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martes, 27 de febrero de 2024

Legionella pneumophila ¿Depredador o parásito?

 ¿Pueden caminar los hongos?

La respuesta es ¡Si!, utilizando un exoesqueleto. Puede ser de una araña, de una horminga...

Video 1. Un hongo parásito andando utilizando el exoesqueleto de una araña muerta.

En el video 1, la araña está muerta. Lo que controla la araña es un hongo, que subirá a un sitio alto para soltar las esporas e infectar a otros insectos.

¿Cómo diferenciamos a un depredador de un parásito?

El parásito intenta que su hospedador sobreviva el mayor tiempo posible. Para ello, suele vivir en o dentro del hospedador. Hay un conocimiento íntimo del hospedador. El primer paso siempre implica una zombificación de la víctima. En la depredación, el depredador mata a varios organismos (presas) a lo largo de su ciclo vital, con el fin de alimentarse. A diferencia de los parásitos, un depredador no busca mantener con vida a sus presas demasiado tiempo. No los zombifica.

Cuando Legionella pneumophila se deja devorar por un macrófago ¿Está siendo un depredador o un parásito?

Ciclo de Legionella pneumophila. Fuente. La absorción bacteriana tiene lugar mediante enrollamiento o fagocitosis convencional. Poco después de ingresar a la célula hospedadora, L. pneumophila pierde sus flagelos y la vacuola que contiene Legionella (LCV) escapa de la vía endocítica mediante el reclutamiento mediado por efectores de vesículas derivadas del retículo endoplásmico (RE) y una asociación transitoria con las mitocondrias. Posteriormente, el LCV se llena de ribosomas y efectores y se produce una replicación exponencial (fase replicativa). Tras el agotamiento de los nutrientes del huésped, L. pneumophila desarrolla flagelos (fase transmisiva) y sale de la célula hospedadora.

El íntimo conocimiento de la biología celular de las células fagocíticas hace de Legionella pneumophila un parásito. No es un depredador sensu stricto. Si tuviésemos que escoger, ¿Con qué igualaríamos a esta bacteria, con un ladrón o con un embaucador? Pues eso. El criminal es un depredador y el embaucador (timador) es un parásito porque conoce y manipula. 

miércoles, 4 de enero de 2023

Protozoos que se alimentan de virus

 Halteria y Paramecium son protozoos que se alimentan filtrando virus del agua. Es una estrategia similar a las de las ballenas que se alimentan de krill. Cuando pensamos en depredación se nos viene a la mente el león persiguiendo a la gazela. Sin embargo, tenemos ejemplos como el de la ballena y el krill o el recientemente descrito de los protozoos alimentándose de virus: un depredador muy grande respecto a su presa. Existen ejemplos inversos, en donde el depredador es más pequeño que la presa: los virus líticos (1) por ejemplo, o la bacteria Legionella pneumophila que devora por dentro a la ameba, un depredador de bacterias. 

«Para quedarte donde estás tienes que correr lo más rápido que puedas. Si quieres ir a otro sitio, deberás correr, por lo menos, dos veces más rápido». La Reina Roja en A través del espejo y lo que Alicia encontró allí (Lewis Carroll, 1871).

¿Depredar presas diminutas como estrategia para escapar de la carrera de armamentos?

En evolución se maneja la hipótesis de la Reina Roja para explicar la "carrera de armamentos" entre especies. El conejo evoluciona aumentando su velocidad para escapar del ataque del zorro, y el zorro evoluciona aumentando su velocidad para alcanzar al conejo. Esta evolución es constante, en caso de que uno de los dos deje de evolucionar, se producirá su extinción. La depredación de presas diminutas se escaparía de esta coevolución tipo hipótesis de la Reina Roja

(1) Los virus escogieron dos vías para gestionar el espacio de la célula procariota: la vía lítica y la vía lisogénica. La vía lítica es una competición por el espacio clarísima. El virus entra en la célula, se replica y la revienta. La vía lisogénica es una vía parasítica porque el virus inserta su material genético en el de la célula hospedadora. De esa manera, virus y bacteria comparten un espacio común. La definición de parásito en cuanto a cómo se gestiona el espacio. 

Referencias:

https://doi.org/10.1073/pnas.2215000120

https://www.lavanguardia.com/natural/20230103/8666635/primer-virovoro-conocido-pequeno-ciliado-saltarin-halteria-vive-crece-comiendo-virus.html

https://quo.eldiario.es/ciencia/q2212503717/descubierto-el-primer-virovoro-un-organismo-que-se-alimenta-de-virus/

jueves, 12 de mayo de 2022

Detección de Legionella pneumophila por amplificación isoterma LAMP

En España es frecuente, sobre todo en verano, leer en la prensa que en determinada ciudad ha habido un brote de Legionella pneumophila. Suele causar alarma porque L. pneumophila es una bacteria que tiene una tasa de mortalidad elevada, entre 15-25% si afecta a pacientes inmunocomprometidos, fumadores, ancianos... El procedimiento es siempre el mismo: se busca por torres de refrigeración de centros comerciales, hospitales... El CDC nos informa que son en las torres de refrigeración, que emplean agua para enfriar el aire, en donde, por ausencia de limpieza puede crecer Legionella pneumophila. Los aires acondicionados caseros, o de los automóviles, no emplean agua para refrigerar por lo que no pueden ser fuentes de Legionella.


Para detectar Legionella se puede usar amplificación por LAMP, PCR o cultivo en medio selectivo. De los tres el más sensible es la amplificación isoterma LAMP.

También se puede detectar por real-time PCR.

Para identificar a Legionella pneumophila se emplea el gen mip (gene ID LPG_RS03920  Protein accesion Q5ZXE0.2). Este gen codifica para una proteína que potencia la infección de la bacteria en macrófagos.

>NC_002942.5:866850-867551 Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Philadelphia 1, complete sequence


ATGAAGATGAAATTGGTGACTGCAGCTGTTATGGGGCTTGCAATGTCAACAGCAATGGCTGCAACCGATGCCACATCATTAGCTACAGACAAGGATAAGTTGTCTTATAGCATTGGTGCCGATTTGGGGAAGAATTTTAAAAATCAAGGCATAGATGTTAATCCGGAAGCAATGGCTAAAGGCATGCAAGACGCTATGAGTGGCGCTCAATTGGCTTTAACCGAACAGCAAATGAAAGACGTTCTTAACAAGTTTCAGAAAGATTTGATGGCTAAGCGTACTGCTGAATTCAATAAGAAAGCGGATGAAAATAAAGTAAAAGGGGAAGCCTTTTTAACTGAAAACAAAAACAAGCCAGGCGTTGTTGTATTGCCAAGTGGTTTGCAATACAAAGTAATCAATTCTGGAAATGGTGTTAAACCCGGAAAATCGGATACAGTCACTGTCGAATATACTGGTCGTCTGATTGATGGTACCGTTTTTGACAGTACCGAAAAAACTGGTAAGCCAGCAACGTTCCAGGTTTCACAAGTTATCCCTGGATGGACAGAAGCTTTGCAATTGATGCCAGCTGGATCAACTTGGGAAATTTATGTTCCCTCAGGTCTTGCATATGGCCCACGTAGCGTTGGCGGACCTATTGGCCCAAATGAAACTTTAATATTTAAAATTCACTTAATTTCAGTGAAAAAATCATCTTAA

Página con programa para generar el complementario y el reverso del ADN https://www.bioinformatics.org/sms/rev_comp.html

Página con programa para diseñar los primers LAMP https://lamp.neb.com/