sábado, 12 de junio de 2021

Causas justas en microbiología

Un río, un amigo, una causa justa

La mayoría de las historias se diluyen en el tiempo como terrones de azúcar en un café caliente. La gran mayoría de las trayectorias vitales son una sucesión de avatares sin más hilo conductor que la pertenencia al colectivo o al tipo de familia al que perteneces.  Mark Twain nos enseñó en su libro las aventuras de Huckleberry Finn que la vida que merece la pena ser vivida es aquella que tiene como componentes un río, un amigo, una causa justa. Y sobre todo, una voluntad férrea de éxito. Lo demás son anécdotas. 

He dicho un río y puedo ser más específico: un viaje por un río. Un río es un paisaje y también es donde las ciudades, la cultura y el comercio florecen. Es un gran camino. Un río es una metáfora de la línea de tiempo: nace, crece y finalmente muere en el mar. 

Un amigo es alguien que te escucha, que te cuenta historias para que tu las escuches, que confía en ti y en el que puedes confiar. Los amigos son el contrapunto a toda la cantidad de relaciones banales e incluso tóxicas que te vas a encontrar en la vida.

Huckleberry Finn fue el primer libro que tuve en mi vida. Me lo regaló mi padre con 6 años. Recuerdo vivamente dos personajes: unos embaucadores que viajaban de pueblo en pueblo timando con las cartas a los lugareños. Le piden a Huck y a Jim que los lleven río arriba con ellos. Huck y Jim acceden. Los dos jugadores pronto se dan cuenta de que Jim es un esclavo huido y tratan de sacar partido a esta situación. Es fácil darse cuenta de que estos sinverguenzas son mala gente. 

La barca que lleva a Huck y a Jim río arriba para que el esclavo pueda ser libre, es una metáfora muy válida de lo que somos nosotros mismos. Cuando creces te das cuenta de que llevamos a esos embaucadores dentro de nuestra barca, dentro de nosotros mismos. Estos tipos viven en forma de pequeños malentendidos que aprendemos en nuestra infancia, de nuestros padres, nuestras primeras experiencias. Los padres, que nunca somos perfectos y que tenemos nuestra propio pasado en un tiempo que ya no es, con ciertos ejemplos, frases y criterios vamos sentando los cimientos sobre el que, nuestros hijos, van a desarrollar su personalidad, opiniones y criterios.

La mayoría de las personas no sabemos cuál es la aventura en la que estamos metidos. Simplemente vamos escogiendo lo que más nos conviene en cada situación. Por eso, por saber a dónde vamos, es importante tener un propósito con el que nos identifiquemos. Luchar contra la esclavitud era la tarea más noble a la que podía aspirar una persona que viviese en el Mississippi racista. Un río, un amigo y una causa justa. Y la firme voluntad de vencer en tu propósito.

Subidos a hombros de gigantes

En la historia de la microbiología tenemos unos pioneros en los que es muy fácil reconocer una causa noble y justa. Quizás en pocas disciplinas científicas haya una identificación  tan clara entre un trabajo y el progreso de la humanidad. Quizás por eso mismo, la proyección de la sombra de esos gigantes hace que la mayoría de quienes trabajan en la microbiología hoy en día parezcan enanos. Ellos eran un puñado y consiguieron la higiene, las vacunas, la esterilización, los antibióticos...

Hoy podemos decir que más del 99% de los microbiólogos que han existido son los que viven actualmente. Esta es una disciplina bastante reciente, con una antiguedad de más o menos 150 años. Actualmente el trabajo está muy fraccionado. Recuerda a las hormigas o a las termitas que trabajan para el gran proyecto que es el termitero pero desconocen que esa estructura será el resultado de esos trabajos individuales sin un plan definido. Actualmente, en la microbiología, si hay una causa noble y justa... creo que son pocos los que son consciente de ello.

El principio rector del proceso de la ciencia actual recuerda al que mueve a los dos embaucadores: tratar de sacar partido de cada situación. La carrera científica es un "publica o muere", solicitar dinero, conseguir contactos, alumnos a los que explotar y luego morir.

