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sábado, 11 de marzo de 2017

Signifers, encargados marcar el territorio

Poner etiquetas es un forma muy efectiva de definir un territorio. Un territorio tiene dueño si tiene una etiqueta que lo define.
En una centuria, compuesta de 80 hombres organizados en 10 cohortes de 8 hombres cada uno, había además otros tres oficiales: el tessararius, encargado de fijar la contraseña diaria, el optio, que era el lugarteniente del centurión, y el centurión, el máximo responsable de una centuria. En la centuria había también un oficial llamado signifer, que era el que portaba el estandarte.

El centurión y su lugarteniente, el optio, mandaban sobre la tropa. Las funciones del tessararius y las del signifer eran las de delimitar qué era lo propio. El tessararius, al encargarse de darle a los 83 hombres una contraseña diaria, de alguna manera, determinaba, en la oscuridad de la noche, quien y quien no era enemigo. En batalla el signifer era responsable de mantener la integridad del frente. Si en un momento los enemigos lanzaban un ataque y a las tropas les entraba el pánico, el signifer, un hombre templado, evaluaba si era inteligente la retirada o no. Si consideraba que retirarse era un error, o si el centurión se lo ordenaba, el signifer clavaba el estandarte en la tierra y los hombres de la centuria tenían que quedarse a su lado cuidando su estandarte. Si una centuria perdía su estandarte se convertía en una centuria sin honor y eso tenía además implicaciones económica cara a la jubilación de los legionarios.
 
La pregunta que me ronda en la cabeza es ¿Habrá signifers y tessararius en el mundo microbiano? Desde luego, cuando en las colonias de hormigas no existe la figura de alguien que distinga lo propio de lo ajeno aparecen surgen los oportunistas. En este caso se trata de escarabajos que se mimetizan para entrar en los hormigueros y devorar hormigas.
Fuente

martes, 6 de diciembre de 2016

In the shadow of Motown

El fundador de la discográfica Motown, Berry Gordy, antiguo trabajador de la Ford, empleó el sistema de producción en cadena de esta empresa a la producción discográfica. Desde una perspectiva territorial, Berry estableció un territorio, Motown, los artistas y los músicos eran sus empleados, no participaban de los beneficios de la explotación de su talento. El sistema era el siguiente: Berry compraba los derechos de explotación de una canción. Le daba esta canción a sus músicos de estudio y las estrellas contratadas la cantaban. A veces hasta cinco estrellas distintas probaban suerte con esa canción, luego Berry decidía quien lo había hecho mejor y se promocionaba la canción y a ese interprete. 

Hoy en día la mayor parte de los músicos de estudio de Motown siguen viviendo en Detroit. Ellos grabaron más números uno que los Beatles, Beach Boys, Rolling Stones y Elvis Presley juntos... a pesar de eso tienen que seguir tocando en hoteles para completar su escasa pensión.
Cuando alguien establece un territorio y trabajas para la persona que explota ese territorio recibes a cambio un salario pero el fruto de tu trabajo y talento va en exclusiva para esa persona. Este tipo de relaciones son las que se estilan en ciencia. Muchas veces ni siguiera el propietario de ese territorio científico te paga el salario. El salario se paga con fondos públicos y los beneficios son explotados por el científico principal.

En un sistema económico como en el que estamos inmersos "lo mio es mio y lo tuyo ya veremos" es la norma, n  no es lo justo. La revista Nature publicó una encuesta en la que muestra que dos terceras partes de los científicos están pensando en dejar la ciencia. Son esas dos terceras partes de científicos que trabajan para esos investigadores principales.

En una sociedad donde los individuos se definen por su lugar en la producción, por su trabajo, no tener empleo es una de las formas más inmediatas de no tener una identidad funcional.

