miércoles, 14 de noviembre de 2012

Para los que no se creen los beneficios de las vacunas

Se puede observar que el número de casos se desploma justo al introducir la vacuna. Podríamos deducir que la reducción en el número de muertes se debe a la mejora en los cuidados hospitalarios que benefició a los enfermos de sarampión, mientras que la reducción del número de casos se debió a la vacuna. Para cualquier persona sensata, esto tendría sentido.

Hoy en radio Actuaciencia a las 8 de la tarde hablaremos, el Dr Carlos Arita y yo de las vacunas y de aquellos que no creen en ella (http://cuacfm.org/http://cuacfm.org/).

Podéis escuchar aquí el audio




¿Cómo es posible que el nacimiento de un ser humano se haya convertido en una operación de quirófano?

La respuesta es muy sencilla, porque preferimos que sean solo 4 de nuestros hijos que mueran por cada mil nacimientos, a que sean 21, y eso solo desde el año 1970. 

¿Estamos abusando de cesareas, epistotomías...?, de acuerdo, pero recordad siempre que medicalizar el parto ha salvado vidas.


Por fin: Brutal Bakteria

Ya hay un coleccionable de bacterias en los kioskos: se llama BRUTAL BAKTERIA "Collect them all". Aquí podéis ver un vídeo en italiano. El sobrecito trae una carta, tres pegatinas y una bacteria. 3 eurazos, en el año 2000 serían 500 ptas. En 2012 compras un sobre con un trozo de goma. Menudo timazo. Eso si, a mis hijos de han encantado por que son viscosas y han oído hablar de las bacterias en casa y son un poco como de la familia.


 Aquí mi hija tuvo una idea fantástica: colocar las bacterias en su ecosistema humano. Escherichia coli está en los intestinos y Chlamidia trachomatis en la vagina. E. coli es la bacteria de nuestros intestinos y cuando Chlamidia vive en la vagina puede causar ceguera a los recién nacidos.
La Chlamidia aún menos mal, pero E. coli parece recién sacado de la charcutería.

domingo, 11 de noviembre de 2012

Galaxy

https://main.g2.bx.psu.edu/

Vamos a trabajar con un gen bacteriano. El gen que codifica para la subunidad GyrA de la proteína gyrasa de Streptococcus pneumoniae.



La secuenciación de este gen se publicó en el siguiente artículo, del que soy coautor. Para acceder a la secuencia de este gen podemos estar en la base de datos Genbank y se accede con este identificador: AF053121.

Aquí podemos ver la secuencia de aminoácidos que codifica este gen:


MQDKNLVNVNLTKEMKASFIDYAMSVIVARALPDVRDGLKPVHRRILYGMNELGVTPDKP
HKKSARITGDVMGKYHPHGDSSIYEAMVRMAQWWSYRYMLVDGHGNFGSMDGDSAAAQRY
TEARMSKIALEMLRDINKNTVDFVDNYDANEREPLVLPARFPNLLVNGATGIAVGMATNI
PPHNLGETIDAVKLVMDNPEVTTKDLMEVLPGPDFPTGALVMGKSGIHKAYETGKGSIVL
RSRTEIETTKTGRERIVVTEFPYMVNKTKVHEHIVRLVQEKRIEGITAVRDESNREGVRF
VIEVKRDASANVILNNLFKMTQMQTNFGFNMLAIQNGIPKILSLRQILDAYIEHQKEVVV
RRTRFDKEKAEARAHILEGLLIALDHIDEVIRIIRASETDAEAQAELMSKFKLSERQSQA
ILDMRLRRLTGLERDKIQSEYDDLLALIADLADILAKPERVSQIIKDELDEVKRKFSDKR
RTELMVGQVLSLEDEDLIEESDVLITLSNRGYIKRLDQDEFTAQKRGGRGVQGTGVEDDD
FVRELVSTSTHDHLLFFTNKGRVYRLKGYEIPEYGRTAKGLPVVNLLKLDEDESIQTVIN
VESDRSDDAYLFFTTRHVLLKRTSVKEFANIRQNGLKALNLKDEDELINVLLAEGDMDII
IGTKFGYAVRFNQSAVRGMSRIATGVKGVNLREGDTVVGASLITDQDEVLIITEKGYGKR
TVATEYPTKGRGGKGMQTAKITEKNGLLAGLMTVQGDEDLMIITDTGVMIRTNLANISQT
GRATMGVKVMRLDQDAQIVTFTTVAVAEKEEVGTENETEGEA

y también la secuencia nucleotídica:

