡El huevo!
Los virus son los primeros seres vivos

La ciencia no considera a los virus como seres vivos. Personalmente creo que si lo son. Hace 4000 millones de años, en la sopa de moléculas orgánicas que había repartida por mares y lagos en la joven tierra, los primeros seres vivos debían ser algo parecidos a los virus: moléculas de ARN autorreplicantes, rodeados de una membrana de tipo proteico. Sus fuentes de energía y de alimento debían ser esas moléculas orgánicas que surgieron espontaneamente, según nos muestra Oparín en sus experimentos. Cuando apareció la primera bacteria, éstas debieron de acabar con ese buffet libre de moléculas orgánicas y a los virus no les quedó más remedio que volverse patógenos intracelulares. ¿Se descubrirá algún día un virus de vida libre en una cueva profunda sin presencia de células de verdad? estoy seguro de que si. Pero por ahora esta pregunta es simplemente una hipótesis.

Recientemente se ha descubierto de que los virus se pueden comunicar entre si. Todo indica que debemos de cambiar nuestra manera de pensar y admitir que los virus son seres vivos. Tienen un comportamiento sofisticado y han evolucionado a partir de un mismo ancestro común al igual que las células de animales y plantas.

De los virus primitivos surgen las primeras células bacterianas

 
 Tubos bacterianos descubiertos en Nuvvuagittuq. Fuente: Nature

Hace 3700 millones de años las bacterias ya construían ciudades en forma de tubos. Por ahora, en 2017, los humanos solo podemos soñar en vivir en ciudades tubulares, algo que ya hacían las bacterias en el principio de los tiempos.
Ciudad orbital tubular Elysium


Las bacterias son células con membrana lipídica, es decir, de grasa. Hay dos clases de bacterias, las más primitivas, llamadas Arqueobacterias, estas bacterias suelen ser anaerobias, viven sin oxígeno en charcas de aguas sulfurosas o en el fondo de lagos y mares. Son más grandes que el grupo más común para nosotros, las eubacterias, o bacterias verdaderas. Estas son las bacterias que suelen causar enfermedades en los humanos, por eso las conocemos más.
 Árbol filogenético de la vida. La primera célula aparecida hace 4000 millones de años da lugar a dos grupos de bacterias: las arqueobacterias, en rojo, y las eubacterias (líneas azules). Las arqueobacterias y las eubacterias mediante simbiosis se juntan para formar la célula eucariota (línea en morado), las células típicas de animales, plantas, hongos y protozoos

Las arqueobacterias tienen un citoesqueleto primitivo. Las eubacterias, el grupo de bacterias entre las que se encuentran a las bacterias que aprendieron a transformar el CO2 + H20 y convertirlo en azucar y O2. Al ser bacterias acostumbradas al oxígenos son bacterias más cercanas a nosotros. Hay algo curioso de las eubacterias: las bacterias que tienen el cromosoma más pequeño se dividen más rápidamente. Me explico. Si hay dos bacterias, llamémoslas A y B. A tiene el doble de genes que B. Si tiene el doble de genes podrá hacer muchas más cosas. El problema con A es que para dividirse tarda el doble de tiempo que B.
La bacteria que va a ser seleccionada es aquella que deja más descendencia. Por ese motivo las bacterias tienden a la simplicidad. Por ese motivo la mayoría de las bacterias son pequeñas, tan pequeñas que no hay espacio para tener un esqueleto. 

Si no tienen esqueleto ¿Cómo mantienen la forma las bacterias?