Frente a aquellos microbiólogos que trataban de erradicar enfermedades infecciosas devastadoras, los de hoy en día son sospechosos de liberar virus letales al medioambiente, de producir vacunas que permitirán que Bill Gates nos controle a través de las antenas de 5G, de engordar los beneficios de la "Big Pharma".

Los novelistas del Siglo XIX fueron los primeros en vislumbrar al hombre moderno: un hombre superfluo, sin atributos, ridículo, prescindible. La percepción que se tiene, como científico, es que si dejas de hacer algo otro lo va a hacer. Lo que hoy es superrelevante, por ejemplo, en los noventa del siglo pasado, secuenciar un gen, hoy en día las máquinas lo hacen por millones de genes a un costo ridículamente barato. Todo el trabajo que cuesta aprender una técnica se ve superado por la obsolescencia de esa técnica. Esto incrementa la sensación de futilidad y de que el trabajo de uno es prescindible.

Hemos perdido las causas justas en la microbiología. Existe, obviamente, un progreso, pero ese progreso se sobreentiende. Es como el progresivo avance de las computadoras. Se da por supuesto. Es el mercado. Los avances son producto de la codicia de los que quieren ganar nuevos mercados y desplazar a sus competidores. 
Los científicos han pasado de ser santos laicos como Pasteur o Fleming a ser oscuros nerds que trabajan en exceso, mal pagados para tipos listos que utilizan sus descubrimientos y avances para maximizar la cuenta de resultados. Este es el relato sobre la ciencia y los científicos hoy en día. Un relato consistente, con muchos ejemplos y bastante potente. Frente a este relato surge el de la sospecha, el escepticismo, las pseudociencias. Los avances se perciben como una huída hacia adelante y lo que se intuye en el horizonte es un precipicio.

¿Causas justas en la microbiología hoy en día? Se me ocurre el proyecto malaria de Bill Gates, las vacunas cubanas, la tecnología de vacunas de ARN... piensa piensa. Por favor, dejad en los comentarios si conoceis algún proyecto noble y justo en microbiología

Bibliografía

viernes, 4 de junio de 2021

E. coli con un código genético modificado

La reproducción es central en la biología porque permite garantizar la permanencia en el tiempo. Si no te reproduces al cabo de tu vida biológica desapareces. Puedes desaparecer por el efecto sobre el planeta de la colisión de un meteorito, como los dinosaurios, o puedes desaparecer porque no has podido o no has querido reproducirte. Esta es la base de la selección natural. Hay quienes se reproducen, bien porque están mejor adaptados al ambiente, o porqué resisten mejor a las enfermedades infecciosas

La reproducción no solo es central en biología. El éxito de las religiones derivadas del judaísmo ha sido una prohibición sobre el sexo. Esto tiene dos grandes ventajas: es muy difícil resistirse al sexo por lo cual es fácil incumplir y por lo tanto sentirte culpable. Los sacerdotes gestionaban esta culpa. Hoy en día, muchas empresas utilizan este mecanismo: generan tantos compromisos en el trabajador que es imposible cumplirlos todos, por lo tanto estás en déficit y eso hace que seas sumiso ya que no estás cumpliendo con los objetivos. La segunda gran ventaja es que al prohibir el sexo lo regulas. Las familias no son otra cosa que una unidad reproductiva, y el que regula el sexo regula a la familia. Establece ritos, mandamientos, ordena bajo sus principios a la sociedad. Los sumerios, por ejemplo, no regulaban excesivamente el sexo más allá de la prohibición del incesto. Su religión desapareció de la historia, mientras que las religiones derivadas del judaísmo tienen hoy en día 4300 millones de fieles. 

Las bacterias son muy eficientes reproduciéndose. Lo hacen de manera binaria: de una surgen dos, de esas dos tendremos 4, de esas cuatro al dividirse tendremos 8. Una bacteria Escherichia coli se divide cada 20 minutos. Se calculó que una simple E. coli si tuviese espacio y comida ilimitados en 48 hr podría tener una población tan grande como la masa del planeta Tierra. Si tienen esa capacidad tan grande de reproducción ¿Por qué no estamos completamente invadidos e infestados de bacterias?

