jueves, 15 de abril de 2021

Por qué el SARS-CoV-2 lo tiene difícil para escapar de las vacunas

El Dr. Jiménez Clavero del INIA ha escrito un artículo muy interesante de divulgación al respecto. Su predicción es que va el SARS-CoV-2 es un virus que tiende a ser atacado por el sistema inmune celular, que es el que reconoce los componentes internos del virus como por ejemplo el ARN viral, en vez de ser atacado preferentemente por el sistema inmune humoral, el que es mediado por anticuerpos que reconocen el exterior del virus. Por ese motivo, la presión selectiva se ejerce contra las moléculas de dentro y no las de fuera. Las moléculas de fuera son las que van a ser reconocidas por los anticuerpos. Por ese motivo, los coronavirus tipo beta, como es el caso del SARS-CoV-2, tienen pocas variantes para los componentes externos. Es una predicción claro está. Hay factores que van más allá de la biología del virus, como por ejemplo que la vacunación no sea universal a nivel mundial y que por falta de medios el virus continúe evolucionando en países pobres y de ahí aparezca una cepa para la cual las vacunaciones en los otros países no la reconozcan. Otro factor alarmante es que el SARS-CoV-2 pueda infectar a otros animales y de esa manera, el virus continúe circulando en estos animales, acumulando mutaciones y finalmente saltando a humanos para los cuales la vacuna no tenga protección.

La respuesta inmunitaria frente a los virus se mueve entre dos extremos de un amplio espectro: a un lado estarían los virus “muy citopáticos” y, al otro, los “poco (o nada) citopáticos”. Los primeros causan infecciones agudas. Los segundos, crónicas y persistentes. Los primeros son controlados principalmente por la respuesta de anticuerpos; los segundos, por la respuesta celular. Fuente

Antiviral antibody responses: the two extremes of a wide spectrum

https://theconversation.com/por-que-el-sars-cov-2-lo-tiene-dificil-para-escapar-de-las-vacunas-158924

martes, 13 de abril de 2021

Sesgo sexual en la respuesta inmunitaria al Covid-19

Dado que algunos receptores tipo toll, como TLR7, codificados en el cromosoma X pueden estar no estar inactivados en las mujeres, esto hace que ellas puedan expresar más copias de este receptor con respecto a los hombres que solo tienen una copia de esta gen.  Por tanto las mujeres tienen una respuesta más robusta al ARN vírico. El SarsCoV-2 tiene un ARN de cadena sencilla, es el ARN que detecta el TLR7. Por lo tanto la respuesta inmunitaria innata de las mujeres es más robusta que la de los hombres.

Los estudios de pacientes con Covid-19 deberían, por lo tanto, informar de sus resultados desglosados ​​por sexo, no solo para dilucidar la patogénesis diferencial de la enfermedad, sino también para permitir una comprensión más profunda de esta enfermedad y el eventual desarrollo de mejores estrategias de tratamiento y prevención. Debería ser una práctica estándar recopilar y notificar datos desglosados ​​por sexo para esto y para todos los estudios de enfermedades infecciosas y vacunas en el futuro"


Las diferencias sexuales respecto a los receptores tipo Toll plaquetarios explicarían también diferencias en cuanto a la severidad de los síntomas de la Covid-19.

La vacuna AstraZeneca tiene millones de partículas en cada dosis. Algunas liberarían DNA, que se uniría al factor 4 plaquetario (PF4), estimulando la formación de anticuerpos, y aumentando riesgo de coagulación. Un posible mecanismo de acción similar al inducido por heparina. Se ha observado que es más frecuente en mujeres la aparición de trombos que en hombres cuando se vacunan con la AstraZéneca

Para saber más:

Molecular mechanisms of sex bias differences in COVID-19 mortality

Thrombotic Thrombocytopenia after ChAdOx1 nCov-19 Vaccination

Sex differences in immune responses

Sex Differences in Platelet Toll-Like Receptors and Their Association With Cardiovascular Risk Factors

martes, 6 de abril de 2021

El investigador y las técnicas que maneja

 Me gradué en la Universidad de Santiago de Compostela en Bioquímica y Biología Molecular. Realicé mi doctorado en la Universidad Autónoma de Madrid estudiando las topoisomerasas de Streptococcus pneumoniae, unas enzimas que relajan y enrrollan el ADN y que son el blanco de una clase de antibióticos llamados fluoroquinolonas. 

