Doctorandos

Me encanta esta página. Aquí se encuentra la esencia del sistema de investigación español: el Dr Ácula es el jefe de laboratorio, de 60 años, pertenece a esa generación de españoles que llegaron a la universidad cuando ésta estaba en mantilla, cuando de cuatro universidades que había se pasó a 40 y se crearon las plazas de golpe. Vive del trabajo de los demas... Todos son caracteres fácilmente reconocibles por alguien que haya estado dentro de este sistema que favorece el "lameculismo" y el intercambio de lealtades.

Señores y señoras, con Uds: Doctorandos

Diccionario "Gene Ontology"

http://www.geneontology.org/

Gene Ontology es un diccionario de términos y definiciones empleados en genética. Estas definiciones sirven para estandarizar los distintos elementos genéticos. De esta manera los biólogos tenemos un estandar para poder introducir nuestros datos en las gigantescas bases de datos de la genómica. Me explico, una vez que está secuenciado el genoma completo de un ser vivo hay que ir anotando toda la información descrita previamente sobre esa información, por ejemplo, si esos nucleótidos codifican para una proteína, o son sitios de unión a factores de transcripción, marcas de modificación de histonas, regiones repetitivas o polimorfismos. Son bastantes elementos y para asegurarnos de que estamos todos hablando de lo mismo ha nacido "Gene Ontology". Las definiciones manejadas en esta página web serán las que utilicemos cuando queramos ir anotando nuestros datos en los genomas publicados.

La gonorrea resistente a antibióticos

Artículo de Silvia R. Taberné en El Mundo:

Como si de un combate se tratara, la bacteria 'Neisseria gonorrhoeae' se ha enfrentado a varios púgiles a lo largo de la Historia. Y aunque todos ellos han demostrado saber dónde golpear, esta enfermedad de transmisión sexual (ETS) se ha ido haciendo fuerte y resistente a cada impacto, conociendo los puntos débiles de los tratamientos y terminando por hacerlos ineficaces.

Así fue con las sulfonamidas en la década de los 40 o la penicilina y tetraciclinas durante los años 70 y 80. Todos ellos demostraron su eficacia en su momento, pero terminaron con un 'knock out' frente a la facilidad de desarrollo de resistencias por parte de la gonorrea. Y ahora, desde comienzos del siglo XXI, es la cefixima, un antibiótico derivado de la cefalosporina, la que parece seguir el mismo camino.

Por lo menos, esto es lo que señalan varios investigadores del Public Health de Ontario, (Toronto, Canadá) que, liderados por la doctora Vanessa G. Allen, han realizado un estudio retrospectivo en pacientes con gonorrea y han descubierto que, al tratarlos con cefixima 400 mg -uno de los principales tratamientos contra esta ETS en Canadá- la cepas de la gonorrea de algunos de estos pacientes mostraban unadisminución de la sensibilidad a este antibiótico. Los resultados aparecen publicados en el 'Journal of the American Medical Association' (JAMA).

Gonorrea, esa enfermedad común

La gonorrea es una de las enfermedades de transmisión sexual más comunes. Los Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades estadounidense (CDC) calculan en más de 300.000 las infecciones conocidas de gonorrea al año. En España, las estimaciones rondan los 2.000 casos anuales. Sin embargo, especialistas de ambos lados del Atlántico creen que la prevalencia puede ser bastante mayor (los CDC calcula que unos 700.000), aunque en buena parte de las ocasiones no se llegan a conocer.

Aunque la gonorrea se puede curar con el tratamiento adecuado, si no se cuida puede desarrollar problemas más serios de salud, que van desde enfermedades pélvicas inflamatorias, embarazo ectópico, infertilidad en el caso de las mujeres y, en casos raros, esterilidad en los hombres.

En los últimos años, los tratamientos derivados de la cefalosporina han sido los únicos antibióticos recomendados para luchar contra esta ETS. Entre ellos, el más fácil de aplicar (al ser de manera oral) era la cefixima, aunque tal y como señala el especialista Robert D. Kirkcaldy en un editorial que acompaña al estudio, "la eficacia de estos fármacos se ve amenazada".

La 'Neisseria gonorrhoeae' resistente

Para llegar a tener datos de esta situación, la doctora Allen y su equipo investigaron a pacientes con 'Neisseria gonorrhoeae' tratados con cefixima, y observaron que el tratamiento clínico fracasaba en un 6,77%en una clínica de Toronto.

El resultado no sorprende a Julio Vázquez, jefe del Laboratorio de Referencia de Neisserias del Instituto de Salud Carlos III: "Los CDC estadounidense o en Reino Unido han dejado de recomendarrecientemente el uso de la cefixima como fármaco de primera línea contra la gonorrea al encontrase que está perdiendo efectividad", explica.