La razón está en los fagos, unos virus especializados en las bacterias que se encargan de eliminarlos. Los fagos son muy eficaces cuando hay grandes poblaciones de bacterias, todas muy apiñadas entre si. El fago inyecta su material genético en una simple bacteria y se reproduce. Por cada fago que inyecta su material genético saldrán aproximadamente 200 nuevos fagos que estarán prestos para infectar a las bacterias colindantes. Esto hace que las poblaciones de bacterias no crezcan exponencialmente. 

El grupo de Jason Chin en el Consejo de Investigación Médica de Reino Unido ha creado una E. coli con un nuevo código genético. ¿Qué implicaciones tiene que una bacteria tenga un codigo genético diferente al resto de los organismos en el mundo? bien, que es invulnerable a cualquier virus. En el planeta Tierra TODOS los seres vivos compartimos el mismo código genético. Si utilizásemos una analogía con el mundo de los computadores diríamos que nuestro sistema operativo estaría basado en Windows. ¿Qué pasa cuando en vez de utilizar un sistema operativo mayoritario como Windows utilizásemos un sistema operativo minoritario como Ubuntu? pues que si usas Ubuntu no tienes virus y si utilizas Windows si.

¿Para qué sirve construir una E. coli con un código genético nuevo? 

Para tener cultivos en grandes digestores que no sean atacados por fagos. Esto será de utilidad en el campo de la biotecnología, que utiliza grandes digestores en los que cultiva E. coli necesarias para la producción de vacunas. 

¿Hay posibilidad de que estas bacterias escapen y se reproduzcan en el medio ambiente?

Normalmente, cuando se trabaja con organismos modificados tan a lo bestia, los investigadores se toman la molestia de prepararlos para que solo puedan vivir bajo las condiciones controladas de un laboratorio. Por ejemplo, se suele generar mutaciones que hacen que no puedan vivir si no es con un suplemento de aminoácidos esenciales que no se encuentran con facilidad en la naturaleza. Es lo que se llama mutantes auxótrofos. En la leyenda del Golem, un monstruo de barro que defendía a los judíos de Praga, su creador le había introducido un papel en la boca con las siglas ROBOT. Si el Golem se volvía incontrolable había que quitarle ese papel, y al hacerlo, el gigante de barro se desmoronaba. 

La E. coli con un código genético modificado genera aminoácidos y proteínas únicas en el mundo

Por ese motivo, cuando un fago entra en su interior no sabe lo que hacer y por esa manera no se reproduce. ¿Es una bacteria sin depredadores? así es. Cuando los biólogos hablamos de "sin depredadores" automáticamente nos acordamos de la catástrofe ecológica que supuso introducir conejos en Australia. Al no haber zorros u otros depredadores, los conejos proliferaron hasta convertirse en una plaga. 

El gobierno australiano importó en 1950 una enfermedad desde Uruguay para matar a esos conejos: la mixomatosis.

Quizás porque me estoy volviendo mayor, creo que los riesgos de tener organismos con códigos genéticos propios supera a las potenciales ventajas. Los patógenos han sido una suerte de retroalimentación negativa que se encargaba de reducir poblaciones que se habían desbocado. ¿Cuál sería la presión selectiva de estas bacterias que generan proteínas únicas? Un escenario de bacterias con virus conviviendo con bacterias inmunes a estos. Recuerda la historia de las poblaciones americanas sucumbiendo a enfermedades que no afectaban (o al menos de manera más reducida) a los europeos. ¿Cómo se comportarían las proteasas y las DNasas frente a estos nuevos códigos? ¿Podrían digerir las proteínas y el ADN de estas nuevas bacterias?. La buena investigación es aquella que genera dudas, que expande el debate. Solo espero que ninguna de ellas pueda salir de los laboratorios.

"Somos estúpidos y vamos a morir"

Es la frase que Pris le dice, en su desesperación a Roy Batty en la película Blade Runner, cuando se les acaban las opciones para escapar a su muerte programada. Los replicantes, humanos generados por ingeniería genética, son excepcionales, pero lo mismo que el Golem, o las bacterias creadas en el laboratorio de Jason Chin, tienen su vida dependiente de alguien, o de algo, que las limita. Como seres vivos que son quieren vivir, quieren hacerlo sin saber que van a morir algún día. Algo bien humano.

