lunes, 11 de noviembre de 2019

¿Qué es la hipótesis del mundo ARN?

Me ha encantado esa comparación de que la célula en el fondo es la casa que protege y sostiene el mundo ARN.
 Introducción a los virus por David Baltimore, ¡Si, el autor de la clasificación Baltimore de los virus!

El sistema Baltimore divide los virus en siete grupos. Puedes ver las características básicas de cada grupo, entre ellas, su material genético y la vía que usa para fabricar ARNm, en el siguiente diagrama: Flecha verde = síntesis de un ARNm; flecha verde punteada = uso directo del genoma viral como un ARNm. Imagen modificada de "La clasificación de grupos de virus de Baltimore en familias depende de su tipo de genoma, por ViralZone/Swiss Institute of Bioinformatics, CC BY-NC 4,0.

Las ribozimas, junto con los viroides, son considerados reliquias vivas del mundo de ARN y caracterizaron la primera fase del mundo de ARN. Posteriormente las ribozimas y viroides darían lugar a moléculas de ARN capaces de sintetizar proteínas como los ribosomas, a los retroelementos como la transcriptasa inversa y a las moléculas de ADN. Estas moléculas al rodearse con liposomas formados espontáneamente originarían los protobiontes y estos por último a las células modernas.
Código genético y la relación clonal entre los distinto códones. Fuente
. Fuente



PREGUNTA: Tenemos un ORF:  ATGTATGGATACGCCTCTTCGGAGGGCAACTTAGAATAA
y a partir de esta secuencia tenemos una descendencia en la que se pueden observar tres mutantes:
Mutante 1:
ATGAATGGATACGCCTCTTCGGAGGGCAACTAGAATAA
Mutante 2:
ATGTACGGGTACGCATCGTCGGAGGGAAATTAGAATAA
Mutante 3:
ATGATATGGATACGCCTCTTCGGAGGGCAACTAGAATAA

¿Cuál de los mutantes tendrá más mutaciones? ¿Cuál de los mutantes será el que tenga menos? ¿Cómo afectarán esas mutaciones a la proteína resultante? Para ello traduce cada triplete utilizando la tabla 

SOLUCIÓN:
ORF: ATG TAT GGA TAC GCC TCT TCG GAG GGC AAC TAG AAT AA

1      ATG AAT GGA TAC GCC TCT TCG GAG GGC AAC TAG AAT AA

2      ATG TAC GGG TAC GCA TCG TCG GAG GGA AAT TAG AAT AA

3      ATG ATA TGG ATA CGC CTC TTC GGA GGG CAA CTA GAA TAA

PREGUNTA: Cuando no existían bacterias toda la vida sobre la Tierra era vírica. Eran protovirus de ARN que tenían ribosomas. Estos virus se replicaban en la sopa biológica (en Ecuador en el locro biológico). Cuando aparecieron las bacterias, éstas tenían una membrana que diferenciaba fuera de dentro. Las bacterias metieron dentro todo lo que les interesaba de la sopa biológica. Los protovirus al quedarse sin su alimento sufrieron una presión selectiva que favoreció a aquellos virus que sabían como penetrar en el interior de las bacterias y alimentarse de lo que antaño había sido suyo. Nacieron los virus como entidades parásitas de las células. Muchos biólogos siguen diciendo, de forma equivocada, que los virus no son entidades vivas porque se tienen que alimentar de una célula metabólicamente activa. Si es por eso, podríamos incluir en la categoría de virus a muchas personas que no son capaces de subsistir sin su tarjeta de crédito. ¿Cómo perdieron los protovirus sus ribosomas? porque hoy en día los virus actuales no tienen ribosomas. Como siempre la solución está en la selección natural. Imaginemos dos virus A y B. El virus A es un protovirus, tiene ribosomas, y su ARN tiene 60.000 bases. El virus B perdió los genes de los ribosomas y por esa razón tienen 40.000 bases. No necesita codificar ribosomas porque puede utilizar los de la bacteria que infecta. Ambos virus infectan y se replican en el interior de bacterias. Si la ARN polimerasa copia a una velocidad de 1000 bases por minuto y los cromosomas de A y B tienen un solo Ori. ¿Cuánto tiempo tarda cada virus en replicarse? ¿Cuánta descendencia tendrá cada virus al cabo de seis horas?