De todas maneras, este especilista advierte de otros factores que también pueden estar detrás de los fallos de esta terapia: "Las reinfecciones son algo muy común en el caso de las ETS y que los pacientes no suelen reconocer cuando se les pregunta ya sea por vergüenza o por el estigma", comenta a ELMUNDO.es

Tanto el doctor Kirkcaldy en su editorial como Vázquez recuerdan que dadas las resistencias, actualmente el tratamiento que se suele recomendar como primera opción es la ceftriaxona, un fármaco que se inyecta de manera intramuscular y que también se deriva de la cefalosporina.

"Actualmente la cefixima está pasando poco a poco a ser un tratamiento de segunda línea en Europa y Estados Unidos para tratar la gonorrea", explica Vázquez.

En España

En el caso español, Vázquez comenta que "entre el 15% al 20% de las cepas aisladas de los enfermos muestran cierta resistencia", comenta.

En nuestro país, tampoco existen datos del total de pacientes infectados ni de cuántos recaen en la enfermedad. En cuanto al tratamiento, "aunque se está recomendando ese tratamiento de primera línea -la ceftriaxona-, se puede encontrar centros donde se recomienden otros tratamientos basados en cefixima junto a otros fármacos, ya que no existe una guía unitaria para todo el país", comenta Vázquez.

Pero independientemente de la ceftriaxona, los especialistas explican que la gonorrea desarrolla resistencias fácilmente, por lo que es importante que se investiguen otras alternativas contra ella, "y de ahí, por ejemplo, que la Unión Europea ya esté investigando otros fármacos para luchar contra esta enfermedad", afirma Vázquez.

Vesículas de membrana: defensa y arma bacteriana

Como se puede leer en este artículo (Offense and defense: microbial membrane vesicles play both ways), las vesículas de membrana que se liberan de la membrana externa de las bacterias Gram negativas (por ejemplo E. coli) pueden servirle a la bacteria como mecanismo de defensa y ofensivo también

E. coli enterotoxigénica aislada de una infección. Las fotografías proceden de microscopía electrónica de escaner de una cepa ETEC recuperada del intestino delgado de un ratón dos horas después de inoculación intragástrica. (Cortesía de Amanda McBroom.)

Las bacterias causantes de infertilidad masculina

Hoy me contaron el caso de un chico que quería tener hijos con su pareja. Le detectaron bacterias en el semen. Lo curaron con antibióticos y al mes su chica estaba embarazada. Hay un producto aprobado por la "Food and Drug Administration" americana que ayuda a hacerse el test en casa: http://www.spermcheck.com/

El esperma tiene que estar vivo, coleando. La célula con tres núcleos podría ser una célula precursora de espermatozoides sin madurar o un glóbulo blanco (célula del sistema inmune). Los puntitos que se ven en la fotografía son bacterias.

Las bacterias como causa de infertilidad masculina

J. Rojas-Retiz*; C. Bravo-Gatica*; R. Tapia-Serrano*.

Instituto de Medicina Reproductiva y Andrología S. C. México, DF.

Una causa frecuente de infertilidad masculina es el daño producido por procesos infecciosos. El tracto genital masculino esta colonizado por bacterias comensales como Estafilococos epidermidis, difteroides y algunas especies de estreptococos. Sin embargo, un numero de infecciones del tracto genital son establecidos como causantes de infertilidad masculina. Su fisiopatología involucra daño de los túbulos seminíferos u obstrucción del paso del esperma a epidídimo o conductos eyaculadores. En adición algunos microorganismos tienen un impacto desfavorable en la calidad del semen.

Los Micoplasmas genitales ( Ureaplasma urealyticum y Mycoplasma hominis) , la Chlamydia ( Chlamydia trachomatis ) y diversas bacterias como E. coli ,Estreptococos b -hemolítico , Enterococos faecalis , etc. son agentes patógenos importantes responsables cada vez mas frecuentes de infecciones genitales que pueden causar infertilidad, induciendo uretritis, prostatovesiculitis, epididimitis y alteraciones de la función del esperma.

Así mismo, se ha informado de la prevalencia de infecciones del tracto genital siendo para U. urealyticum del 36%, M. Hominis del 7.6%, C. trachomatis 0.5% e infecciones bacterianas en un 39%. ( 7 )

Sin embargo, el impacto de las infecciones principalmente por micoplasma genital y chlamidia en la calidad del semen y el potencial de fertilidad del esperma es aún controversial.