Durante ese periodo de mi formación manejé técnicas de PCR, clonación en vectores de expresión, transformación de células bacterianas, extracción de ADN mediante ultracentrifugación de cloruro de cesio, purificación de proteínas nativas por cromatografía y también de proteínas de fusión. Se realizaron ensayos enzimáticos para superenrollar ADN y para liberar ADN concatenado.  Aprendí a cuantificar proteínas y a marcarlas con isótopos radioactivos. Hice experimentos de unión de proteínas a ADN y También secuenciamos manualmente el gen GyrA de Streptococcus pneumoniae y caracterizamos su inicio de transcripción y su la unión de la GyrA a su promotor. 

Posteriormente me mudé a Ann Arbor, Michigan, para estudiar durante cinco años como la membrana de Legionella pneumophila por si misma puede bloquear la actividad de los macrófagos. 

En este trabajo me familiaricé con la microscopía electrónica, de fluorescencia y confocal. Básicamente aislé mediante ultracentrifugación vesículas de membrana externa de Legionella, Caractericé los distintos estados de la membrana externa con lectinas y anticuerpos unidos a fluoróforos. Generamos mutantes para distintos genes que afectaban a la composición de la membrana externa. El objetivo final fue demostrar que esfera de latex rodeados de membrana externa procedente de un estadío infeccioso de Legionella eran capaces de inhibir la maduración del fagosoma de macrófagos humanos y de ratón. Para ello trabajé con macrófagos que extraíamos del fémur de ratones. Mediante anticuerpos monoclonales pudimos comprobar cómo el lipopolisacárido cambiaba dependiendo de si la membrana de Legionella estaba en una fase infectiva o no infectiva y que este lipopolisacárido inhibía la maduración del fagosoma, este trabajo lo realicé en el laboratorio del Dr. Helbig en Dresden Alemania. 

De vuelta en España, realicé un segundo postdoc en el INIBIC (Instituto de investigaciones biomédicas de La Coruña) en donde demostré que Acinetobacter baumannii liberaba vesículas de membrana y que estas vesículas portaban plásmidos y que, sorprendentemente, estas vesículas funcionaban como vehículos para la transformación horizontal entre especies de plásmidos virulentos. Asimismo, vimos como una porina de esta bacteria activaba la autofagia en células humanas.

Para realizar este trabajo manejé citómetría de flujo, cell-sorter y Maldi-tof tof, así como cultivos celulares de líneas celulares defectivas para rutas de autofagia y apoptosis. Manejé microscopía de fluorescencia para demostrar cómo una porina de la membrana externa de Acinetobacter baumanii causaba apoptosis y autofagia, siendo este trabajo unas de las primeras citas de una proteína bacteriana causante de autofagia en células humanas. Del trabajo que más me siento orgulloso fue demostrar que las vesículas de membrana externa eran portadoras de ADN circular y servían como un nuevo mecanismo de transmisión horizontal entre especies bacterianas. 

En Ecuador he realizado experimentos en los que se establecían biofilms de C. albicans y S haemolyticus y se trataban con antibióticos y antifúngicos. He aislado y caracterizado bacteriófagos contra E. coli enteropatogénicos, He caracterizado E. coli enteropatogénica atípica, E. coli multirresistente en heces de perros, en pollos y carcasas de pollo. Para ello hemos tenido que aislar ADN, mandar a secuenciar, realizar estudios filogenéticos, estudios de transformación de plásmidos. He estudiado la citotoxicidad y actividad antitumoral de un compuesto orgánico sobre líneas celulares humanas. He manejado el equipo MX3000 de Stratagene para detección de SarsCov2, también conozco el RT-PCR CFX96 de Biorad. Extraje ARN mediante columnas de sílice de Bionee e Invitrogen. Por último, he realizado dos artículos sobre percepción de Covid19 en estudiantes y un trabajo sobre 4000 pacientes de Covid19 en el Hospital Sur de Quito

jueves, 4 de marzo de 2021

Synthesis and antimalarial and anticancer evaluation of 7‐chlorquinoline‐4‐thiazoleacetic derivatives containing aryl hydrazide moieties

 Una nueva publicación

Hegira Ramírez Esteban Fernandez Juan Rodrigues Soriuska Mayora Gricelis Martínez Carmen Celis Juan B. De Sanctis Michael Mijares Jaime Charris. Synthesis and antimalarial and anticancer evaluation of 7‐chlorquinoline‐4‐thiazoleacetic derivatives containing aryl hydrazide moieties. Archiv der Pharmazie. https://doi.org/10.1002/ardp.202100002

viernes, 26 de febrero de 2021

Fagos combaten Klebsiella multirresistente a los antibióticos en un modelo de ratón

 Pincha aquí

Referencia: S Hesse et al. Bacteriophage Treatment Rescues Mice Infected with Multidrug-Resistant Klebsiella pneumoniae ST258. mBio DOI: 10.1128/mBio.00034-21 (2021).