No cabe duda que los robots, o las bacterias con un código genético modificado acabarán encontrando la manera de evitar esa muerte programada. Al fin y al cabo todos lo intentamos de alguna u otra manera. El millonario acumulando millones, el científico papers en las mejores revistas. Intuimos que vamos a morir y nos resistimos a ello de las maneras más diversas e imaginativas. Un código genético, lo mismo que un código informático lleva en si la semilla de vencer. Es un código que cambia y alguno de esos cambios permitirá otro y otro y otro hasta llegar a reproducirse y mantenerse en el tiempo. Es ahí cuando surge la conciencia. La conciencia es una línea de tiempo. 

domingo, 23 de mayo de 2021

Convencer a un negacionista de las vacunas

Es imposible tratar de convencer a un negacionista de las vacunas. Cuando hablas con un estúpido lo que haces es darle, de alguna manera, cierta legitimación a su estupidez: un científico hablando con quien se erige en defensor de la irracionalidad. Por eso, cada vez estoy más convencido de defender el criterio de autoridad. Como echar mano de la autoridad siempre es prepotente e invasivo es poco popular y poco amable también creo que debemos de utilizar el humor para, reduciendo la situación al absurdo, poder convencerlos de que existe un método científico, un método de conocimiento. 

Al final, en el tema de las vacunas acabaremos haciendo lo que se ha hecho en otros ámbitos: poner una ley y directamente obligar a su cumplimiento, lo mismo que se ha hecho con la obligatoriedad del uso del cinturón de seguridad. ¿Te imaginas tener que convencer a alguien que no cree que el cinturón de seguridad salva vidas?

Hay miles de ejemplos que se pueden usar para reducir esta situación al absurdo. Imaginemos que hay un colectivo que después de ver cómo se ha caído un puente de hormigón en la ciudad de Génova deciden que quieren tener pruebas de que un puente no se va a caer. No puedes permitir que ante el puente exijan que haya una alternativa a cruzar ese puente y quieran utilizarla. El puente está ahí y lo cruzas o no usas esa infraestructura. Te tienes que fiar del dictamen de los ingenieros porque tu no tienes elementos para juzgar la viabilidad de la estructura.

¡Burro! ¡Los barcos no pueden ser de hierro porque el hierro no flota! 

Mi padre me contaba una anécdota de uno de Porriño que había ido a hacer la mili a Ferrol, en la marina, y a la vuelta le contaba a su padre que los barcos de guerra eran de hierro, y aquí empieza lo gracioso. El padre le llama burro y le explica que los barcos si son de hierro se hunden. Para probar su punto llenó una palangana de agua y puso un hierro y le dijo "Ves, ves, el hierro se hunde" luego puso un palo de madera, que obviamente no se hundía. Todo esto en gallego y llamándole burro al hijo por no saber algo tan obvio. Como el hijo se obstinaba en decir que si, que eran de hierro, el padre le dijo: son barcos de madera forrados de hierro, pero el interior es de madera. Para una persona de campo esa era su experiencia y se aferraba a ella. También el hecho de que él era el padre le obligaba a educar a su hijo, y a "abrirle" los ojos al conocimiento. Un conocimiento del que él carecía. Arquímedes en su ley de flotación ya había explicado el porqué un barco de hierro puede flotar. Si el peso del agua que desaloja es mayor que el peso del propio barco el barco va a flotar. Fin de la historia.

Si no te vacunas te quedas fuera del sistema público de salud

Con esta historia se ilustra que el conocimiento no se puede utilizar para estar por encima de los demás. El padre, con su palangana, el trozo de metal y el de madera, lo que quería era demostrar que él seguía siendo el padre y que por tanto su hijo bajo ningún concepto podía estar por encima de él, aunque lo que dijese era verdad. Los antivacunas hacen lo mismo. No quieren reconocer que hay personas que están por encima de ellos en cuestión de conocimiento y se buscarán cualquier tipo de argumento para resistir que su punto de visto se vea menospreciado. Es una lucha por el territorio. No se trata de conocimiento se trata de quien gana y quien pierde. 