Se estudiaron 68 muestras de semen de pacientes con infertilidad masculina en el Laboratorio del Instituto de Medicina Reproductiva y Andrología ( IMRA ) a las cuales se les realizó un análisis de semen, cultivos generales, cultivos especiales para micoplasma y determinación de Ab IgG anti- Chlamydia trachomatis .

La muestra de semen utilizada para los análisis fue obtenida por masturbación con 2-5 días de abstinencia sexual en un contenedor estéril; toma directa de secreciones uretrales así como muestras de suero.

El análisis de semen se practico siguiendo los lineamientos del Manual de Laboratorio de la OMS, 1992 (22), a excepción de la morfología que se valoro por Criterios Estrictos de Kruger (24,25,26) . El cultivo de micoplasmas genitales ( M. hominis , M. fermentans y U. urealyticum ) se identifico mediante Cultivo en Medios Selectivos y Diferenciales (Kit comercial Mycoplasma-Lyo), para el espermocultivo se utilizo el método de Identificación y Antibiograma con Autoscan-4. La determinación de anticuerpos IgG anti- Chlamydia trachomatis se realizó de manera Inmunoenzimática (IEA) con el estuche comercial Platest Chlamydia IgG, considerando un valor positivo cuando éste es mayor de 1.10.

Estadística: La muestra representativa fue estimada considerando el número de pacientes con cultivos positivos y negativos correlacionándolos con los índices anormales que se encontraron en el análisis de semen. Se realizo con la prueba t de Students, dos colas donde P < 0.05.

 RESULTADOS

De las 68 muestras estudiadas 23 ( 34% ) fueron cultivos positivos. En estas muestras se encontró un mayor porcentaje de alteración en los índices espermáticos como se muestra en la tabla I.

Las muestras con cultivos positivos fueron divididos en 4 grupos:

Grupo I con infección a diversas bacterias ( E. coli, Streptococos b -hemolítico, K. pneumoniae, A. lowffi, E. faecalis, C. albicans, Neisseria spp ).

Grupo II con cultivos positivos a micoplasmas genitales.

Grupo III con anticuerpos IgG anti- Chlamydia trachomatis y

Grupo IV con infección mixta.

De las 23 muestras con cultivos positivos el 39% eran positivos al espermocultivo (Grupo I), el 26% cursaba con infección solamente a micoplasma (grupo II, 13% conUreaplasma urealyticum y 13% a Mycoplasma hominis ), en un 9% se determinaron Ab IgG anti- Chlamydia trachomatis (Grupo III ) y finalmente un 26% ( grupo IV ) pacientes con infecciones mixtas ( 13% presento infección a los grupos I y II, 9% a los grupos I y III y el 4% a todos los grupos).

En cuanto al análisis de semen y su relación con los cultivos los hallazgos se muestran en la Tabla II.

Tabla I. Porcentaje de Indices de semen alterados en las muestras dependiendo de los cultivos

Indices	positivos n =23	negativos n =45
Aspecto	59%	26%
Volumen	35%	11%
Motilidad	82%	52%
Concentración	59%	19%
Viabilidad	71%	44%
Aglutinación	29%	56%
Morfología	76%	44%

* Los índices que se omitieron no están representativamente alterados

Tabla II. Indices anormales de semen y la relación de cultivos.

Indices	Cultivos positivos (n = 23)	Cultivos negativos (n = 45)	P < 0.05
Volumen	2.3 ± 0.89	2.84 ± 1.08	NS
Concentración	42.7 ± 49.63	75.1 ± 58.27	NS
Motilidad	26.3 ± 17.30	37.7 ± 21.58	NS
Viabilidad	55.3 ± 17.58	67.0 ± 20.65	NS
Morfología	6.18 ± 8.16	13.1 ± 12.72	0.0391

CONCLUSIONES

Con respecto a la literatura existe una extensa variación en cuanto a la alteración de los índices del semen cuando el paciente infértil presenta cultivos positivos, algunos autores mencionan la alteración principalmente de la concentración, motilidad, volumen y morfología, en tanto que en otros estudios no se encontró modificación alguna de los índices. Sin embargo, en este trabajo encontramos una disminución en los índices de volumen, concentración, motilidad, viabilidad y morfología aunque estadísticamente sólo la morfología esta significativamente alterada con P = 0.0391 ( Tabla II, Indices anormales de semen y la relación de cultivos ).

Las alteraciones de los índices de motilidad y morfología son más frecuentes en infecciones por micoplasma, observando en la morfología un número significativo de formas acintadas y con defecto de cola. Y hay una reducción de la concentración y motilidad en muestras con infección por C. trachomatis .