Las bacterias son como globos a presión. Para evitar estallar están recubiertos de una malla de peptidoglicano. Hay dos tipos de eubacterias, las Gram positivas y las Gram negativas. Las bacterias Gram positivas tienen una malla de peptidoglicano más grande y por eso mismo tienen mayor presión, unas 25 atmósferas, es decir, la misma presión que existe a 250 metros bajo el mar. Las bacterias Gram negativas, con una malla más finita, tienen alrededor de 5 atmósferas de presión.
La penicilina mata a las bacterias interfiriendo con la producción de una malla que impide que exploten, porque las bacterias están a presión. Cuando las bacterias crecen para después poder dividirse, la malla se afloja y ya no vuelve, por culpa de la penicilina, a tupirse. Cuando la malla ya no puede retener la presión interna de las bacterias, éstas explotan

Bacterias a presión, virus con forma de bomba neumática

Cuando las bacterias acabaron con la sopa biológica de moléculas orgánicas que servía de alimento a los virus primitivos, éstos empezaron a depredar a aquellas que les habían quitado su fuente de energía y recursos: las bacterias. Como las bacterias estaban a presión fueron seleccionados para convertirse en unas máquinas que inyectasen su ADN o ARN en el interior de las bacterias. Por ese motivo los virus de bacterias, los bacteriófagos, son parecidos a los mosquitos.

Una llave para entrar y otra para salir

Las células eucariotas, 100 veces más grandes que las bacterias, no están a presión. Se acuerdan que las arqueobacterias si tenían un esqueleto? pues bien, en un momento de la evolución las arqueobacterias que no sabían vivir con el 02 se alían con las eubacterias que si sabían vivir con el oxígeno, estas bacterias son las que van a originar el orgánulo celular de las mitocondrias. Las arqueobacterias, más grandes que las eubacterias, dotan al consorcio arqueo-eubacterias de una membrana flexible, sin presión interior. Para mantener la forma utilizan el citoesqueleto, lo mismo que una carpa de camping tiene varillas para mantenerla derecha.
 
 El autor del blog disfrazado de bacteria (aunque recuerda al muñeco de Michelín) con un modelo de bacteria (un globo de globoflexia) y detrás una carpa de camping como modelo de célula eucariota que no tiene presión y tiene citoesqueleto (las varillas de la carpa)

Como la célula eucariota no tiene presión, los virus que parasitan a este tipo de células tienen otra manera de entrar. Utilizan una llave que se va a unir a un receptor de la célula y de esa manera van a entrar provocando una invaginación dentro de la célula, un poco como cuando soplamos en una burbuja de jabón que se invagina para formar una burbuja más pequeña en su interior.

El virus de la gripe tiene dos llaves, una de entrada (la hemaglutinina) y otra de salida (la neuraminidasa. En su interior, dentro de una bicapa lipídica se encuentra su ARN.
 Pero mejor veamos un vídeo para entender todo el proceso:

Los virus de eucariotas son los que nos importan porque atacan a células como las humanas. A continuación os presento las fotografías de microscopía electrónica de virus humanos:

Los 10 virus humanos más letales

Influenza

La gripe estacionaria, una de las más comunes pues puede atacar a cualquier persona a cualquier edad. Hay tres tipos (A,B y C) y varios subtipos y se propaga mediante estornudos. Anualmente se calculan de 3 a 5 millones de casos alrededor del mundo de los cuales entre 250,000 y 500,000 resultan mortales. Curiosamente esta enfermedad es un factor económico decisivo pues una pandemia puede causar abstencionismo y baja en las tazas de productividad además de un gran gasto en la salud pública.

Rotavirus

Una de las enfermedades diarreicas más comunes entre poblaciones de escasos recursos y que cada año causa alrededor de 450,000 muertes de menores a 5 años por falta de acceso a vacunas. Se transmite a través de las heces y por falta de medidas higiénicas. En Ecuador 1 de cada 4 diarreas en niños está producida por rotavirus.

Fiebre Amarilla

Un virus endémico de África y América Latina transmitido por picadura de mosquitos. No hay tratamiento y su desarrollo suele suceder en dos fases, generalmente las personas se recuperan luego de 3 o 4 días pero aquello que entran en segunda fase pueden morir a los 10. La vacunación preventiva es la mejor medida contra la enfermedad. En 2013 se calculó que hubo entre 84,000 y 170,000 casos y de 29,000 a 60,000 muertes.

