En la Universidad de San Francisco de Quito tienen un buen departamento de microbiología dirigido por Gabriel Trueba con el que tengo el placer de colaborar.
Escribo para mí, para recordar algunas ideas que me interesan. Con el tiempo he descubierto que existe más o menos un nexo común en esas ideas. Aviso: Este blog no es un consultorio de salud.
domingo, 5 de octubre de 2014
Instituto de Microbiología de la USFQ
En la Universidad de San Francisco de Quito tienen un buen departamento de microbiología dirigido por Gabriel Trueba con el que tengo el placer de colaborar.
sábado, 4 de octubre de 2014
Conoce la microbiota (con el yogur Toni)
Un estudio publicado por el grupo de Fernando Baquero, Jefe del Servicio de Microbiología del Hospital Ramón y Cajal de Madrid mostró que la influencia en la microbiota humana de los Lactobacillus ingeridos mediante yogures bebibles era insignificante. La mayoría se morían en el ácido del estómago y los que sobrevivían eran un número muy bajo comparados con los millones de millones de bacterias que ya existen en nuestro tracto intestinal. Beber yogures con Lactobacillus es muy beneficioso, sin embargo, después de un tratamiento antibiótico ya que ayudan a repoblar la flora intestinal.
http://www.nutricionhospitalaria.com/pdf/6540.pdf
Hoy en día los fabricantes de yogures echan mano de la microbiología para ayudar a vender su producto. Hace veinte años se anunciaban yogures con el reclamo de que tenían calcio, fosforo, proteínas y vitaminas. Estoy hablando de la publicidad de los Petit Suisse. El caso es vender y hoy la microbiota vende así que lo utilizan como reclamo. Comiendo verduras y fruta fresca también están dándole de comer microorganismos a sus hijos así que no se apuren si no tienen para pagar por el yogur Toni, cualquier otro alimento saludable servirá para que sus hijos estén bien alimentados.
viernes, 3 de octubre de 2014
Llega la vacunación de bacterias
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| Bacteriófagos inoculando su ADN (en azul) dentro de una bacteria. |
Leí con interés esta noticia en "BBC News", la titulaban como "Se ha creado una nueva clase de antibióticos", lo cual es erroneo. Lo que el profesor Timothy Lu de el "Synthetic Biology Center" del MIT (Massachusetts Institute of Technology) y su grupo han logrado es VACUNAR bacterias utilizando el sistema CRISPR-Cas. Vacunar no es tampoco la palabra exacta porque si la bacteria tiene ya en su cromosoma la secuencia del gen de resistencia que también está en el sistema CRISPR la bacteria morirá irremisiblemente. En ese caso no se puede hablar de vacuna porque las vacunas NO matan.
¿Cómo funciona el sistema CRISPR-Cas en este caso?
Metemos en el sistema CRISPR-Cas la secuencia de un gen de resistencia a los antibióticos. El sistema lo metemos en un virus bacteriófago. El bacteriófago introduce el sistema CRISPR-Cas dentro de la bacteria. Si la bacteria tiene en su interior, en su cromosoma o en una unidad extra de ADN como es un plásmido, el mismo gen de resistencia a antibiótico, este gen produce un ARN, que se va a hibridar con un ARN complementario producido por el sistema CRISPR-Cas. Cuando se produce esta hibridación el sistema degrada el ADN.
1.- Se diseña un sistema CRISPR que reconozca una secuencia determinada de ADN, en este caso, la secuencia de un gen de resistencia a los antibióticos.
2.- El sistema se introduce en la bacteria a través de un bacteriófago. Ojo, el bacteriófago es muy específico, con lo cual servirá sólo para aquellas bacterias a las que se pueda unir.
3.- Si en la bacteria hay un plásmido con un gen de resistencia que sea reconocido por el sistema CRISPR será destruído. Si el plásmido es fundamental para la supervivencia de la bacteria esta se morirá, si no es fundamental la bacteria sobrevivirá y se verá libre del plásmido.
4.- Si el gen de resistencia que reconoce el sistema CRISPR esta en el cromosoma, entonces mala suerte para la bacteria, el sistema CRISPR degradará el cromosoma bacteriano y la bacteria se morirá. En este caso no se puede decir que el sistema funcione como una vacunación :)
El artículo es interesante porque esta técnica "protege" a las bacterias de ciertos bacteriófagos. El enfoque que Citorik le da de "nuevo antimicrobiano" es desafortunado porque es un sistema que no protege al 100% como lo hace una antibiótico. Citorik en su artículo hace una comparación entre su sistema y un antibiótico de verdad, como es la carbanicilina, pero esta comparación la publica en materiales suplementarios.