Es importante también el destacar que las bacterias aisladas en el espermocultivo a diferencia de lo publicado E. coli no es la bacteria más frecuente causante de infecciones, nosotros encontramos una variedad de ellas sin predominancia comoEstreptococos b -hemolítico , Klebsiella pneumoniae , Enterococos faecalis ,Escherichia coli , Candida albicans , Neisseria spp . y Acinetobacter lowffi .

Las infecciones del tracto genital por U. urealyticum, M. hominis y C. trachomatisson frecuentes encontrarlas en poblaciones de hombres infértiles; nosotros encontramos un 61% de pacientes con resultados positivos hacia este tipo de infecciones.

Así mismo, se ha reportado que pueden interferir en la infertilidad al provocar una respuesta inmune local con la producción de anticuerpos antiespermatozoides y reducir la posibilidad de penetración del esperma al óvulo ( 6 ).

En conclusión, las infecciones principalmente por micoplasmas genitales y C. trachomatis influyen de manera significativa en la morfología espermática. Muchas infecciones causadas por estos microorganismos persisten por períodos largos y asintomáticas en su mayoría; por lo que la incidencia de parejas infectadas no puede ser estimada.

Por lo anterior nosotros proponemos que la búsqueda de C. trachomatis y micoplasmas deben ser incluidas en procedimientos de rutina en hombres que cursan con problemas de infertilidad.

BILBIOGRAFÍA

1. C.E., Wang. SP., Roberts, P.L. and Berger R.E. The relationship of infection with Chlamydia trachomatis to the parameters of male infertility and sperm autoimmunity. Fertil Steril 1987; 40:880-883.

2. Comhaire FH, Verschraegen G., Vermeulen L. Diagnosis of accesory gland infection and its possible role in male infertility. Int J Androl 1980; 3:32-45.

3. Brunner H, Weidner W., Schiefer HG. Studies on the role of U. urealyticum and M. hominis in prostatitis. J Infect Dis 1983; 147:807-13.

4. Bruce AW, Reid G. Prostatitis associated with Chlamydia trachomatis in 6 patients. J Urol 1989; 142:1006-7.

5. Wolff H. Neubert U, Zebhauser M, Bezold G, Korting HC, Meurer M. Chlamydia trachomatis induces an inflammatory response in the male genital tract and is associated with altered semen quality. Fertil Steril 1991; 55:1017-9.

6. Soffer Y, Ron-EI R, Golan A, Caspi E, Samra Z. Male genital mycoplasmas and Chlamydia trachomatis culture: its relationship with accessory gland function, sperm quality and autoimmunity. Fertil Steril 1990; 53:331-6.

7. Johannes W. Trum, M.D., Ben W.J. Mol, M.D., Yvonne Pannekoek, Ph.D., Lodewijk Spanjaard, Ph.D., Paulien Wertheim Ph.D., Otto P. Bleker, Ph.D., and Fulco van der Veen, Ph.D. Value of detecting leukocytospermia in the diagnosis of genital tract infection in subfertile men. Fertil Steril 1998; 70:315-319.

Bacterias en la leche materna

La leche materna, el principal alimento de los recién nacidos, contiene una mayor diversidad microbiana de lo que se pensaba. En concreto, un grupo de investigadores españoles ha identificado más de 700 bacterias mediante una técnica basada en la secuenciación masiva de ADN. Gracias a este trabajo, cuyos resultados se han publicado en la revista científica American Journal of Clinical Nutrition, se pueden determinar las variables perinatales y postnatales que influyen en la riqueza microbiana de la leche.

«Es uno de los primeros trabajos en describir esta diversidad mediante la técnica de pirosecuenciación, una tecnología que determina la secuencia de ADN a gran escala, en muestras de calostro, por un lado, y de leche madura, por otro, que fueron recogidas después de uno y seis meses de lactancia materna», según explican los coautores del estudio, María Carmen Collado, del Instituto de Agroquímica y Tecnología de los Alimentos, y Álex Mira, del Centro Superior de Investigación en Salud Pública.

El trabajo revela que la leche de las mujeres con sobrepeso y la de las que ganan más kilos de los recomendados durante el embarazo contiene menos diversidad de especies de bacterias. Las madres que son sometidas a cesáreas programadas también producen para sus bebés una leche más pobre en microorganismos Estos resultados sugieren que el estado hormonal de la madre ante el parto también desempeña un papel a la hora de generar bacterias transmitidas a la leche.

Los investigadores intentarán determinar ahora los organismos que son beneficiosos para el metabolismo y el sistema inmunitario del recién nacido, que podrían añadirse a la alimentación infantil para, por ejemplo, protegerlos frente a las alergias.

Microbiólogo cree que su bacteria fue la responsable de la extinción del pérmico

Enlace aquí.

David Posada, bioinformático

Trabaja en la Universidad de Vigo. Aquí su página web.