Afortunadamente siempre hay salidas. En este artículo, un científico cuenta como ha podido seguir trabajando en ciencia desde un instituto de formación profesional en los EEUU.

domingo, 8 de mayo de 2016

Overoles, mandiles y chompas

La imagen que ilustra el post ha sido tomada en el mercado de Iñaquito de Quito. Este cartel es una muestra de como la información, en este caso en español, de palabras procedentes de otras lenguas. Con los genes sucede lo mismo.

La palabra mandil procede del árabe hispánico mandíl, este del árabe clásico mandīl o mindīl, este del arameo mandīlā, la cual a su vez procede del latín mantīle o mantēle, toalla, mantel. La palabra pantalón llega al castellano procedente de italia, del personaje de la comedia Pantaleone.

Overol proviene del inglés "over all" y es un sobretodo. Chompa es una palabra que pensaba que era kwichua, pero por lo visto parece que viene también del inglés, de la palabra "Jumper" que es una especie de chaqueta que usaban los marineros. De cuatro palabras, dos tienen origen anglosajón. ¿Tendrá que ver con el hecho de que el inglés es una lengua de prestigio?.

Las bacterias igual que las personas están constantemente intercambiando información. En su caso genética. Lo mismo que los niños cambian cromos las bacterias pueden cambiar genes.

Hoy en día gracias a las técnicas de secuenciación masiva podemos leer TODOS los genes de bacterias que se encuentran en nuestra boca, nuestro intestino, una fosa séptica.
Esto nos permite tener una "fotografía nítida" de cuantos genes diferentes existen en una comunidad. Es como tener el diccionario más completo de no solo una lengua sino de todas las lenguas que se hablen en un territorio. Ahora tenemos que seguir ahondando en ese conocimiento.

Nosotros utilizamos jersey y sueter, dos palabras inglesas. Los hispanohablantes de latinoamérica dicen chompa, y piensan que es una palabra Kwichua, siendo también de origen inglés. Podemos intuir que esas palabras llegan a nuestro idioma por el prestigio que adquiere el inglés en los últimos doscientos años. ¿Habrá algo así en el mundo bacteriano? ¿Genes, información que esté asociado con un prestigio y lleve a que esos genes permanezcan y se hagan mayoritarios en una comunidad? Palabras, genes que recuerdan que en un momento dos comunidades se enfrentaron y una perdió a expensas de las otras.

Una de las características de estas palabras es que se imponen a expensas de palabras vernáculas. ¿Cómo se decía jersey en castellano antes de que esa palabra se impusiese? ¿Jubón?
Las piedras del muro del Convento de San Francisco de Quito son de factura inca imperial pues pertenecían a un templo prehispánico. Los españoles  construyeron el convento encima, una práctica habitual de todas las civilizaciones: los símbolos del dominador se erigen sobre los del vencido. En este caso se puede apreciar como los españoles dibujaron sobre las piedras incas un bajorrelieve simulando una cantería española que no es tal. Si observan las líneas de cantería inca no coinciden con los bajorrelieves españoles

El uso de una palabra u otra está asociada a una especie de "territorio imaginario". Roma hace 2000 años era la capital de un imperio que en el año 476 se desmorona. Sin embargo, hasta el Concilio Vaticano II el latín, un idioma que ya no hablaba nadie, se sigue considerando el idioma oficial de la Iglesia Católica. Si no fuese por el auge de las iglesias evangelistas y la necesidad de la Iglesia Católica de estar en la pelea por los fieles todavía hoy en día se seguiría hablando en latín. El hecho de que se usase el latín reforzaba el hecho de que era la Iglesia Católica (Universal) Romana. La preeminencia del Obispo de Roma sobre los demás obispo es una característica de esta iglesia. Desde el Concilio Vaticano II hasta ahora todos los Papas han sido de fuera de la ciudad de Roma. ¿Un signo de los tiempos y de la renuncia a hablar latín?

En América Latina el auge de las iglesias evangélicas es algo bastante notorio. ¿No se deberá en alguna medida al prestigio que tienen las sociedades anglosajonas?.

