domingo, 9 de febrero de 2014

Entrez Direct o como entrar con UNIX en las bases de datos del NCBI

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/news/02-06-2014-entrez-direct-released/?campaign=facebook-02072014
El NCBI ha lanzado Entrez Direct, un software nuevo que permite a los usuarios utilizar código UNIX para acceder directamente a las bases de datos NCBI, así como analizar y formatear los datos para hacer descargas personalizadas. 
Entrez Direct está disponible como un simple FTP download y aporta documentation en su sitio web. El paquete consta de un master script en Perl y varios scripts shell en UNIX que sirven como interface para los scripts de PERL. Entrez Direct correrá en ordenadores UNIX o Mac que tengan Perl instalado y bajo Cygwin que es un programa que simula UNIX en un entorno Windows.
La Entrez Direct documentation proporciona varios ejemplos de como funcionan los programas que están disponibles y proporcionan tres ejemplos adicionales.

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