Referencia:
Sequence-specific antimicrobials using efficiently delivered RNA-guided nucleases
Robert J Citorik, Mark Mimee & Timothy K Lu
Nature Biotechnology (2014) Published online 21 September 2014
Si pincháis aquí podéis descargaros el artículo original.
http://www.bbc.com/news/health-29306807
El primer zoo de microbios abre sus puertas en Amsterdam
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| Micropia, en Ámsterdam, es cosa seria. No sólo porque costó 10 millones de euros. Sus creadores aseguran que es un homenaje a los virus, hongos y bacterias, que representan dos tercios de los organismos vivos |
Los microbios constituyen dos tercios de los organismos vivos de la Tierra y son esenciales para el futuro del planeta. Ahora ya cuentan con su primer «zoo interactivo», que acaba de abrir sus puertas en Ámsterdam.
Según Haig Balian, director del Artis, los zoos «tienen tendencia a mostrar solo una parte de la naturaleza: los animales grandes, pero nosotros queremos mostrar la micronaturaleza». Balian afirma que la importancia de los microbios siempre se ha subestimado desde su observación en el siglo XVII por el que se considera padre de la microbiología, el holandés Antonie van Leeuwenhoek.
Los virus, hongos y bacterias se asocian con frecuencia a enfermedades. Pero también son esenciales para nuestra supervivencia. Y tendrán un papel cada vez más importante para el futuro de la humanidad y el planeta, según Haig Balian. «Los microbios están por todas partes. Por lo tanto, se necesitan microbiólogos capaces de trabajar en todos los sectores, por ejemplo en los hospitales, con la alimentación o en las industrias petrolera y farmacéutica», argumenta.
Hoy en día, los microorganismos se emplean para producir biocarburantes, desarrollar nuevos tipos de antibióticos o mejorar el rendimiento agrícola. Numerosas experiencias han confirmado su potencial para usos tan variados como la producción eléctrica, el fortalecimiento de las fundaciones de edificios o la lucha contra el cáncer.
«El interés por la microbiología nunca aumentará si la dejamos sumida en la oscuridad, abandonada en manos solo de unos expertos», sostiene Balian. «Queremos mostrar a los visitantes que todo está relacionado en la naturaleza y los microbios desempeñan un papel fundamental».
Cada humano adulto tiene alrededor de kilo y medio de microbios en el cuerpo y sin ellos se moriría. La mayor parte del zoo, que se presenta como el primero de este tipo en el mundo, se parece a un laboratorio. Varias filas de microscopios conectados a pantallas gigantes muestran todo tipo de microorganismos.
Más adelante, el visitante puede observar por una ventana un laboratorio de verdad en el que se cultivan diferentes variedades de microbios, o bien se encuentra ante un modelo gigante de virus ébola, que está causando estragos en África occidental.
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"Los
zoos tienen tendencia a mostrar solo una parte de la naturaleza, es
decir, los animales grandes", asegura a la AFP Haig Balian,
director del Artis : "Nosotros queremos mostrar hoy la
micronaturaleza"
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En la primera planta del zoo, una pantalla gigante instalada en el techo del ascensor muestra, en un ojo agrandado al máximo, todos los organismos que viven debajo de nuestros párpados. También es posible observar la reproducción de los microbios gracias a un microscopio 3D, especialmente concebido para el zoo, y pasar por el escáner de microbios, que indicará al visitante cuántos y dónde viven en él.
Los enamorados podrán besarse delante del «Kiss-o-Meter», que indica cuántos microbios se intercambian durante el beso. «¿Sabía usted que 700 especies de microbios viven en su boca? ¿O que 70 tipos de hongos viven en su talón?», sonríe Balian
jueves, 2 de octubre de 2014
miércoles, 1 de octubre de 2014
20 consejos para interpretar los datos científicos
Os dejo un artículo del periodista Antonio Martínez Ron.
http://culturacientifica.com/2013/12/05/veinte-consejos-para-interpretar-resultados-y-publicaciones-cientificas/
Hace dos días charlando con profesores de Yachay coincidimos en que muchos trabajos publicados en laboratorios de "grandes popes" de la ciencia había que cogerlos con pinzas. Laboratorios con 20 investigadores, todos ellos muy presionados por publicar y pobremente supervisados son una fuente de improvisación científica. A mi me gustaría que se hiciese una investigación comprobando como el ancho de la pirámide influye en el fraude científico. Por ancho de la pirámide me refiero a un pope, tres investigadores en plantilla pero que no son "corresponding author" innumerables postdocs y más graduates students.
http://culturacientifica.com/2013/12/05/veinte-consejos-para-interpretar-resultados-y-publicaciones-cientificas/
Hace dos días charlando con profesores de Yachay coincidimos en que muchos trabajos publicados en laboratorios de "grandes popes" de la ciencia había que cogerlos con pinzas. Laboratorios con 20 investigadores, todos ellos muy presionados por publicar y pobremente supervisados son una fuente de improvisación científica. A mi me gustaría que se hiciese una investigación comprobando como el ancho de la pirámide influye en el fraude científico. Por ancho de la pirámide me refiero a un pope, tres investigadores en plantilla pero que no son "corresponding author" innumerables postdocs y más graduates students.