SOLUCIÓN: Virus A 30 minutos virus B 20 minutos. En seis horas tendremos de A  4096 virus, y de B tendremos 262144 virus. Si en vez de horas hablásemos de miles de años podemos entender porqué los virus actuales carecen de ribosomas.

PREGUNTA: ¿Qué fue antes el huevo o la gallina? ¿Qué proceso ocurrió antes en la evolución, el paso de ADN a ARN o el paso de ARN a proteínas? 

sábado, 9 de noviembre de 2019

Veintidós niños huérfanos coruñeses llevaron la vacuna por todo el mundo

El descubrimiento de la vacuna por Edward Jenner se publica en el año 1800. En 1803 sale de A Coruña una goleta con 22 niños huérfanos. A uno de esos niños se le ha inoculado el virus de la viruela de vaca, que protege a los humanos de la mortal viruela humana. Cuando a este niño le salen unas pequeñas pústulas, la única manifestación del virus de la vaca, los médicos pinchan la pústula y se la inoculan a otro niño. De esa manera, la Expedición Balmís, lleva el virus de la vaca, la vacuna, viva desde A Coruña a América. En Quito, la población se vacunó de manera masiva en 1805. Todavía no hay en la ciudad de Quito una calle, o un monumento que mencione esta gesta.
Fuente
Para saber más, pinchad aquí. Se trata de un artículo excelente de Laura Garofano publicado en el Mundo.



viernes, 8 de noviembre de 2019

Si soy capaz de transmitirme seré un parásito exitoso

El que vive a expensas de otros debe transmitirse una vez que ha agotado a su presa. La transmisión es una de las características de los patógenos. Pueden transmitirse por el agua, por el aire, o a través de animales hematófagos (se alimentan de sangre). Son los vectores, organismos vivos que pueden transmitir enfermedades infecciosas entre personas, o de animales a personas:

Las seis estructuras chupadoras de un mosquito buscando un capilar sanguíneo
Mosquitos. Los mosquitos han cambiado la historia de la humanidad, especialmente los géneros Aedes, Anopheles y Culex
Flebótomos, su picadura es el medio de transmisión de la leishmaniasis, de la bartonelosis y de algunas infecciones por arbovirus.
Las garrapatas transmiten encefalitis; enfermedad de Lyme; fiebre hemorrágica de Crimea-Congo; fiebre recurrente (borreliosis); ricketsiosis (fiebre maculosa y fiebre Q) y tularemia. Fuente
Triatominos: enfermedad de Chagas (tripanosomiasis americana). Fuente
Mosca tsetsé: enfermedad del sueño (tripanosomiasis africana). Fuente
Pulgas: peste (transmitidas por pulgas de las ratas al ser humano) y rickettsiosis. Fuente
Moscas negras: oncocercosis (ceguera de los ríos). Fuente
Caracoles acuáticos: esquistosomiasis (bilharziasis). Fuente
Piojos: tifus y fiebre recurrente transmitida por piojos. Fuente

miércoles, 6 de noviembre de 2019

¿Por qué los holandeses son tan altos?

Campesinos holandeses comiendo papas. Litografía de Van Gogh. Museo Thyssen, Madrid. Fotografía del autor del blog
PROBLEMA: Los holandeses en 1860 eran, como colectivo, de los más bajos de Europa. Ello era debido a que tenían una dieta pobre, basada en las papas y el maiz, y bebían agua contaminada. Holanda, como país, tiene gran parte de su territorio por debajo del nivel del mar. Gracias a unos diques, los polders, evitan que el mar inunde estas áreas. Por ese motivo, la capa freática se encuentra muy superficial. Como siempre ha tenido una cabaña ganadera muy importante, especialmente vacas, acordaros de sus famosos quesos, el agua en el siglo XIX se encontraba contaminada. Cuando variaron su dieta y empezaron a purificar el agua la altura de los holandeses pasó de 1.64 cm de media a 1.84 cm ¡Un aumento de 20 cm! SOLUCIÓN: una dieta variada y sobre todo, beber agua potable, hizo que aumentasen de tamaño