El concepto importante aquí es como un sígno puede ser memoria de una victoria económica, militar o cultural. El sígno te recuerda que mejor no te vuelvas a meter con quien detenta ese signo: ya te ha ganado una vez. Este concepto vendría a apuntalar los trabajos en teorías de juegos en los que se examina las interacciones entre elementos y como algunos elementos guardan memoria de eventos pasados. Me explico. Por ejemplo dos elementos que cara a cara se enfrentan. Pueden tener varios comportamientos: decidir competir, decidir cooperar. Los teóricos de esta teoría especulan con la posibilidad de que estos elementos puedan guardar memoria de eventos pasados. Por ejemplo, si el elemento A se enfrenta al elemento B y ambos cooperan, en el futuro cada vez que A y B se vuelvan a enfrentar decidirán cooperar porque ya les fue bien la primera vez.
En la Batalla del Puente Milvio, el Emperador Constantino decidió que con este signo vencería, y desde entonces el poder romano abrazó los símbolos del cristianismo. Fuente

Existe entonces una economía de los signos. No cualquier signo sirve para defender un territorio. Saber de economía de símbolos es importante. Te permite estar en la pomada, pisar moqueta o en economía situar tu marca. No es casualidad que los gastos en marketing sean en una empresa superiores a los del costo de fabricación del producto.

Cualquiera que toque los signos está jugando con el poder, el territorio y con el dinero ajeno. Es peligroso. En el vídeo de abajo unos tipos deciden entrar en la cadena de almacenes "Best Buy" vestidos como se visten sus empleados: pantalón caqui y polo azul. El resultado se puede ver en el vídeo:
Ya no llega con secuenciar y secuenciar genes y más genes de bacterias, virus... debemos ahora tener una visión de como esa información se impone, genera territorios, establece relaciones de prestigio y desplaza a otros sistemas de información.

lunes, 14 de septiembre de 2015

Evolución y territorio

La vida se basa en moléculas capaces de autorreplicarse, es decir, de producir copias lo más parecidas a si mismas. Los virus de ordenador tienen el mismo principio: son secuencias de ceros y unos, que en realidad son apagados o encendidos del procesador del ordenador. Esas secuencias de ceros y unos cuando infectan un ordenador son capaces de producir copias y enviarlas a otros ordenadores. Los virus tienen el mismo principio. En vez de ceros y unos son secuencias enlazadas de cuatro ácidos nucleicos. Cuando un virus infecta una célula produce copias de si mismo con el único fin de salir de esa célula para infectar otras células. Parece que tienen la manía de autoreplicarse y saltar de un ordenador a otro o de una célula a otra. 
Las palabras evolucionan
Las palabras de los idiomas con alfabeto siguen también el mismo sistema. Las palabras son secuencias de, más o menos, veinte letras. Las palabras se usan en un idioma y su uso pasa de una generación a otra. Los virus humanos, los del ordenador o las palabras de idiomas con alfabeto son soportes de información en cadenas de elementos enlazados. A base de replicarse una y otra vez van acumulando fallos en la transmisión de la información. Esos fallos los conocemos como mutaciones. Si esos cambios son favorables para la función de esa información son seleccionados y al final esos cambios se convierten en mayoritarios. Si esos cambios no son favorables desaparecen. Esto es lo que se llama selección. 
 
El chino es un idioma milenario que casi no ha evolucionado en su forma escrita. Esto se debe a que el soporte de información no está en cadenas de elementos. La información está plasmada en dibujos conceptuales. Sobre esta base es muy difícil que se cometan fallos que puedan ser seleccionados con el paso del tiempo.