Decirle a alguien: tu no tienes ni idea y te callas, aunque se tenga razón, comete el mismo error que el padre de la anécdota: es desagradable y ofensivo. Ante una epidemia, la vacunación, y sobre todo, la vacunación masiva es la única manera de parar el virus, que no haya virus circulantes acumulando mutaciones que haga que aparezcan nuevas cepas que no son reconocidas por las vacunas. No podemos dejar que haya personas que decidan que ellos no se vacunan. Si no te vacunas te quedas fuera del sistema público de salud. Si quieres ser estúpido tu debes de costearte tu propia estupidez. Poco a poco acabaremos implementando este tipo de medidas, igual que se han implementado las normas de seguridad vial.

El cinturón de seguridad como metáfora

Cuando éramos pequeños solo usábamos el cinturón de seguridad los que íbamos delante del coche. Si el trayecto era corto incluso los padres te decían que no hacía falta. Hoy en día, las personas lo primero que hacen es ponerse el cinturón incluso antes de arrancar. Tan interiorizado está este hábito. ¿Qué es lo que ha cambiado? las multas. Ya nadie se lo cuestiona. La verdad es que si yo no hubiese utilizado el cinturón de seguridad no hubiese pasado nada porque nunca he tenido un choque frontal. Y en mi experiencia habría dicho que el cinturón de seguridad no vale para nada. Es el argumento del "amimefuncionismo". Llevar el cinturón de seguridad puede ser peligroso si te caes con el coche en un lago. En Estonia hay una carretera en la que está prohibido usar el cinturón de seguridad por este motivo.

El negacionismo debe quedar relegado a los terraplanistas, chemtrails y demás asuntos inofensivos

Siempre habrá negacionistas porque hay personas que tienen que sentirse que son más listas que los demás. Hay un montón de temas inofensivos como creer que la tierra es plana o que el hombre no llegó a la Luna. Los escépticos, las personas con formación científica, no deberían tratar de rebatir sus argumentos. Practicar la tolerancia. Son, en el fondo, una fuente inagotable de anécdotas, de sin sentido y dan pie al humor. ¿El creacionismo? también. Mientras no traten de imponerlo en las escuelas está bien. Que cada uno crea lo que considere más conveniente. No voy a ser impositivo con tus creencias. Te respeto. Eso si, me reservo el derecho a hacer humor con el crucero de terraplanistas que iban a visitar el fin del mundo o de "investigaciones científicas" que encuentran el Arca de Noé y todavía tenía la paja de haber albergado animales

El negacionista es un payaso carablanca y su locura es el relato

En el mundo de los payasos hay dos personajes básicos: el payaso carablanca, que es el jefe, es estirado y mandón, y el payaso tonto, también llamado augusto, porque en alemán augusto significa tonto, el que es infantil y anárquico. Los negacionistas deben de ser considerados payasos carablanca y la persona que los confronte no debe caer en tratar de ser más jefe, más estirado ni más listos que ellos. En el fondo nos obligan a adoptar el papel del payaso tonto y anárquico. Si nos ponemos a su nivel lo que hacemos es legitimar su discurso. Si nos hacemos el tonto, con anécdotas, y diciendo argumentos que llevan su argumento al absurdo estaremos entrando en el mundo de la comedia que es el mundo en donde estos estúpidos deben de estar. 

Siempre hay un relato, y el relato nos condiciona y nos obliga a adoptar un papel dentro de ese relato. En la Comedia del Arte, lo mismo que en Bob Esponja, los caracteres que se muestran abarcan toda la paleta de personalidades en las que una historia o un relato se desarrolla. El gran aporte de Cervantes fue el coger un relato, como es el que aparece en los libros de caballeros medievales, en las que el caballero es un ser lleno de virtudes al que le suceden aventuras, un poco como las historias de superhéroes de Marvel que están de moda, y darle la vuelta. El caballero está loco y su locura es el relato. El payaso carablanca es el negacionista y su locura es el relato.