Referencias
- Sutherland W.J., Spiegelhalter D. & Burgman M. (2013). Policy: Twenty tips for interpreting scientific claims, Nature, 503 (7476) 335-337. DOI: 10.1038/503335a ↩
Nitrosomonas eutrophas, transforman el amoniaco de nuestro sudor en nitrato
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| David Whitlock lleva 12 años sin ducharse gracias a Nitrosomonas eutrophas |
La
bruma bacteriológica, como su nombre indica se trata de pulverizar
sobre la piel y el cuero cabelludo una ligera capa de un líquido
habitado por billones de simpáticas Nitrosomonas eutrophas, unas
bacterias capaces de transformar el amoniaco de nuestro sudor en
nitrato. O, lo que es lo mismo, de ‘comerse’ aquellas
sustancias corporales que generan mal olor dejando la piel libre de
suciedad y de malos efluvios y con un aspecto envidiable. El punto de
partida es que estas bacterias solían vivir felices sobre nuestra
anatomía zampándose nuestros desechos antes de que nos dedicáramos a
exterminarlas con detergentes. Esos mismos agentes químicos que luego
acaban por resecar la piel y que obligan a aplicar una crema hidratante o
a buscar jabones orgánicos, aceites naturales y otros ungüentos que
re-equilibren el estado de la piel. El artífice del invento, el
científico David Whitlock, tomó su propia persona como conejillo de Indias y lleva doce años sin ducharse.
Así descubrió que esas bacterias brotan espontáneamente sobre la piel
cuando no abunda la higiene convencional y permiten que el cuerpo se
autolimpie. Y que son las mismas criaturas que viven en el barro o el
agua sucia (que es de donde extrae las necesarias para este cosmético).
Solo le quedaba aislarlas, cultivarlas en laboratorio y embotellarlas
listas para usar. Ahora se lava únicamente las manos con agua y jabón.
El resto es rancho para las bacterias. Y espera hacerse rico vendiendo
pulverizadores de nitrosomonas vivas.
El producto en cuestión se llama AO+ Refreshing Cosmetic Mist, de los laboratorios AOBiome, y acaba de ponerse a la venta. Cuesta 77 € para un mes y 194 € el lote para tres meses. Por supuesto, como si se tratara de un Birkin o un Kelly para el aseo corporal, ya hay lista de espera. No tanto porque la afluencia de peticiones sea tal que haya desbordado toda previsión, sino porque cada frasco lleva bacterias vivas y su ritmo de reproducción lleva un tiempo que no puede alterarse como si se tratara de una producción en cadena. Estos microorganismos resisten un mes a temperatura ambiente y hasta seis meses en la nevera. No hay duda de que se trata de un producto frágil, de ahí que, por ahora, solo esté disponible en Estados Unidos (país productor), Puerto Rico y Canadá. A los consumidores de cualquier otro punto del planeta no les queda otra que apuntarse en una lista de pre-venta. En cuanto se despache a otros lugares, serán los primeros en hacerse con su propia bruma bacteriológica.
Entonces, ¿adiós al baño para siempre? No del todo. Aunque el creador lleva más de una década sin pasar por la ducha y quienes lo conocen aseguran que no huele mal, lo cierto es que en la letra pequeña el AO+ se presenta como complemento de una higiene diaria convencional. Es más, se recomienda usarlo después de ducharse o antes de irse a la cama. La ducha ha de ser normal, con agua y jabón. Al acabar, hay que secarse y es entonces cuando se pulveriza la bruma. Quienes la han probado juran que parece agua. Ni huele ni deja huella. Una vez aplicada su misión será nutrirse del amoniaco de nuestro sudor mejorando, de paso, el aspecto y la salud de la piel. Y, con suerte, eliminar el olor. De hecho, en los estudios previos al lanzamiento, un tercio de quienes lo probaron reconocieron que les funcionaba como desodorante. Otra tercera parte, en cambio, afirmaba que el ‘aroma’ de sus axilas seguía siendo tan intenso que no había otra que echar mano del desodorante. No hay datos aún respecto al olor de pies.