 1   ttttaaaaaa  ctttgtcacg  aatatgcctt  atagttctcg  atgtaaacgt  tttagtggtt

  61   tagaggctga  aatagacggg  aatttatggt  ataatgttgt  tacttactaa  ttgtgaaatg

 121   aggcatttat  taatgcagga  taaaaattta  gtgaatgtca  atctgacaaa  ggagatgaag

 181   gcaagtttta  tcgactacgc  catgagtgtt  atcgtagcgc  gagctcttcc  tgatgttcga

 241   gatggcttaa  aacctgttca  ccgtcgcatt  ctctacggaa  tgaatgaatt  gggtgtgacc

 301   ccagacaaac  cccataaaaa  atctgctcgt  attacagggg  atgtcatggg  taaataccac

 361   ccacacgggg  attcctctat  ttatgaagcc  atggtccgta  tggctcaatg  gtggagctac

 421   cgttacatgc  ttgtagatgg  tcatgggaat  tttggttcca  tggatggaga  tagtgctgcc

 481   gctcaacgtt  ataccgaggc  acgtatgagc  aagattgctc  tggaaatgct  tcgtgatatc

 541   aacaaaaata  cagttgattt  cgttgataac  tatgatgcca  atgaacggga  acccttggtc

 601   ttgccagcgc  gttttccaaa  ccttttggtt  aatggagcaa  ctggtatcgc  ggttgggatg

 661   gcaaccaata  ttccacctca  taatctgggt  gaaaccattg  atgcagtgaa  gttggtcatg

 721   gataatcctg  aagtgactac  caaggacttg  atggaagtct  tgcctggacc  agattttcca

 781   actggtgctc  ttgtcatggg  gaaatcaggt  atccataagg  cttatgaaac  aggtaaaggt

 841   tcgattgtcc  tacgttctcg  tacagagatt  gaaacgacta  agactggtcg  tgagcgtatc

 901   gttgtaacag  aatttcctta  catggtcaat  aaaaccaagg  tgcatgagca  tattgttcgc

 961   ttggttcagg  aaaaacgcat  tgagggtatc  acagcagtac  gtgatgagtc  aaaccgtgaa

1021   ggtgttcgat  ttgttattga  agtcaagcgc  gacgcctcag  ccaatgttat  tctcaataac

1081   ctcttcaaaa  tgacccaaat  gcaaaccaat  tttggtttca  atatgctcgc  tatccaaaat

1141   ggtataccga  aaattttgtc  tcttcgtcag  attttggatg  cttatattga  gcaccaaaaa

1201   gaagtggttg  ttcgtcgtac  acgttttgat  aaggaaaaag  cggaagcgcg  cgctcatatc

1261   ttagaaggtc  tcttgattgc  gctagaccat  atcgacgaag  tgattcgtat  catccgtgct

1321   agtgaaacgg  atgcggaagc  tcaagctgag  ttgatgagca  agtttaagct  ttctgaacgt

1381   caaagtcaag  ctatccttga  tatgcgtctt  cgccgtttga  caggtttgga  acgcgataag

1441   attcaatctg  agtatgatga  cctcttggct  ctgattgcgg  atttagcaga  tattcttgct

1501   aagcctgaac  gtgtttctca  aattatcaaa  gacgaattgg  atgaagttaa  acgtaaattt

1561   tctgataaac  gccgtacaga  gttgatggtt  ggacaggtct  tgagtctcga  ggatgaggac

1621   ttgattgaag  aatcggatgt  cttgattacc  ctttctaaca  gaggctacat  taagcgtttg

1681   gatcaggacg  agttcactgc  tcaaaaacgt  gggggtcgtg  gtgtccaagg  aacgggagta

1741   gaagatgatg  actttgttcg  tgagttagtg  tcaactagta  cccatgatca  tctgctcttc

1801   ttcacaaaca  agggacgtgt  ctatcgtctt  aaaggttatg  aaattcctga  gtatggtcgg

1861   actgccaaag  ggctaccagt  agtcaatctc  ttgaaattgg  atgaagacga  aagtattcag

1921   acggttatca  atgttgagtc  tgatcgcagt  gatgatgctt  atctcttctt  tacaacccgt

1981   cacgtattgt  tgaagagaac  cagtgttaag  gagtttgcca  atattcgtca  aaatggtctc

2041   aaagcgctga  atttaaagga  tgaagatgag  ttaatcaatg  tcttgttggc  agaaggagat

2101   atggatatta  tcattggtac  caagtttggt  tatgcagttc  gctttaatca  atcagccgtt

2161   cgtggtatga  gccgtatcgc  cactggtgtg  aaaggtgtta  accttcgtga  aggagacaca

2221   gttgttggtg  ccagcttgat  tactgatcaa  gatgaggttc  ttattatcac  agaaaaagga

2281   tatggtaagc  gtacagtcgc  tactgaatac  ccaacaaaag  gtcgtggtgg  taagggaatg

2341   cagacagcta  aaattaccga  aaaaaatggc  ttgctggccg  gtcttatgac  tgttcaaggg