John Snow establece una relación epidemiológica entre el agua contaminada de heces y los brotes de cólera
En 1854 John Snow demuestra que el agua contaminada es el agente propagador de la cólera en Londres. En la fotografía, una de las bombas que se empleaban en el S XIX para proporcionar agua a la población
John Snow hizo un rastreo de las familias que presentaban casos de cólera y se dió cuenta que todas vivían alrededor de algunas bombas de agua. Curiosamente todas esas bombas pertenecían a la red de una empresa de suministro de aguas que tomaba el agua del Támesis, pero en vez de tomarla río arriba, tomaba el agua río abajo, cuando ya había sido contaminado con las heces de los habitantes de esta ciudad, muchos de ellos con cólera, con lo que se establecía un ciclo de contaminación fecal-oral.
John Snow, padre de la epidemiología moderna, cartografía los brotes de cólera y descubre que todos están asociados con bombas de agua contaminada con heces. En esa época no estaba claro el origen de las enfermedades infecciosas y muchos pensaban que las enfermedades las producían emanaciones de sitios pantanosos.
Fuente
En este gráfico se puede ver la evolución de las muertes causadas por agentes infecciosos por cada 100.000 habitantes en los USA durante el siglo XX. Alrededor de 1910 se implementó la cloración del agua en las ciudades de los EEUU. Se puede ver el impacto de esta medida en la drástica reducción de muertes por enfermedades infecciosas.

La higiene corta la transmisión fecal-oral

Eugenio Espejo, Ignacio Semmelweis, Joseph Lister... fueron pioneros en introducir la idea de que para parar las infecciones había que impedir la transmisión del agente causante de la infección. La vía de contaminación fecal-oral es la más habitual. Es decir, la que va desde las heces de personas o de mamíferos a la boca de otros seres humanos.
En el Ecuador se pueden observar filtros de piedra volcánica en casas y museos. El filtro funciona como un cedazo que impide que la bacteria o el parásito atraviese el filtro con lo que se interrumpe la vía de transmisión.

En Quito, la actual calle Guayaquil, se llamaba churretas, porque era una escorrentía de las churretas de porquería de la ciudad hacia la quebrada 24 de mayo. En tiempos de Eugenio Espejo, la ciudad de Quito, carecía de alcantarillado. De manera muy sagaz, el Dr. Espejo, intuyó que las personas contraían enfermedades de solo caminar por esas calles inmundas.
Filtro volcánico de piedra. Museo Casa del General Sucre en Quito
En Ecuador, se pueden observar filtros de piedra volcánica en la Casa del General Sucre en Quito. La existencia de estos filtros hablan de una comunidad preocupada por la limpieza y pureza del agua. Si tenemos en cuenta que el General Sucre compra su casa en 1828 y que en 1854 John Snow demuestra que el agua contaminada es el agente propagador de la cólera en Londres y que en 1860 es cuando Luis Pasteur establece la teoría microbiana de la enfermedad, estamos hablando de unas gentes que ya se preocupaban de la higiene.

Para saber más:
https://www.huffpost.com/entry/why-are-the-dutch-so-tall_b_5544085

miércoles, 23 de octubre de 2019

Si los problemas generan valor deben ser mantenidos

Un amigo psicólogo lee la noticia: La resistencia a antibióticos se duplicará en 20 años, y se acordó de mi. Las noticias de calamidades no cuentan que uno de los factores de este problema es que, en nuestro sistema económico, las calamidades generan beneficio, y por tanto convienen. El escritor Phillip K. Dick ya intuyó en una de sus obras esta paradoja.