Ya que parece que por ahora las nitrosomonas no van a desbancar al desodorante, el principal beneficio de este spray es equilibrar el pH normal de la piel (que debería ser de 5,5). Sin embargo, la mayoría de los jabones, geles y champús disponibles en el mercado suelen superar este valor y llegan a tener un pH de hasta12.38, cifras que arruinan el manto ácido protector de la piel y pueden causar irritaciones. Al aplicar el spray con sus bacterias amoniacales, se puede espaciar o disminuir el uso de estos productos de higiene corporal. Con esto, prometen desde AOBiome, se ahorra agua y disgustos al cuerpo. Si hay más ventajas, están por ver. Sus creadores incluso animan a los usuarios a probar a hacer más ejercicio para sudar más o a no lavarse para ver qué pasa. Por así decirlo, aunque está a la venta, anda aún en fase Beta.
Sabedores de que pensar en un ejército de bacterias campando a sus anchas sobre nuestra piel da repelús, desde el laboratorio lanzan el mensaje tranquilizador de se trata de un tipo de microorganismos no patogénicos (incapaces de causar una infección). Las nitrosomonas no pueden anidar en azúcares o proteínas, responsables de las funciones celulares más relevantes. Lo suyo es el amoniaco así que no hay riesgo de enfermar. De hecho, si antaño vivían sobre la piel de nuestros antepasados y estamos todavía sobre la faz de la Tierra, es porque no son letales para el humano. Y, ya puestos, si ha de llegar un apocalíptico final, que nos pille aseados.
El producto en cuestión se llama AO+ Refreshing Cosmetic Mist, de los laboratorios AOBiome, y acaba de ponerse a la venta. Cuesta 77 € para un mes y 194 € el lote para tres meses. Por supuesto, como si se tratara de un Birkin o un Kelly para el aseo corporal, ya hay lista de espera. No tanto porque la afluencia de peticiones sea tal que haya desbordado toda previsión, sino porque cada frasco lleva bacterias vivas y su ritmo de reproducción lleva un tiempo que no puede alterarse como si se tratara de una producción en cadena. Estos microorganismos resisten un mes a temperatura ambiente y hasta seis meses en la nevera. No hay duda de que se trata de un producto frágil, de ahí que, por ahora, solo esté disponible en Estados Unidos (país productor), Puerto Rico y Canadá. A los consumidores de cualquier otro punto del planeta no les queda otra que apuntarse en una lista de pre-venta. En cuanto se despache a otros lugares, serán los primeros en hacerse con su propia bruma bacteriológica.
Entonces, ¿adiós al baño para siempre? No del todo. Aunque el creador lleva más de una década sin pasar por la ducha y quienes lo conocen aseguran que no huele mal, lo cierto es que en la letra pequeña el AO+ se presenta como complemento de una higiene diaria convencional. Es más, se recomienda usarlo después de ducharse o antes de irse a la cama. La ducha ha de ser normal, con agua y jabón. Al acabar, hay que secarse y es entonces cuando se pulveriza la bruma. Quienes la han probado juran que parece agua. Ni huele ni deja huella. Una vez aplicada su misión será nutrirse del amoniaco de nuestro sudor mejorando, de paso, el aspecto y la salud de la piel. Y, con suerte, eliminar el olor. De hecho, en los estudios previos al lanzamiento, un tercio de quienes lo probaron reconocieron que les funcionaba como desodorante. Otra tercera parte, en cambio, afirmaba que el ‘aroma’ de sus axilas seguía siendo tan intenso que no había otra que echar mano del desodorante. No hay datos aún respecto al olor de pies.
Ya que parece que por ahora las nitrosomonas no van a desbancar al desodorante, el principal beneficio de este spray es equilibrar el pH normal de la piel (que debería ser de 5,5). Sin embargo, la mayoría de los jabones, geles y champús disponibles en el mercado suelen superar este valor y llegan a tener un pH de hasta12.38, cifras que arruinan el manto ácido protector de la piel y pueden causar irritaciones. Al aplicar el spray con sus bacterias amoniacales, se puede espaciar o disminuir el uso de estos productos de higiene corporal. Con esto, prometen desde AOBiome, se ahorra agua y disgustos al cuerpo. Si hay más ventajas, están por ver. Sus creadores incluso animan a los usuarios a probar a hacer más ejercicio para sudar más o a no lavarse para ver qué pasa. Por así decirlo, aunque está a la venta, anda aún en fase Beta.
Sabedores de que pensar en un ejército de bacterias campando a sus anchas sobre nuestra piel da repelús, desde el laboratorio lanzan el mensaje tranquilizador de se trata de un tipo de microorganismos no patogénicos (incapaces de causar una infección). Las nitrosomonas no pueden anidar en azúcares o proteínas, responsables de las funciones celulares más relevantes. Lo suyo es el amoniaco así que no hay riesgo de enfermar. De hecho, si antaño vivían sobre la piel de nuestros antepasados y estamos todavía sobre la faz de la Tierra, es porque no son letales para el humano. Y, ya puestos, si ha de llegar un apocalíptico final, que nos pille aseados.
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