2401   gatgaggatt  tgatgattat  cactgataca  ggtgtcatga  ttcgaaccaa  tcttgccaat

2461   atttcacaaa  caggacgtgc  aactatggga  gttaaagtaa  tgcgcctgga  tcaagatgct

2521   cagatagtga  ctttcacaac  ggttgcggtg  gcagaaaaag  aagaagttgg  gacagaaaac

2581   gaaacagaag  gtgaagcata  atgtctcaaa  aaaataataa  aaagaaaaac  aagcgaaaaa

2641   atctgctgac  aaatatccta  gcaggatttc  tgatattact  gtcac  

La proteína que codifica este gen es la GyrA, una subunidad de la enzima gyrasa. Esta enzima lo que hace es enrrollar el ADN cuando este está relajado.




Ombligo: la jungla microbiana


No hace falta ir al Amazonas para descubrir un ecosistema desconocido y rico en biodiversidad, basta levantarse la camiseta y estudiar el ombligo, cuya vida se parece más de lo que podemos imaginar a la de una selva tropical. Un grupo de investigadores de siete universidades de EEUU cultivaron y analizaron 60 muestras tomadas de ombligos humanos, en los que encontraron más de 2.300 especies de bacterias, según publican en la revista PlosOne.
Que la piel humana está habitada por billones de microorganismos no es ningún descubrimiento, pero al analizar los datos los científicos se encontraron con la sorpresa de que las bacterias presentes en distintos ombligos diferían más de lo esperado. «Al estudiar los ombligos vimos una inquietante e inmensa riqueza de vida, el ombligo medio hospedaba alrededor de 50 especies y entre distintos ombligos encontramos miles de especies», escribe en la revista Scientific American el biólogo de la Universidad Estatal de Carolina del Norte (EEUU) Rob Dunn, quien ha liderado el estudio.
«Los ombligos me recordaban a un bosque tropical», explica Dunn, por la correspondencia con la llamada «hipótesis oligárquica» de la ecología.
Según la hipótesis, en las selvas hay una gran diversidad de especies de árboles, pero hay una serie de especies, conocidas como «oligarcas», que están presentes en la mayoría de bosques y son más comunes allí.
El ombligo también tendría sus «oligarcas», pues solo ocho bacterias estaban presentes en más de un 70 % de las muestras tomadas en el estudio, y casi la mitad de todas las bacterias encontradas en las muestras son de esas ocho especies. Así, las bacterias más frecuentes tienden a ser las más abundantes, pero ninguna de las más de 2.300 especies se encontró en todos los ombligos.
Los investigadores también destacan el hallazgo, «por primera vez en la piel humana», de tres especies de arqueas, microorganismos que suelen vivir en ambientes extremos como géiseres o aguas ácidas; dos de esas tres especies se encontraron en el ombligo de un hombre que aseguró no haberse bañado en «bastantes años».
Concluyen que «sigue siendo difícil predecir qué especies de bacteria se pueden encontrar en un ser humano en particular, predecir qué especies son más frecuentes (o raras) parece más sencillo, al menos para aquellas especies que viven en ombligos». El estudio forma parte del proyecto «Belly Button Biodiversity (BBB)» -Biodiversidad del ombligo-, una iniciativa de la Universidad Estatal y Museo de Ciencias Naturales de Carolina del Norte (EEUU), que pretende explorar y dar a conocer «la jungla microbiana» que todos llevamos sobre la piel.