Sarampión

El sarampión es una enfermedad muy contagiosa, causada por un virus que provoca fiebre alta y puede dejar ciego o matar a quien la padece. En 2014 hubo 114,900 muertes relacionadas a este padecimiento. Se puede prevenir mediante vacunación temprana y afecta principalmente a niños pequeños.


Hantavirus

Se contrae por contacto con orina, saliva o excreciones de roedores infectados con él. No existe ningún tratamiento preventivo, sólo queda esperar la detección temprana de la enfermedad (que se manifiesta entre una y seis semanas después de la infección).

Hepatitis B

Una infección vírica que puede derivar en enfermedades crónicas como la cirrosis y el cáncer hepático. Se estima que cada año mueren 686,000 personas como consecuencia de las complicaciones derivadas de este padecimiento, contraído por el contacto con líquidos corporales de personas infectadas. Es prevenible a través de la vacuna.


Hepatitis C

Al igual que la enfermedad anterior, es una infección que ataca directamente al hígado. Se transmite a través de la sangre por mal manejo de equipo médico, falta de esterilización y transfusiones de sangre. Se calcula que hay de 130 a 150 millones de personas infectadas alrededor del mundo de las que 700,00 mueren cada año. Pese a que se dispone de tratamientos para controlar la enfermedad, no existe aún una vacuna eficaz.

Rabia

El mayor foco de transmisión son los perros (aunque varias especies pueden ser portadoras), por ello es fundamental vacunarlos así como recibir la vacuna en contra de esta enfermedad. Se recomienda acudir de inmediato al médico ante cualquier rasguño o mordida sufrido por animales que puedan ser portadores. Cada año 15 millones de personas reciben la vacuna tras ser mordidos o arañados y el 40% son menores de 15 años.


Dengue
Se conocen cuatro variantes de este virus que se transmite a través de la picadura de las hembras del mosquito Aedes aegypti. No existe vacuna contra este virus y sus síntomas suelen ser controlados con paracetamol. Aunque no están bien notificados, la OMS calcula 390 millones de casos de infección cada año.

Sida o VIH

El virus de inmunodeficiencia humana es una de las pandemias más recientes y ha cobrado la vida de millones de personas. Tan sólo en el 2015, la OMS calcula más de un millón de muertes asociadas a él. Se contagia a través de fluidos corporales con suficiente concentración del virus como semen, sangre, secreciones vaginales y leche materna.

El tamaño si importa

Cuando se habla de tamaño no hay que confundir longitud con volumen. Diferencias en longitud de 10 veces se convierten en volumen en diferencias de 1000 veces. Por ejemplo, un metro cúbico es mil veces el litro y un litro tienen mil centímetros cúbicos. La escala es mil veces. En cambio, en este ejemplo, si tenemos en cuenta las longitudes la escala es de 10: la longitud de 1 metro cúbico es de 10 veces 10 cm. Un litro es 10x10x10 cm.

 En general, en longitud, una bacteria es 10 veces más pequeña que una célula eucariota (como las de los humanos o las plantas) y un virus es 10 veces más pequeño que una bacteria.

Como podemos ver en el gráfico hay bastante variabilidad en los tamaños. No es lo mismo un virus grande como el del ébola que uno pequeño como el de la gripe, o el del catarro (rhinovirus).

Filtrar y eliminar 1000 veces un virus ¿Qué significa?

Los filtros de barro son una solución eficaz y barata para purificar agua. Estamos tratando de mejorarlos mediante una cocción reductora para obtener filtros negros los cuales mejoran la eliminación de virus. En concreto esta técnica reduce 1000 veces la concentración de virus en el agua
Para ayudar a visualizar lo que significa reducir mil veces la presencia de virus en el agua habría que coger un bote y meter 1 kg de quinua. Cada grano de representa un virus. Si filtramos y de 1 kg de quinua pasamos a un gramo, entonces hemos reducido 1000 veces el contenido de virus.