En "El Quijote" el payaso tonto es Sancho Panza, y curiosamente es, de los dos, el más juicioso. El Quijote y su locura es el comienzo de la acción y la aventura. A Sancho Panza no le ocurriría nada en su mundo de refranes y certezas. Es un personaje que carece de relato. Comienza a tener relato cuando se une a el Quijote y es aceptado en calidad de escudero. El loco nos muestra nuestra realidad de una manera nueva

Hay algo tierno en la batalla de Don Quijote contra los molinos de viento. Nadie se acordaría de alguien como Sancho Panza, sin embargo, cuando alguien embiste un molino de viento porque ansía derrotar al mal, porque quiere plantar batalla, eso es algo que transciende y se incorpora al imaginario colectivo. Como el padre que se desespera porque su hijo cree que el hierro flota. Sancho Panza, el hombre sin imaginación, práctico, acompaña y cuida al loco, al visionario. En la primera parte del libro trata de recupere la cordura, cuando al final la recupera y entra en un estado de letargo y depresión, el mismo Sancho Panza le convence se salir de nuevo a "desfacer entuertos" porque la realidad a veces es tan sólida, dura y falta de interés que es mejor morirse que vivir esa vida. 

La segunda parte del libro, Don Quijote recupera su cordura y empieza a ver el mundo tal y como es, lo cual lo lleva a la depresión y a enfermarse. Mientras tanto, Sancho Panza, conmovido por su salud, se empeña en hacerle recuperar al delirio y en convencerlo que son ahora sus ojos los que le engañan, presa de algún hechizo maléfico. Cervantes, de alguna manera, intuyó que necesitamos ciertas dosis de locura para evitar que la realidad nos aplaste. Siempre debemos confiar que en el otro valle la hierba es más fresca. Es una característica humana que ha hecho que no nos conformemos con lo que hay y que queramos darle una vuelta. En el fondo, es uno de los grandes acicates de la ciencia. ¿Acaso Semmelweis no fue acusado de loco por los más respetados médicos de la época? Si, ya se, las vacunas están avaladas por innumerables pruebas y no se trata de lo mismo.

Quiero acabar esta entrada concluyendo que no se puede discutir la locura y tampoco se debe desacreditarla. Hay que establecer reglas y multas para que se cumplan las prácticas que están bien establecidas y que son de utilidad pública. Respecto al loco... hay que escucharlo y acompañarlo. A veces, de esa locura aprendemos de nosotros mismos, de lo absurda que puede ser nuestra realidad. Nos proporcionan perspectiva, y de vez en cuando, si son capaces de demostrar su locura, mediante el método científico, descubrimos que la tierra es redonda, la ley de flotación, la condensación del agua, el beneficio de lavarse las manos, o el de las vacunas

jueves, 13 de mayo de 2021

Si vacunamos contra fagos prevenimos la infección de las heridas por Pseudomonas aeruginosa

Los bacteriófagos son abundantes en los sitios de infección bacteriana. Ya se sabe, donde hay bacterias hay virus antibacterianos, pero sus efectos sobre los hospedadores mamíferos no están nada claros. En el laboratorio del Dr  Paul Bollyky (Stanford University, CA) han identificado roles patogénicos para el bacteriófago filamentoso Pf producido por Pseudomonas aeruginosa (Pa) en la supresión de la inmunidad contra la infección bacteriana. Hay que decir que el fago Pf es un fago filamentoso inserto en el genoma de Pa.

Pf hace que la infección de la herida por Pa en ratones se agrave, es decir, que beneficia a Pa en detrimento del hospedador. Por ese motivo, la presencia del fago Pf se asocia con infecciones crónicas de la herida por Pa en humanos. 

En el diagrama de la izquierda vemos como una célula de mamífero detecta moléculas de la bacteria (1) y ello lleva a la expresión del gen NFkB (2) y su posterior traducción lo cual lleva a la expresión, traducción y secreción del TNF (3), el cual estimula la fagocitosis de la bacteria (4).

Esto es lo que ocurre normalmente. ¿Qué ocurre cuándo el fago Pf está presente en el medio? Los leucocitos murinos y humanos endocitan Pf, y la internalización de este virus de ADN monocatenario da como resultado la producción de ARN de fagos. Esto desencadena la producción de interferón de tipo I dependiente del interferón-β (TRIF) inductor del adaptador 3 (TLR3) (1) y del dominio TIR que contiene el dominio TIR. Ello lleva a la producción de interferón tipo I (2), lo que inhibe la secreción del factor de necrosis tumoral (TNF) y la supresión de la fagocitosis (3). 

Por lo tanto, si eliminamos al fago, por ejemplo mediante la inmunización de ratones contra Pf entonces prevenimos la infección de la herida por Pa. Por lo tanto, la vacunación contra fagos representa una estrategia potencial para prevenir la infección bacteriana.