Las palabras necesitan hablantes, los virus células a las que infectar y los virus de ordenador soportes informáticos. ¿Cómo se originó el primer sistema autorreplicante en el Mundo cuando no existían células? directamente no se sabe. Hay hipótesis varias. Mi favorita es que cuando no existía vida existía un caldo rico en moléculas. Muchas de estas moléculas podían formar polímeros, es decir, largas cadenas de ciertos componentes que como las piezas del Lego podían engancharse unas a otras. Los experimentos de Oparin y de Stanley Miller demostraron que si simulamos las condiciones del Planeta Tierra por aquel entonces se producen de forma espontanea aminoácidos y ácidos nucleicos. 

Los ácidos nucleicos se pueden enlazar formando cadenas. Hasta ahí bien, pero además de tener un soporte de información como lo son las cadenas de ácidos nucleicos (como por ejemplo el ADN o el ARN) necesitamos que esa molécula sea capaz de hacer cosas. Cuando una molécula "hace cosas" la llamamos enzima. Una enzima es capaz de coger una molécula y transformarla. 

El ADN y el ARN son secuencias de ácidos nucleicos. El ADN son secuencias de adenina, citosina, guanina y timina y el ARN son secuencias de adenina, citosina, guanina y uracilo.


Como veis, el ADN y el ARN sólo se diferencian en sus ácidos nucleicos en estos dos, y éstos sólo se diferencias en un grupo metilo. El grupo metilo de la timina hace que el ADN sea más rígido que el ARN. El ARN se puede plegar y resultar en moléculas con una estructura tridimensional compleja y adivinad qué: ¡Algunas moléculas de ARN pueden funcionar como enzimas! son las famosas ribozimas. Las ribozimas se cree que fueron las primeras entidades biológicas autorreplicantes.

Bien, ya tenemos a nuestra cadena de información (posiblemente ARN) autorreplicante copiándose sin cesar en el planeta Tierra. Además hemos visto que esas cadenas de información al copiarse cometen fallos y que estos fallos pueden dar lugar a mejoras. El siguiente gran paso es algo que no está todavía bien entendido en la biología. Es la creación de un compartimento que haga que las mejoras puedan ser explotadas. No sabemos cual es el mecanismo por el cual el concepto territorio (compartimento) aparece en la vida. La persona que lo descubra será un nuevo Charles Darwin. El concepto competencia parece que está detrás de todo esto. Es algo que se deriva del hecho de la selección natural que implica que aquello que confiere una ventaja se replicará con más éxito y acabará desplazando a aquellas entidades menos eficientes. Podemos intentar entenderlo así, pero algo falta para que el entendimiento sea completo.

A falta de células en el mundo prebiótico hay una teoría que dice que a falta de células los primeros compartimentos eran los espacios que existen entre las láminas de los filosilicatos. Los filosilicatos son el mineral de muchas arcillas por lo que decir que la vida se origina en el barro no es algo descabellado. Los filosilicatos son láminas como si de un milhojas se tratase que pueden contener agua y ácidos nucleicos entre esas láminas. Esas estructuras podrían ser las primeras células. Lo que ocurriese dentro de esas células podría ser seleccionado y hacer que el contenido de una de esas células fuese desplazando el contenido de células vecinas. En ese escenario la selección natural podría funcionar. Más adelante las moléculas autorreplicantes aprendieron a producir lípidos (grasas) y esos lípidos fueron los precursores de las membranas celulares. Cuando moléculas autorreplicantes en el interior de membranas de lípidos fueron capaces de conseguir que todo el sistema se volviese una unidad autorreplicante, es decir, que todo ese sistema se dividiese para dar lugar a dos entidades es el momento en que aparece la vida celular tal y como la conocemos.

