Ciclo de multiplicación celular del SARS-CoV2

Fuente: Vega Asensio e Ignacio López-Goñi.
Disponible en inglés, castellano, italiano y euskera en Wikimedia Commons.

Se han observado unas secuencias de 12 nt en el ARN del virus que hacen que haya 4 aminoácidos diana para una proteasa, la furina.

 

La secuencia que codifica para la secuencia diana de la proteasa furina en el ARNm es ccu cgg cgg gca. Podemos entrar en la página del NCBI en donde se encuentran las secuencias de ADN del coronavirus. Si buscamos por CCTCGGCGGGCA encontraremos la secuencia en los 29000 nt de la secuencia que codifican para prolina-arginina-arginina-alanina (Hf, +, +, Hf)

¿Cómo detectamos ARNm?

Para la detección del virus del coronavirus primero hay que convertir su ARN en ADN mediante la enzima transcriptasa inversa. Una vez tenemos el ADN se amplifica por PCR

Coronavirus real time RT-PCR Test - Animation video. Fuente

RT-qPCR for diagnosing COVID-19 (former 2019-nCoV). Fuente University College London

Existen métodos alternativos a la PCR como es la técnica LAMP que no necesita un termociclador

Loop Mediated Isothermal Amplification (LAMP) Tutorial. Fuente

What is the difference between a PCR-RT and loop-mediated isothermal amplification (LAMP). Fuente

Para saber más: 

https://sfamjournals.onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/1751-7915.13586