Referencia

jueves, 15 de abril de 2021

Por qué el SARS-CoV-2 lo tiene difícil para escapar de las vacunas

El Dr. Jiménez Clavero del INIA ha escrito un artículo muy interesante de divulgación al respecto. Su predicción es que va el SARS-CoV-2 es un virus que tiende a ser atacado por el sistema inmune celular, que es el que reconoce los componentes internos del virus como por ejemplo el ARN viral, en vez de ser atacado preferentemente por el sistema inmune humoral, el que es mediado por anticuerpos que reconocen el exterior del virus. Por ese motivo, la presión selectiva se ejerce contra las moléculas de dentro y no las de fuera. Las moléculas de fuera son las que van a ser reconocidas por los anticuerpos. Por ese motivo, los coronavirus tipo beta, como es el caso del SARS-CoV-2, tienen pocas variantes para los componentes externos. Es una predicción claro está. Hay factores que van más allá de la biología del virus, como por ejemplo que la vacunación no sea universal a nivel mundial y que por falta de medios el virus continúe evolucionando en países pobres y de ahí aparezca una cepa para la cual las vacunaciones en los otros países no la reconozcan. Otro factor alarmante es que el SARS-CoV-2 pueda infectar a otros animales y de esa manera, el virus continúe circulando en estos animales, acumulando mutaciones y finalmente saltando a humanos para los cuales la vacuna no tenga protección.

La respuesta inmunitaria frente a los virus se mueve entre dos extremos de un amplio espectro: a un lado estarían los virus “muy citopáticos” y, al otro, los “poco (o nada) citopáticos”. Los primeros causan infecciones agudas. Los segundos, crónicas y persistentes. Los primeros son controlados principalmente por la respuesta de anticuerpos; los segundos, por la respuesta celular. Fuente

Antiviral antibody responses: the two extremes of a wide spectrum

https://theconversation.com/por-que-el-sars-cov-2-lo-tiene-dificil-para-escapar-de-las-vacunas-158924

martes, 13 de abril de 2021

Sesgo sexual en la respuesta inmunitaria al Covid-19

Dado que algunos receptores tipo toll, como TLR7, codificados en el cromosoma X pueden estar no estar inactivados en las mujeres, esto hace que ellas puedan expresar más copias de este receptor con respecto a los hombres que solo tienen una copia de esta gen.  Por tanto las mujeres tienen una respuesta más robusta al ARN vírico. El SarsCoV-2 tiene un ARN de cadena sencilla, es el ARN que detecta el TLR7. Por lo tanto la respuesta inmunitaria innata de las mujeres es más robusta que la de los hombres.

Los estudios de pacientes con Covid-19 deberían, por lo tanto, informar de sus resultados desglosados ​​por sexo, no solo para dilucidar la patogénesis diferencial de la enfermedad, sino también para permitir una comprensión más profunda de esta enfermedad y el eventual desarrollo de mejores estrategias de tratamiento y prevención. Debería ser una práctica estándar recopilar y notificar datos desglosados ​​por sexo para esto y para todos los estudios de enfermedades infecciosas y vacunas en el futuro"


Las diferencias sexuales respecto a los receptores tipo Toll plaquetarios explicarían también diferencias en cuanto a la severidad de los síntomas de la Covid-19.

La vacuna AstraZeneca tiene millones de partículas en cada dosis. Algunas liberarían DNA, que se uniría al factor 4 plaquetario (PF4), estimulando la formación de anticuerpos, y aumentando riesgo de coagulación. Un posible mecanismo de acción similar al inducido por heparina. Se ha observado que es más frecuente en mujeres la aparición de trombos que en hombres cuando se vacunan con la AstraZéneca

Para saber más:

Molecular mechanisms of sex bias differences in COVID-19 mortality

Thrombotic Thrombocytopenia after ChAdOx1 nCov-19 Vaccination

Sex differences in immune responses

Sex Differences in Platelet Toll-Like Receptors and Their Association With Cardiovascular Risk Factors

martes, 6 de abril de 2021

El investigador y las técnicas que maneja

 Me gradué en la Universidad de Santiago de Compostela en Bioquímica y Biología Molecular. Realicé mi doctorado en la Universidad Autónoma de Madrid estudiando las topoisomerasas de Streptococcus pneumoniae, unas enzimas que relajan y enrrollan el ADN y que son el blanco de una clase de antibióticos llamados fluoroquinolonas. 