Las moléculas autorreplicantes necesitaron un compartimento para que lo que era de interés fuese algo individual que se pudiese seleccionar. La necesidad de un territorio parece un requisito para la vida. Lo mío en contraposición al todo indeterminado. Es la diferencia lo que estimula la competencia. Si no hay diferencia quizás el concepto territorio sea más importante que la evolución por competición. Estoy seguro que podríamos aprender mucho haciendo un estudio comparado entre el chino y las lenguajes basados en alfabetos. Por ejemplo,que una escritura con tan pocas posibilidades de evolución como la china no haya conquistado el Mundo pese a su desarrollo tecnológico y un número de hablantes tan elevado a lo largo de la historia puede deberse a un peso muy elevado del concepto territorio a expensas del concepto de selección de individualidades más exitosas. Es una intuición que no llega ni siquiera al rango de hipótesis. Debemos esperar a que se de un marco conceptual adecuado para ahondar en esta idea. En estos momentos en los que el capitalismo da síntomas de agotamiento reflexionar sobre este tema puede abrir nuevas puertas. 

El capitalismo surge en la Italia renacentista. Una Italia que había sufrido antes que otros países europeos la reducción drástica de la población por la peste negra. Eso permitió que unas generaciones disfrutasen de un crecimiento que no se experimentaba en la edad media precedente. Ese crecimiento continuó por el descubrimiento de América que permitió al hombre europeo crecer a expensas de los indígenas. El capitalismo necesita de un crecimiento continuo. Dado que nuestro Planeta es finito hemos llegado a un punto de crecimiento postexponencial. El capitalismo funciona mal en un punto de no crecimiento. Es ahí en donde la reflexión sobre el territorio cobra una nueva dimensión. 

En la constitución de la primera célula había muchas unidades autorreplicativas que tuvieron que "ceder" individualidad en pos de una estructura que las englobase a todas en un nuevo concepto de espacio: la célula. En este caso el territorio se impuso sobre las lógicas egoístas de esas moléculas que solo pensaban en autorreplicarse. Cuando pienso sobre esto tengo en mente la evolución de los líquenes. Los líquenes son asociaciones de un hongo, que da soporte a la estructura del líquen, y pequeñas bacterias fotosintéticas. El hongo proporciona la casa y las bacterias fotosintéticas proporcionan la materia orgánica a partir de la energía del Sol y algunos elementos químicos. Recientemente se ha visto que los hongos de los líquenes pueden cambiar de bacterias fotosintéticas dependiendo del clima y región del planeta en donde crezcan. Esto ejemplifica perfectamente cómo funciona la evolución natural bajo los principios neodarwinistas. Sin embargo subyace un compromiso, una negociación, entre dos entidades de vida libre por acceder a un territorio, en este caso el liquen, que no sería posible sin el entendimiento de esas dos partes. ¿Es el territorio una simple presión evolutiva o por el contrario es un concepto con el mismo rango que la competencia?.

En el caso del chino, no existe evolución del ideograma, no existe la competencia entre los distintos cambios y sin embargo el territorio lingüistico existe porque existe la seña de identidad que es el ideograma en si mismo. La negociación de la que hablaba en el caso del liquen, entre el hongo y sus bacterias fotosintéticas, sería una negociación de señas de identidad. Esa negociación entre señas de identidad tuvo que darse entre las distintas moléculas autorreplicantes de la célula primigenia para poder acceder a un nuevo territorio. Estas son obviamente especulaciones del autor del blog sin ningún sustento científico.

En política esa negociación entre señas de identidad se da en todos los órdenes. En este momento estamos trabajando en la construcción europea después de dos devastadoras guerras mundiales. El escudo español es una síntesis entre las distintas entidades políticas previas a la construcción del estado español moderno. ¿No se da en la naturaleza ese tipo de cesión de autonomía?
El escudo español es un resumen de las entidades políticas previas a la formación del estado español: Castilla, León, Aragón, Navarra y el Reino de Granada. Como se ve, todas estas estructuras eran castellano-hablantes.
Posteriormente el mundo ARN produjo moléculas de ADN como soporte de información porque son mucho más estables a la hora de mantener la información. El siguiente paso fue crear otro tipo de moléculas poliméricas mucho más versátiles estructuralmente: las proteínas, que en vez de estar formadas por cuatro elementos, como el ADN y el ARN, lo están formadas por veinte. Los veinte aminoácidos se pueden también ensamblar como las piezas de Lego, pero además, están formadas por elementos que presentan propiedades muy interesante como se hidrofóbicos o hidrofílicos, tener moléculas de azufre que se pueden enlazar con otros aminoácidos que también tengan azufre... y esto permitió que la vida es convirtiese en algo más potente a nivel estructural.

