martes, 10 de enero de 2023

Purificación de bacteriófagos con gradiente de sucrosa

Rotor SW32 Ti de tubos basculantes

1 Centrifugamos el lisado en la centrífuga a 5000 rpm, 5 min, 4ºC. Tomamos el sobrenadante que es donde se encuentran los virus

2 Añadimos Triton X-100 a los sobrenadantes del lisado hasta obtener una concentración final del 1 % (de un stock al 10 ó 20 %). Triton X100: es un detergente no iónico usando para desnaturalizar membranas de células sin desnaturalizar la proteína. De esta manera lisamos las células que pudiese haber todavía en el primer sobrenadante

3 Centrifugamos el lisado en la ultracentrífuga de tubos basculantes a 17 000 rpm, 50 min, 4 ºC. Deseche los sobrenadantes.

4 Vuelva a suspender los sedimentos de virus con un pequeño volumen de Tris-HCl 50 mM, pH 7,8

*Aproximadamente 1,0 mL por 100 mL de lisado

5 Coloque la suspensión de virus en capas sobre gradientes lineales de sacarosa de 100-400 mg/mL (10-40 %) equilibrados con Tris-HCl 50 mM fabricado en tubos de polipropileno (capa de aproximadamente 3-4 ml por gradiente).

*Para hacer el stock de sacarosa, agregue 10-40% de sacarosa a Tris-HCl y autoclave.

6 Centrifugar los gradientes en la ultracentrífuga a 20.000 rpm, 20 min, 4ºC. El virus será la banda principal alrededor de 1/2 a 2/3 de profundidad en el degradado.

7 Retire las bandas de virus de los gradientes con agujas estériles y se transfieren a tubos de centrífuga de polipropileno de 30 ml. Diluya lentamente el virus al volumen del tubo con Tris-HCl 50 mM. Centrifugar los tubos en el ultracentrífuga a 27.000 rpm, 3 horas, 4ºC. Deseche los sobrenadantes.

8 Vuelva a suspender el pellet en donde se encuentran los virus con un pequeño volumen de Tris-HCl 50 mM. Conservar el virus a 4ºC. No congelar. Esterilización por filtración con filtros de celulosa de 0,45 um

Para saber más: 

https://www.beckman.es/resources/reading-material/interviews/fundamentals-of-ultracentrifugal-virus-purification

https://biomodel.uah.es/tecnicas/centrif/inicio.htm

Streptococcus mutans cabalga a lomos del hongo Candida albicans

La bacteria Streptococcus mutans se asocia al y el hongo Candida albicans en las bocas de los niños con mala higiene bucal. Streptococcus mutans, la bacteria que causa las caries, literalmente cabalga montado encima del hongo. El hongo, al crecer, arrastra a Streptococcus mutans, una bacteria que carece de medios de locomoción

 

Referencias: 

Zhi Ren, Hannah Jeckel, Aurea Simon-Soro, Hyun Koo et al. Interkingdom assemblages in human saliva display group-level surface mobility and disease-promoting emergent functions. PNAS (2022). DOI: https://doi.org/10.1073/pnas.2209699119

lunes, 9 de enero de 2023

Malaria y su dispersión por la migración venezolana

Arnoldo Gabaldón (1909-1990), fue un  médico e investigador venezolano. Está considerado uno de los más importantes epidemiólogos del siglo XX, desarrolló un programa contra la malaria que eliminó la enfermedad en las dos terceras partes del territorio venezolano.

miércoles, 4 de enero de 2023

Protozoos que se alimentan de virus

 Halteria y Paramecium son protozoos que se alimentan filtrando virus del agua. Es una estrategia similar a las de las ballenas que se alimentan de krill. Cuando pensamos en depredación se nos viene a la mente el león persiguiendo a la gazela. Sin embargo, tenemos ejemplos como el de la ballena y el krill o el recientemente descrito de los protozoos alimentándose de virus: un depredador muy grande respecto a su presa. Existen ejemplos inversos, en donde el depredador es más pequeño que la presa: los virus líticos (1) por ejemplo, o la bacteria Legionella pneumophila que devora por dentro a la ameba, un depredador de bacterias. 

«Para quedarte donde estás tienes que correr lo más rápido que puedas. Si quieres ir a otro sitio, deberás correr, por lo menos, dos veces más rápido». La Reina Roja en A través del espejo y lo que Alicia encontró allí (Lewis Carroll, 1871).

¿Depredar presas diminutas como estrategia para escapar de la carrera de armamentos?

En evolución se maneja la hipótesis de la Reina Roja para explicar la "carrera de armamentos" entre especies. El conejo evoluciona aumentando su velocidad para escapar del ataque del zorro, y el zorro evoluciona aumentando su velocidad para alcanzar al conejo. Esta evolución es constante, en caso de que uno de los dos deje de evolucionar, se producirá su extinción. La depredación de presas diminutas se escaparía de esta coevolución tipo hipótesis de la Reina Roja

(1) Los virus escogieron dos vías para gestionar el espacio de la célula procariota: la vía lítica y la vía lisogénica. La vía lítica es una competición por el espacio clarísima. El virus entra en la célula, se replica y la revienta. La vía lisogénica es una vía parasítica porque el virus inserta su material genético en el de la célula hospedadora. De esa manera, virus y bacteria comparten un espacio común. La definición de parásito en cuanto a cómo se gestiona el espacio. 

Referencias:

https://doi.org/10.1073/pnas.2215000120

https://www.lavanguardia.com/natural/20230103/8666635/primer-virovoro-conocido-pequeno-ciliado-saltarin-halteria-vive-crece-comiendo-virus.html

https://quo.eldiario.es/ciencia/q2212503717/descubierto-el-primer-virovoro-un-organismo-que-se-alimenta-de-virus/