Durante ese periodo de mi formación manejé técnicas de PCR, clonación en vectores de expresión, transformación de células bacterianas, extracción de ADN mediante ultracentrifugación de cloruro de cesio, purificación de proteínas nativas por cromatografía y también de proteínas de fusión. Se realizaron ensayos enzimáticos para superenrollar ADN y para liberar ADN concatenado.  Aprendí a cuantificar proteínas y a marcarlas con isótopos radioactivos. Hice experimentos de unión de proteínas a ADN y También secuenciamos manualmente el gen GyrA de Streptococcus pneumoniae y caracterizamos su inicio de transcripción y su la unión de la GyrA a su promotor. 

Posteriormente me mudé a Ann Arbor, Michigan, para estudiar durante cinco años como la membrana de Legionella pneumophila por si misma puede bloquear la actividad de los macrófagos. 

En este trabajo me familiaricé con la microscopía electrónica, de fluorescencia y confocal. Básicamente aislé mediante ultracentrifugación vesículas de membrana externa de Legionella, Caractericé los distintos estados de la membrana externa con lectinas y anticuerpos unidos a fluoróforos. Generamos mutantes para distintos genes que afectaban a la composición de la membrana externa. El objetivo final fue demostrar que esfera de latex rodeados de membrana externa procedente de un estadío infeccioso de Legionella eran capaces de inhibir la maduración del fagosoma de macrófagos humanos y de ratón. Para ello trabajé con macrófagos que extraíamos del fémur de ratones. Mediante anticuerpos monoclonales pudimos comprobar cómo el lipopolisacárido cambiaba dependiendo de si la membrana de Legionella estaba en una fase infectiva o no infectiva y que este lipopolisacárido inhibía la maduración del fagosoma, este trabajo lo realicé en el laboratorio del Dr. Helbig en Dresden Alemania. 

De vuelta en España, realicé un segundo postdoc en el INIBIC (Instituto de investigaciones biomédicas de La Coruña) en donde demostré que Acinetobacter baumannii liberaba vesículas de membrana y que estas vesículas portaban plásmidos y que, sorprendentemente, estas vesículas funcionaban como vehículos para la transformación horizontal entre especies de plásmidos virulentos. Asimismo, vimos como una porina de esta bacteria activaba la autofagia en células humanas.

Para realizar este trabajo manejé citómetría de flujo, cell-sorter y Maldi-tof tof, así como cultivos celulares de líneas celulares defectivas para rutas de autofagia y apoptosis. Manejé microscopía de fluorescencia para demostrar cómo una porina de la membrana externa de Acinetobacter baumanii causaba apoptosis y autofagia, siendo este trabajo unas de las primeras citas de una proteína bacteriana causante de autofagia en células humanas. Del trabajo que más me siento orgulloso fue demostrar que las vesículas de membrana externa eran portadoras de ADN circular y servían como un nuevo mecanismo de transmisión horizontal entre especies bacterianas. 

En Ecuador he realizado experimentos en los que se establecían biofilms de C. albicans y S haemolyticus y se trataban con antibióticos y antifúngicos. He aislado y caracterizado bacteriófagos contra E. coli enteropatogénicos, He caracterizado E. coli enteropatogénica atípica, E. coli multirresistente en heces de perros, en pollos y carcasas de pollo. Para ello hemos tenido que aislar ADN, mandar a secuenciar, realizar estudios filogenéticos, estudios de transformación de plásmidos. He estudiado la citotoxicidad y actividad antitumoral de un compuesto orgánico sobre líneas celulares humanas. He manejado el equipo MX3000 de Stratagene para detección de SarsCov2, también conozco el RT-PCR CFX96 de Biorad. Extraje ARN mediante columnas de sílice de Bionee e Invitrogen. Por último, he realizado dos artículos sobre percepción de Covid19 en estudiantes y un trabajo sobre 4000 pacientes de Covid19 en el Hospital Sur de Quito