Cuando apareció la primera célula hubo algunas de esas moléculas autorreplicantes egoístas que "decidieron" no prestarse a ese pacto y esas moléculas fueron los primeros virus, que por supuesto, debieron ser virus ARN. Pero esa es otra historia.

viernes, 30 de mayo de 2014

¿Es el olor una seña de identidad que permite explotar un territorio?

http://www.europapress.es/ciencia/habitat-y-clima/noticia-primer-caso-cuatro-especies-conectadas-olor-cadena-alimentaria-20140530142759.html

Un estudio publicado en Frontiers in Ecology and Evolution reporta el primer caso conocido en el que cuatro especies, todas en diferentes niveles de la cadena alimentaria, utilizan un solo olor para comunicarse y explotarlo despiadadamente entre sí.
   Los insectos que se alimentan de las plantas son a menudo atraídos por los olores liberados por el tejido vegetal dañado, debido a que estas plantas ya están bajo ataque y son consideradas un buen lugar para buscar comida, el emparejamiento o poner huevos.
   El pulgón saltador Diaphorina citri es especialmente sensible al olor del salicilato de metilo, liberado por las hojas jóvenes dañadas de los árboles de cítricos, cuya savia es el único alimento de los jóvenes piojos de las plantas. Sin embargo, otras especies han desarrollado la capacidad de tomar ventaja de su atracción por el salicilato de metilo.

Una de ellos es la bacteria Canditatus Liberibacter asiaticus , que infecta a los árboles de cítricos , secuestra su producción de olores, y obliga a que se libere el salicilato de metilo para imitar un ataque de pulgones. Estos piojos de las plantas que vuelan hacia la fuente del olor son engañados: no van a encontrar comida suficiente, ya que la bacteria ha bajado drásticamente la calidad nutricional de las hojas infectadas. Este es un truco que obliga a los piojos a buscar otro árbol, esta vez con la bacteria enganchada a su cuerpo. De este modo , la bacteria puede infectar nuevos árboles de cítricos, lo que provoca la enfermedad de Huanglongbing, incurable y mortal.
   También se relaciona a la avispa Tamarixia radiata , que pone sus huevos entre los jóvenes pulgones, por lo que las larvas de la avispa se alimenta de ellos. Lukasz Stelinski y sus colegas de la Universidad de Florida se preguntaron si la avispa está igualmente atraída por el olor de salicilato de metilo en su búsqueda piojos de las plantas. Colocaron avispas hembra en un olfatómetro, un dispositivo en forma de Y que ofrece dos flujos de aire opuestos, cada uno con un olor diferente. Las avispas tenían la opción de volar hacia el salicilato de metilo o hacia un olor de control como el limoneno, el otro compuesto producido por los árboles de cítricos .
   Las avispas fueron fuertemente atraídas por el olor de las plantas de cítricos infectadas con bacterias y piojos, y también por el salicilato de metilo puro. Otro experimento reveló que las avispas eran más propensas a encontrar y atacar jóvenes pulgones en las plantas infectadas con la bacteria, o en plantas que habían sido tratadas con salicilato de metilo. Esto demuestra que la avispa encuentra a su presa por espionaje en la señal de olor intercambiada entre las bacterias, los árboles de cítricos y los piojos de las plantas.
   "La comunicación entre especies está muy extendida en la naturaleza, pero casi siempre involucra a sólo dos o tres especies. Aquí, se muestra por primera vez que la misma señal conecta a cuatro especies diferentes, cada una con un nivel diferente en la cadena alimentaria", dice Stelinski.