En el Decámeron, Bocaccio, ya hablaba de la imposibilidad de escapar de la peste en 1353. Pandemias víricas, bacterias resistentes a los antibióticos, pérdidas de ganado por enfermedades contagiosas... son problemas que deben tratarse de manera multidisciplinar. Pero quizás haya quien con estos problemas esté ganando dinero. Si es así, estas personas y estos intereses deberían ser considerados también parte del problema.  
De los cuatro Jinetes de la Apocalisis, el cuarto representa a la peste, es decir, las pandemias capaces de segar las vidas de una tercera parte de la población. Las enfermedades infecciosas siempre han estado en el imaginario humano

El concepto One Health es una estrategia para aumentar la comunicación y la colaboración interdisciplinar en el cuidado de la salud de las personas, los animales y el medio ambiente, a nivel mundial, entendiendo que todas están ligadas entre sí. Surge la Iniciativa One Health de la mano de dos médicos, Laura H. Kahn y Thomas P. Monath, y un veterinario, Bruce Kaplan, en 2006. Esta iniciativa ha ido incluyendo posteriormente a más investigadores del ámbito de la salud, médicos y veterinarios expertos en salud pública a nivel mundial. Quizás habría que incluir también a economistas si el problema es también un problema de intereses económicos.
La producción industrial de carne es para los microorganismos un nicho ecológico fantástico en donde transmitirse sin problema

Donde hay escasez hay beneficio

El escritor de ciencia ficción, Phillip K. Dick, ha sido llevado a las pantallas en al menos 12 de sus obras. El mérito de este autor no es literario porque escribe bastante mal, de forma deslavazada, sin demasiado cuidado. Sin embargo, de repente, es capaz de crear páginas icónicas como el famoso: "Yo he visto cosas que ustedes no creerían. Naves de ataque en llamas..." en donde se plasma la adquisición del alma por un replicante, un producto de la ingeniería genética.

En su novela Podemos recordarlo todo para usted que originó la película "Total recall" describe como, en Marte, las autoridades conocen la existencia de una máquina de origen extraterrestre capaz de generar oxígeno suficiente para crear una atmósfera como la de la Tierra. Sin embargo, las autoridades mantienen esa fábrica cerrada y en secreto porque la mejor manera de mantener a los habitantes humanos de Marte controlados es con el suministro limitado de oxígeno. Phillip K. Dick nos muestra, con la inquebrantable fe del visionario, que el capitalismo no busca solucionar problemas, sino que los problemas, si generan valor, son bienvenidos.
Venky: familias felices comiendo pollo y bacterias resistentes a la colistina, un antibiótico utilizado contra las bacterias multirresistentes. O te mueres de hambre o te mueres de una bacteria multirresistente ¿Debemos elegir entre esta alternativa?

La estrategia one health no logrará éxito si no se tiene este factor en cuenta. En este blog ya hablamos de la empresa india Venky. Una empresa que es la mayor productora de carne de pollo en la India y que a su vez es también productora de antibióticos, algunos de ellos como la colistina, la última barrera antibiótica frente a ciertas bacterias resistentes. ¿De qué sirve investigar cepas bacterianas con resistencia a la colistina si se puede comprar este antibiótico por kg en internet? Si se usa un antibiótico de manera masiva se van a seleccionar bacterias mutantes con modificaciones en los fosfatos del lípido A y por tanto indiferentes a la acción letal de este producto. Esto hará que algún otro antibiótico suba su precio. El problema ha sido originado por la avaricia de un productor sin escrúpulos. La aparición de bacterias mutantes hará que este nuevo antibiótico se vuelva ineficaz y de nuevo habrá que migrar hacia otro. La situación es la óptica para un sistema que siempre busca excluir a la competencia. Es una realidad que parece ideal para el comportamiento del sistema económico en el que nos encontramos

viernes, 11 de octubre de 2019

Como limpiarse bien el culo

Es muy importante, sobre todo para las chicas,  limpiarlo de adelante hacia atrás. Hacerlo en sentido contrario es uno de los principales factores de riesgo de infecciones de orina.
 La flora intestina aerobia, los llamados coliformes, como Escherichia coli, Klebsiella, Enterobacter, son los principales productores de infecciones del tracto urinario, siendo E. coli responsable del 80% de estas infecciones.
Además de diarreas por bacterias existe la probabilidad de que se infecten por protozoos o por gusanos parásitos.