Estudian el ombligo como ejemplo de la biodiversidad de la piel porque la marca del nacimiento es un refugio más seguro -más aislado y dónde seguramente frotamos menos en la ducha- para los microbios. Microbios que, como recuerdan desde el BBB, «en su mayoría no son malos». «Tu cuerpo alberga especies que ningún científico ha estudio, tu ombligo puede ser una de las últimas fronteras biológicas», dicen en su página web.

sábado, 10 de noviembre de 2012

La selección de grupo no existe, pero yo creo en ella


La teoría evolutiva dice que la selección opera sólo sobre individuos, no sobre grupos. Bien, quizás por que lo único que tiene importancia en evolución son las células sexuales y su continuidad en el tiempo. La selección natural selecciona las combinaciones genéticas que surgen del sexo. Hay combinaciones que van a tener más éxito que otras. Lo único que tiene sentido temporal es la transmisión de las células sexuales a la siguiente generación. Es cierto. La biología está reducida a que somos protozoos (las gónadas) protegidas por carcasas pluricelulares que eventualmente se convierten en cadáveres.
Pero esas carcasas pluricelulares tienen entidad, son entidades sociales y como entidades sociales están sujetas a su propia evolución, aunque la teoría evolutiva no las contemple. Este pensamiento es heterodoxo, no sustentado por la ciencia, pero no por ello voy a dejar de decir que creo en él.

¿Qué tienen en común Morazán, Jean Jaurés y todos los que lucharon para que en Inglaterra, Francia etc hubiese una ley común y no derechos independientes para la aristocracia y el clero?

Que creían que la mayoría tenía derecho sobre los derechos de los grupos de poder.

El grupo de poder es la fuerza del rebaño. La fuerza del rebaño se manifiesta en que un tipo se decide a solicitar un préstamo a 40 años, un préstamo completamente contrario a sus intereses, sólo porqué su vecino lo está solicitando. Cirujanos a los que se les supone una inteligencia solicitando dos créditos para comprar dos casas por que le convencen que una de las casas, como van a subir de precio va  a financiar la compra de la segunda. Todos pedían créditos y él también.

Los sistemas de encomiendas de la corona española estaban en manos de familias vascas. Unos clanes,  unidos por lazos de sangre e identidad común se hacen con el control de un sistema social. Se ha visto innumerables veces. Se habla de los judíos, pues resulta que en Honduras los clanes que controlan la economía son los famosos "turcos". Personas que entraron en el país a principios del siglo XX con pasaporte turco. En realidad los turcos son palestinos. Minoría en Honduras que se ha hecho con el poder del país. Los parsis en la India, los coptos en Egipto etc

En Europa había dos grupos importantes: la aristocracia, unidos por lazos de sangre, tenían sus raíces genealógicas enterradas en aquellos grupos de nórdicos que habían invadido el Imperio Romano, o en el caso inglés, de los normandos, de origen escandinavo, que vivían en Normandía y que invadieron Inglaterra soyuzgando a anglos y sajones. El otro grupo corresponde a aquellas familias ligadas a Roma y que con el colapso del imperio deciden "colocar" a sus hijos en el sistema de administración de la iglesia. Un sistema calcado del sistema tardo-imperial. Estos dos grupos, y su derecho asociado, el derecho nobiliario y el canónigo entran en conflicto en la Francia de la ilustración.

Jean Jaurés, socialista, intenta que la juventud europea no vaya a la matanza de la primera guerra mundial. Una matanza organizada por los ajustes de unas monarquías de penachos de plumas incompatibles con la organización de una Europa moderna. Los movimientos obreros y socialistas en contra de sus principios acaban resolviendo ponerse del lado de sus respectivos países. Acabaron en las trincheras muriendo por millones. Las familias aristocráticas siguieron reproduciéndose.

Morazán, intenta defender la Federación Centroamericana, una federación con separación de estado iglesia. Se lo cargan y las élites locales crean las repúblicas bananeras apoyadas por el capital extranjero. Esas élites se reproducen en sus urbanizaciones privadas con vigilancia mientras los genocidios de indios se convierten en algo crónico en sus países.

Obviamente, esta parte de la historia no se puede relacionar fácilmente con la transmisión de información hereditaria a la siguiente generación. En parte por que no hay un marco de pensamiento aceptado para ello. "Y sin embargo se mueve" que diría Galileo.